MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Deinococcus gobiensis I-0 plasmid P5

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017806	ACGCC	2	10	744	753	20 %	0 %	20 %	60 %	386855129
2	NC_017806	GACCT	2	10	2349	2358	20 %	20 %	20 %	40 %	386855132
3	NC_017806	CCACC	2	10	2473	2482	20 %	0 %	0 %	80 %	386855132
4	NC_017806	AGCAC	2	10	4076	4085	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_017806	GCCCC	2	10	4115	4124	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
6	NC_017806	TGCGG	2	10	7800	7809	0 %	20 %	60 %	20 %	386855141
7	NC_017806	GCTCA	2	10	7975	7984	20 %	20 %	20 %	40 %	386855141
8	NC_017806	GTCCC	2	10	8884	8893	0 %	20 %	20 %	60 %	386855142
9	NC_017806	AGCCA	2	10	9183	9192	40 %	0 %	20 %	40 %	386855143
10	NC_017806	AGCGT	2	10	9520	9529	20 %	20 %	40 %	20 %	386855143
11	NC_017806	CCACC	2	10	9691	9700	20 %	0 %	0 %	80 %	386855144
12	NC_017806	CGGCG	2	10	10662	10671	0 %	0 %	60 %	40 %	386855145
13	NC_017806	CGGCG	2	10	11608	11617	0 %	0 %	60 %	40 %	386855146
14	NC_017806	TCACG	2	10	11680	11689	20 %	20 %	20 %	40 %	386855146
15	NC_017806	GGGGC	2	10	12180	12189	0 %	0 %	80 %	20 %	386855147
16	NC_017806	CGCGG	2	10	12261	12270	0 %	0 %	60 %	40 %	386855147
17	NC_017806	CCGCC	2	10	12724	12733	0 %	0 %	20 %	80 %	386855147
18	NC_017806	CACGG	2	10	13186	13195	20 %	0 %	40 %	40 %	386855147
19	NC_017806	CTGCG	2	10	13204	13213	0 %	20 %	40 %	40 %	386855147
20	NC_017806	GGCCG	2	10	13409	13418	0 %	0 %	60 %	40 %	386855147
21	NC_017806	GGGCC	2	10	14769	14778	0 %	0 %	60 %	40 %	386855148
22	NC_017806	TAGCC	2	10	15748	15757	20 %	20 %	20 %	40 %	386855149
23	NC_017806	CGGCT	2	10	17239	17248	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_017806	GCACG	2	10	17650	17659	20 %	0 %	40 %	40 %	386855151
25	NC_017806	CGCGG	2	10	18139	18148	0 %	0 %	60 %	40 %	386855151
26	NC_017806	CCCTA	2	10	19468	19477	20 %	20 %	0 %	60 %	386855151
27	NC_017806	GTCTA	2	10	20208	20217	20 %	40 %	20 %	20 %	386855151
28	NC_017806	CACCC	2	10	21411	21420	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
29	NC_017806	GGACC	2	10	22558	22567	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_017806	GCACC	2	10	23800	23809	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
31	NC_017806	CGGCG	2	10	24701	24710	0 %	0 %	60 %	40 %	386855157
32	NC_017806	CTGAG	2	10	26975	26984	20 %	20 %	40 %	20 %	386855159
33	NC_017806	TGACC	2	10	27545	27554	20 %	20 %	20 %	40 %	386855160
34	NC_017806	CGCTG	2	10	28382	28391	0 %	20 %	40 %	40 %	386855161
35	NC_017806	GGCCC	2	10	30150	30159	0 %	0 %	40 %	60 %	386855163
36	NC_017806	GCTCA	2	10	34579	34588	20 %	20 %	20 %	40 %	386855172
37	NC_017806	GCCGC	2	10	35303	35312	0 %	0 %	40 %	60 %	386855172
38	NC_017806	CGAGG	2	10	36754	36763	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017806	GGGCG	2	10	43075	43084	0 %	0 %	80 %	20 %	386855189
40	NC_017806	TATCT	2	10	45711	45720	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017806	AGAGC	2	10	47083	47092	40 %	0 %	40 %	20 %	386855196
42	NC_017806	CTATT	2	10	47555	47564	20 %	60 %	0 %	20 %	386855197
43	NC_017806	AGCGC	2	10	49031	49040	20 %	0 %	40 %	40 %	386855198
44	NC_017806	CCGTT	2	10	49348	49357	0 %	40 %	20 %	40 %	386855198
45	NC_017806	TGATC	2	10	50549	50558	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017806	ACGCC	2	10	54526	54535	20 %	0 %	20 %	60 %	386855207

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.