MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA2

Total Repeats: 36

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017807	AAATC	2	10	1004	1013	60 %	20 %	0 %	20 %	386844949
2	NC_017807	GCCGC	2	10	1358	1367	0 %	0 %	40 %	60 %	386844949
3	NC_017807	GTTTT	2	10	2812	2821	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017807	CCAAA	2	10	3148	3157	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_017807	CCGTG	2	10	6610	6619	0 %	20 %	40 %	40 %	386844957
6	NC_017807	CAAAA	2	10	6916	6925	80 %	0 %	0 %	20 %	386844958
7	NC_017807	CCGGC	2	10	7124	7133	0 %	0 %	40 %	60 %	386844958
8	NC_017807	GGGCA	2	10	7183	7192	20 %	0 %	60 %	20 %	386844958
9	NC_017807	ACTGC	2	10	9942	9951	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_017807	CGCTG	2	10	11998	12007	0 %	20 %	40 %	40 %	386844964
11	NC_017807	GGGCG	2	10	14751	14760	0 %	0 %	80 %	20 %	386844968
12	NC_017807	GGCTG	2	10	15577	15586	0 %	20 %	60 %	20 %	386844969
13	NC_017807	CCTTA	2	10	15643	15652	20 %	40 %	0 %	40 %	386844969
14	NC_017807	GGACT	2	10	19993	20002	20 %	20 %	40 %	20 %	386844974
15	NC_017807	TGCTC	2	10	20096	20105	0 %	40 %	20 %	40 %	386844974
16	NC_017807	GGCTG	2	10	20233	20242	0 %	20 %	60 %	20 %	386844975
17	NC_017807	CTTTT	2	10	20692	20701	0 %	80 %	0 %	20 %	386844977
18	NC_017807	GCCAC	2	10	21142	21151	20 %	0 %	20 %	60 %	386844977
19	NC_017807	TCCCT	2	10	22088	22097	0 %	40 %	0 %	60 %	386844979
20	NC_017807	CTGAA	2	10	22238	22247	40 %	20 %	20 %	20 %	386844979
21	NC_017807	AGTAA	2	10	23957	23966	60 %	20 %	20 %	0 %	386844980
22	NC_017807	TGGAC	2	10	25551	25560	20 %	20 %	40 %	20 %	386844980
23	NC_017807	ACGTC	2	10	27468	27477	20 %	20 %	20 %	40 %	386844982
24	NC_017807	GAACA	2	10	31183	31192	60 %	0 %	20 %	20 %	386844984
25	NC_017807	GCCAG	2	10	34165	34174	20 %	0 %	40 %	40 %	386844985
26	NC_017807	GGGCC	2	10	34892	34901	0 %	0 %	60 %	40 %	386844985
27	NC_017807	GCGCG	2	10	36856	36865	0 %	0 %	60 %	40 %	386844985
28	NC_017807	ACCTG	2	10	38080	38089	20 %	20 %	20 %	40 %	386844987
29	NC_017807	ACCTG	2	10	38641	38650	20 %	20 %	20 %	40 %	386844988
30	NC_017807	CTTCA	2	10	39339	39348	20 %	40 %	0 %	40 %	386844989
31	NC_017807	GATTT	2	10	40839	40848	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017807	GTTTT	2	10	43017	43026	0 %	80 %	20 %	0 %	386844992
33	NC_017807	TTAAA	2	10	45712	45721	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017807	TATTT	2	10	45829	45838	20 %	80 %	0 %	0 %	386844994
35	NC_017807	TAAAA	2	10	46194	46203	80 %	20 %	0 %	0 %	386844994
36	NC_017807	AAATA	2	10	46921	46930	80 %	20 %	0 %	0 %	386844995

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.