MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Deinococcus gobiensis I-0 plasmid P5

Total Repeats: 92

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017806	ACCC	2	8	818	825	25 %	0 %	0 %	75 %	386855130
2	NC_017806	GCGG	2	8	872	879	0 %	0 %	75 %	25 %	386855130
3	NC_017806	GACC	2	8	976	983	25 %	0 %	25 %	50 %	386855130
4	NC_017806	AGGG	2	8	1198	1205	25 %	0 %	75 %	0 %	386855130
5	NC_017806	CGCC	2	8	1273	1280	0 %	0 %	25 %	75 %	386855130
6	NC_017806	GTGC	2	8	1503	1510	0 %	25 %	50 %	25 %	386855130
7	NC_017806	GTCA	2	8	1613	1620	25 %	25 %	25 %	25 %	386855130
8	NC_017806	AGCG	2	8	2340	2347	25 %	0 %	50 %	25 %	386855132
9	NC_017806	GGCT	2	8	2664	2671	0 %	25 %	50 %	25 %	386855132
10	NC_017806	GCGT	2	8	3155	3162	0 %	25 %	50 %	25 %	386855133
11	NC_017806	CGGG	2	8	3732	3739	0 %	0 %	75 %	25 %	386855134
12	NC_017806	AATG	2	8	4219	4226	50 %	25 %	25 %	0 %	386855136
13	NC_017806	GCCA	2	8	4577	4584	25 %	0 %	25 %	50 %	386855137
14	NC_017806	CGGC	2	8	4944	4951	0 %	0 %	50 %	50 %	386855137
15	NC_017806	GGGC	2	8	5153	5160	0 %	0 %	75 %	25 %	386855137
16	NC_017806	GGGC	2	8	5621	5628	0 %	0 %	75 %	25 %	386855138
17	NC_017806	GCGG	2	8	7271	7278	0 %	0 %	75 %	25 %	386855140
18	NC_017806	CAGC	2	8	7966	7973	25 %	0 %	25 %	50 %	386855141
19	NC_017806	ACGC	2	8	8187	8194	25 %	0 %	25 %	50 %	386855142
20	NC_017806	GTAG	2	8	8239	8246	25 %	25 %	50 %	0 %	386855142
21	NC_017806	TGCG	2	8	8352	8359	0 %	25 %	50 %	25 %	386855142
22	NC_017806	CACC	2	8	8693	8700	25 %	0 %	0 %	75 %	386855142
23	NC_017806	TGAC	2	8	8746	8753	25 %	25 %	25 %	25 %	386855142
24	NC_017806	GATA	2	8	10037	10044	50 %	25 %	25 %	0 %	386855144
25	NC_017806	CCGG	2	8	10125	10132	0 %	0 %	50 %	50 %	386855144
26	NC_017806	TTGG	2	8	10229	10236	0 %	50 %	50 %	0 %	386855144
27	NC_017806	CAGC	2	8	10502	10509	25 %	0 %	25 %	50 %	386855145
28	NC_017806	CAGC	2	8	10946	10953	25 %	0 %	25 %	50 %	386855145
29	NC_017806	CTCA	2	8	11082	11089	25 %	25 %	0 %	50 %	386855145
30	NC_017806	GCGA	2	8	11262	11269	25 %	0 %	50 %	25 %	386855145
31	NC_017806	TGCA	2	8	11723	11730	25 %	25 %	25 %	25 %	386855146
32	NC_017806	GCCA	2	8	12006	12013	25 %	0 %	25 %	50 %	386855146
33	NC_017806	AGCG	2	8	12045	12052	25 %	0 %	50 %	25 %	386855146
34	NC_017806	CCCA	2	8	13327	13334	25 %	0 %	0 %	75 %	386855147
35	NC_017806	GTGG	2	8	13838	13845	0 %	25 %	75 %	0 %	386855147
36	NC_017806	CCAG	2	8	15181	15188	25 %	0 %	25 %	50 %	386855149
37	NC_017806	CAGC	2	8	15266	15273	25 %	0 %	25 %	50 %	386855149
38	NC_017806	CCGG	2	8	15951	15958	0 %	0 %	50 %	50 %	386855149
39	NC_017806	GCAG	2	8	15962	15969	25 %	0 %	50 %	25 %	386855149
40	NC_017806	GCTG	2	8	17391	17398	0 %	25 %	50 %	25 %	386855151
41	NC_017806	AGCC	2	8	17560	17567	25 %	0 %	25 %	50 %	386855151
42	NC_017806	GAAC	2	8	17830	17837	50 %	0 %	25 %	25 %	386855151
43	NC_017806	GCCC	2	8	18196	18203	0 %	0 %	25 %	75 %	386855151
44	NC_017806	GCGG	2	8	18274	18281	0 %	0 %	75 %	25 %	386855151
45	NC_017806	ACCC	2	8	18310	18317	25 %	0 %	0 %	75 %	386855151
46	NC_017806	GCCC	2	8	18482	18489	0 %	0 %	25 %	75 %	386855151
47	NC_017806	GACG	2	8	19669	19676	25 %	0 %	50 %	25 %	386855151
48	NC_017806	CCGG	2	8	23540	23547	0 %	0 %	50 %	50 %	386855156
49	NC_017806	GTCC	2	8	27447	27454	0 %	25 %	25 %	50 %	386855160
50	NC_017806	GACC	2	8	27719	27726	25 %	0 %	25 %	50 %	386855160
51	NC_017806	GCTG	2	8	28081	28088	0 %	25 %	50 %	25 %	386855160
52	NC_017806	GCCT	2	8	28403	28410	0 %	25 %	25 %	50 %	386855161
53	NC_017806	GGCA	2	8	29851	29858	25 %	0 %	50 %	25 %	386855163
54	NC_017806	CTGT	2	8	31583	31590	0 %	50 %	25 %	25 %	386855166
55	NC_017806	TCTG	2	8	31591	31598	0 %	50 %	25 %	25 %	386855166
56	NC_017806	CCCG	2	8	31834	31841	0 %	0 %	25 %	75 %	386855167
57	NC_017806	CTTC	2	8	32751	32758	0 %	50 %	0 %	50 %	386855168
58	NC_017806	CCCG	2	8	32878	32885	0 %	0 %	25 %	75 %	386855168
59	NC_017806	CGAT	2	8	34221	34228	25 %	25 %	25 %	25 %	386855171
60	NC_017806	CCCG	2	8	35002	35009	0 %	0 %	25 %	75 %	386855172
61	NC_017806	TCCA	2	8	35173	35180	25 %	25 %	0 %	50 %	386855172
62	NC_017806	GTTC	2	8	35340	35347	0 %	50 %	25 %	25 %	386855172
63	NC_017806	CTGG	2	8	35885	35892	0 %	25 %	50 %	25 %	386855172
64	NC_017806	GCAG	2	8	36826	36833	25 %	0 %	50 %	25 %	386855174
65	NC_017806	GTCT	2	8	36900	36907	0 %	50 %	25 %	25 %	386855174
66	NC_017806	CCGC	2	8	37141	37148	0 %	0 %	25 %	75 %	386855175
67	NC_017806	CACC	2	8	37195	37202	25 %	0 %	0 %	75 %	386855175
68	NC_017806	ACGG	2	8	37635	37642	25 %	0 %	50 %	25 %	386855177
69	NC_017806	CCGG	2	8	37997	38004	0 %	0 %	50 %	50 %	386855178
70	NC_017806	CAGG	2	8	38326	38333	25 %	0 %	50 %	25 %	386855179
71	NC_017806	CAGG	2	8	38403	38410	25 %	0 %	50 %	25 %	386855180
72	NC_017806	CAGC	2	8	38881	38888	25 %	0 %	25 %	50 %	386855181
73	NC_017806	TATC	2	8	40058	40065	25 %	50 %	0 %	25 %	386855184
74	NC_017806	TCTT	2	8	40679	40686	0 %	75 %	0 %	25 %	386855184
75	NC_017806	TCTA	2	8	40842	40849	25 %	50 %	0 %	25 %	386855184
76	NC_017806	ATGT	2	8	40893	40900	25 %	50 %	25 %	0 %	386855185
77	NC_017806	GTGC	2	8	42174	42181	0 %	25 %	50 %	25 %	386855187
78	NC_017806	GACC	2	8	42940	42947	25 %	0 %	25 %	50 %	386855189
79	NC_017806	AGTG	2	8	43600	43607	25 %	25 %	50 %	0 %	386855191
80	NC_017806	CGGG	2	8	44015	44022	0 %	0 %	75 %	25 %	386855192
81	NC_017806	CTTG	2	8	44439	44446	0 %	50 %	25 %	25 %	386855193
82	NC_017806	CATG	2	8	46221	46228	25 %	25 %	25 %	25 %	386855195
83	NC_017806	CTGA	2	8	46349	46356	25 %	25 %	25 %	25 %	386855195
84	NC_017806	CGAC	2	8	48271	48278	25 %	0 %	25 %	50 %	386855198
85	NC_017806	GCTG	2	8	48943	48950	0 %	25 %	50 %	25 %	386855198
86	NC_017806	TCAT	2	8	49111	49118	25 %	50 %	0 %	25 %	386855198
87	NC_017806	CACC	2	8	49209	49216	25 %	0 %	0 %	75 %	386855198
88	NC_017806	GCTG	2	8	50319	50326	0 %	25 %	50 %	25 %	386855198
89	NC_017806	CCCT	2	8	51726	51733	0 %	25 %	0 %	75 %	386855201
90	NC_017806	GGAA	2	8	52084	52091	50 %	0 %	50 %	0 %	386855202
91	NC_017806	GAGC	2	8	53175	53182	25 %	0 %	50 %	25 %	386855205
92	NC_017806	CGAC	2	8	53613	53620	25 %	0 %	25 %	50 %	386855206

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.