MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA2

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017807	GT	3	6	1695	1700	0 %	50 %	50 %	0 %	386844950
2	NC_017807	AC	3	6	1876	1881	50 %	0 %	0 %	50 %	386844950
3	NC_017807	TG	3	6	2139	2144	0 %	50 %	50 %	0 %	386844951
4	NC_017807	AT	4	8	2159	2166	50 %	50 %	0 %	0 %	386844951
5	NC_017807	CG	3	6	3971	3976	0 %	0 %	50 %	50 %	386844953
6	NC_017807	CT	3	6	5809	5814	0 %	50 %	0 %	50 %	386844956
7	NC_017807	CT	3	6	6265	6270	0 %	50 %	0 %	50 %	386844957
8	NC_017807	CG	3	6	6456	6461	0 %	0 %	50 %	50 %	386844957
9	NC_017807	GT	4	8	6751	6758	0 %	50 %	50 %	0 %	386844958
10	NC_017807	CT	3	6	7687	7692	0 %	50 %	0 %	50 %	386844958
11	NC_017807	AC	3	6	9550	9555	50 %	0 %	0 %	50 %	386844962
12	NC_017807	CT	4	8	10369	10376	0 %	50 %	0 %	50 %	386844963
13	NC_017807	CA	3	6	12896	12901	50 %	0 %	0 %	50 %	386844964
14	NC_017807	CG	3	6	13186	13191	0 %	0 %	50 %	50 %	386844964
15	NC_017807	GT	3	6	13489	13494	0 %	50 %	50 %	0 %	386844965
16	NC_017807	GT	3	6	14667	14672	0 %	50 %	50 %	0 %	386844967
17	NC_017807	CA	3	6	14889	14894	50 %	0 %	0 %	50 %	386844968
18	NC_017807	TG	3	6	15736	15741	0 %	50 %	50 %	0 %	386844970
19	NC_017807	CG	3	6	15909	15914	0 %	0 %	50 %	50 %	386844970
20	NC_017807	GC	3	6	16674	16679	0 %	0 %	50 %	50 %	386844971
21	NC_017807	TG	3	6	17282	17287	0 %	50 %	50 %	0 %	386844972
22	NC_017807	GA	3	6	18005	18010	50 %	0 %	50 %	0 %	386844972
23	NC_017807	TG	3	6	18664	18669	0 %	50 %	50 %	0 %	386844972
24	NC_017807	TC	4	8	20291	20298	0 %	50 %	0 %	50 %	386844975
25	NC_017807	GC	3	6	20642	20647	0 %	0 %	50 %	50 %	386844976
26	NC_017807	GC	3	6	20818	20823	0 %	0 %	50 %	50 %	386844977
27	NC_017807	CG	3	6	23382	23387	0 %	0 %	50 %	50 %	386844980
28	NC_017807	GC	3	6	25349	25354	0 %	0 %	50 %	50 %	386844980
29	NC_017807	CG	3	6	25612	25617	0 %	0 %	50 %	50 %	386844980
30	NC_017807	AC	3	6	25698	25703	50 %	0 %	0 %	50 %	386844980
31	NC_017807	GA	4	8	26117	26124	50 %	0 %	50 %	0 %	386844980
32	NC_017807	AT	3	6	26523	26528	50 %	50 %	0 %	0 %	386844981
33	NC_017807	CG	3	6	27855	27860	0 %	0 %	50 %	50 %	386844982
34	NC_017807	GT	3	6	29011	29016	0 %	50 %	50 %	0 %	386844984
35	NC_017807	TC	3	6	29085	29090	0 %	50 %	0 %	50 %	386844984
36	NC_017807	AC	3	6	30791	30796	50 %	0 %	0 %	50 %	386844984
37	NC_017807	CA	3	6	30866	30871	50 %	0 %	0 %	50 %	386844984
38	NC_017807	GC	3	6	30944	30949	0 %	0 %	50 %	50 %	386844984
39	NC_017807	CG	3	6	31165	31170	0 %	0 %	50 %	50 %	386844984
40	NC_017807	TC	3	6	33149	33154	0 %	50 %	0 %	50 %	386844985
41	NC_017807	CG	3	6	34701	34706	0 %	0 %	50 %	50 %	386844985
42	NC_017807	GA	3	6	35088	35093	50 %	0 %	50 %	0 %	386844985
43	NC_017807	GC	3	6	35856	35861	0 %	0 %	50 %	50 %	386844985
44	NC_017807	GA	3	6	36583	36588	50 %	0 %	50 %	0 %	386844985
45	NC_017807	GT	3	6	37998	38003	0 %	50 %	50 %	0 %	386844987
46	NC_017807	GT	3	6	38134	38139	0 %	50 %	50 %	0 %	386844987
47	NC_017807	GC	3	6	38292	38297	0 %	0 %	50 %	50 %	386844988
48	NC_017807	GC	3	6	39792	39797	0 %	0 %	50 %	50 %	386844989
49	NC_017807	TG	3	6	42745	42750	0 %	50 %	50 %	0 %	386844991
50	NC_017807	CG	3	6	43092	43097	0 %	0 %	50 %	50 %	386844992
51	NC_017807	GC	3	6	43716	43721	0 %	0 %	50 %	50 %	386844992
52	NC_017807	TA	3	6	45203	45208	50 %	50 %	0 %	0 %	386844993
53	NC_017807	AT	3	6	45228	45233	50 %	50 %	0 %	0 %	386844993
54	NC_017807	GT	3	6	47235	47240	0 %	50 %	50 %	0 %	386844995
55	NC_017807	CA	4	8	47343	47350	50 %	0 %	0 %	50 %	386844995
56	NC_017807	AT	3	6	47738	47743	50 %	50 %	0 %	0 %	386844995
57	NC_017807	AT	3	6	48106	48111	50 %	50 %	0 %	0 %	386844996
58	NC_017807	CA	3	6	48118	48123	50 %	0 %	0 %	50 %	386844996

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.