MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Deinococcus gobiensis I-0 plasmid P1

Total Repeats: 426

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017805	GCGCC	2	10	981	990	0 %	0 %	40 %	60 %	386858240
2	NC_017805	GCGCC	2	10	1208	1217	0 %	0 %	40 %	60 %	386858240
3	NC_017805	TCTCC	2	10	3357	3366	0 %	40 %	0 %	60 %	386858243
4	NC_017805	GACCC	2	10	3472	3481	20 %	0 %	20 %	60 %	386858243
5	NC_017805	GGGCG	2	10	4276	4285	0 %	0 %	80 %	20 %	386858244
6	NC_017805	GTCAG	2	10	4894	4903	20 %	20 %	40 %	20 %	386858244
7	NC_017805	TCAGG	2	10	6774	6783	20 %	20 %	40 %	20 %	386858246
8	NC_017805	GGCGA	2	10	7168	7177	20 %	0 %	60 %	20 %	386858246
9	NC_017805	CGGGG	2	10	9736	9745	0 %	0 %	80 %	20 %	386858250
10	NC_017805	GCGCC	2	10	10496	10505	0 %	0 %	40 %	60 %	386858250
11	NC_017805	CGCTG	2	10	12240	12249	0 %	20 %	40 %	40 %	386858250
12	NC_017805	CCGGT	2	10	14316	14325	0 %	20 %	40 %	40 %	386858253
13	NC_017805	GCGCG	2	10	15078	15087	0 %	0 %	60 %	40 %	386858254
14	NC_017805	CGGCG	2	10	15393	15402	0 %	0 %	60 %	40 %	386858254
15	NC_017805	CGCGG	2	10	15595	15604	0 %	0 %	60 %	40 %	386858254
16	NC_017805	CGCGG	2	10	15637	15646	0 %	0 %	60 %	40 %	386858254
17	NC_017805	GGGCG	2	10	15711	15720	0 %	0 %	80 %	20 %	386858254
18	NC_017805	CGGAC	2	10	15839	15848	20 %	0 %	40 %	40 %	386858254
19	NC_017805	GAGCC	2	10	15932	15941	20 %	0 %	40 %	40 %	386858254
20	NC_017805	GCGCA	2	10	19993	20002	20 %	0 %	40 %	40 %	386858257
21	NC_017805	CTCGC	2	10	21838	21847	0 %	20 %	20 %	60 %	386858257
22	NC_017805	CGGAC	2	10	22105	22114	20 %	0 %	40 %	40 %	386858258
23	NC_017805	CCTGA	2	10	23810	23819	20 %	20 %	20 %	40 %	386858260
24	NC_017805	AGCCC	2	10	28187	28196	20 %	0 %	20 %	60 %	386858264
25	NC_017805	CGCGG	3	15	28220	28234	0 %	0 %	60 %	40 %	386858264
26	NC_017805	GCGCG	2	10	30573	30582	0 %	0 %	60 %	40 %	386858267
27	NC_017805	CGCCT	2	10	32683	32692	0 %	20 %	20 %	60 %	386858269
28	NC_017805	GCGTG	2	10	32991	33000	0 %	20 %	60 %	20 %	386858269
29	NC_017805	CCGCC	2	10	35046	35055	0 %	0 %	20 %	80 %	386858269
30	NC_017805	TCGCC	2	10	35413	35422	0 %	20 %	20 %	60 %	386858270
31	NC_017805	CCTGA	2	10	37618	37627	20 %	20 %	20 %	40 %	386858273
32	NC_017805	GGCGC	2	10	40390	40399	0 %	0 %	60 %	40 %	386858276
33	NC_017805	CGCTG	2	10	41981	41990	0 %	20 %	40 %	40 %	386858277
34	NC_017805	GCCAG	2	10	42481	42490	20 %	0 %	40 %	40 %	386858277
35	NC_017805	GCGCG	2	10	42542	42551	0 %	0 %	60 %	40 %	386858277
36	NC_017805	CGGCG	2	10	42663	42672	0 %	0 %	60 %	40 %	386858277
37	NC_017805	GCGCC	2	10	43436	43445	0 %	0 %	40 %	60 %	386858277
38	NC_017805	CCGCT	2	10	46069	46078	0 %	20 %	20 %	60 %	386858279
39	NC_017805	AAGTG	2	10	46602	46611	40 %	20 %	40 %	0 %	386858280
40	NC_017805	ACCGG	2	10	47142	47151	20 %	0 %	40 %	40 %	386858281
41	NC_017805	GCCCC	2	10	47443	47452	0 %	0 %	20 %	80 %	386858281
42	NC_017805	GGCGC	2	10	49017	49026	0 %	0 %	60 %	40 %	386858284
43	NC_017805	GGGAC	2	10	50801	50810	20 %	0 %	60 %	20 %	386858285
44	NC_017805	CCCCG	2	10	54638	54647	0 %	0 %	20 %	80 %	386858286
45	NC_017805	GCGAG	2	10	55975	55984	20 %	0 %	60 %	20 %	386858286
46	NC_017805	CGCGG	2	10	56361	56370	0 %	0 %	60 %	40 %	386858286
47	NC_017805	GGCCG	2	10	56893	56902	0 %	0 %	60 %	40 %	386858286
48	NC_017805	GACGA	2	10	58224	58233	40 %	0 %	40 %	20 %	386858286
49	NC_017805	TCGCC	2	10	60027	60036	0 %	20 %	20 %	60 %	386858287
50	NC_017805	GGCGA	2	10	61951	61960	20 %	0 %	60 %	20 %	386858288
51	NC_017805	TCCGG	2	10	62391	62400	0 %	20 %	40 %	40 %	386858288
52	NC_017805	CCGGG	2	10	62424	62433	0 %	0 %	60 %	40 %	386858288
53	NC_017805	GCCCG	2	10	63217	63226	0 %	0 %	40 %	60 %	386858288
54	NC_017805	GCGCC	2	10	63706	63715	0 %	0 %	40 %	60 %	386858289
55	NC_017805	CGTGC	2	10	64010	64019	0 %	20 %	40 %	40 %	386858289
56	NC_017805	GCGCG	2	10	66633	66642	0 %	0 %	60 %	40 %	386858293
57	NC_017805	GCCGT	2	10	67213	67222	0 %	20 %	40 %	40 %	386858294
58	NC_017805	CGGCG	2	10	67527	67536	0 %	0 %	60 %	40 %	386858294
59	NC_017805	CCGCG	2	10	68805	68814	0 %	0 %	40 %	60 %	386858295
60	NC_017805	GGCCG	2	10	69358	69367	0 %	0 %	60 %	40 %	386858296
61	NC_017805	CCCGC	2	10	70965	70974	0 %	0 %	20 %	80 %	386858297
62	NC_017805	GCCCA	2	10	74260	74269	20 %	0 %	20 %	60 %	386858300
63	NC_017805	AGCGC	2	10	74387	74396	20 %	0 %	40 %	40 %	386858300
64	NC_017805	GCGCG	2	10	74513	74522	0 %	0 %	60 %	40 %	386858300
65	NC_017805	GGGAA	2	10	75157	75166	40 %	0 %	60 %	0 %	386858300
66	NC_017805	GACCT	2	10	77533	77542	20 %	20 %	20 %	40 %	386858302
67	NC_017805	CGCCT	2	10	79159	79168	0 %	20 %	20 %	60 %	386858304
68	NC_017805	AGGAC	2	10	79464	79473	40 %	0 %	40 %	20 %	386858304
69	NC_017805	CCTCG	2	10	80533	80542	0 %	20 %	20 %	60 %	386858305
70	NC_017805	CCTCG	2	10	81265	81274	0 %	20 %	20 %	60 %	386858305
71	NC_017805	CTGAA	2	10	81791	81800	40 %	20 %	20 %	20 %	386858305
72	NC_017805	GCTGG	2	10	82969	82978	0 %	20 %	60 %	20 %	386858307
73	NC_017805	GCTGG	2	10	83931	83940	0 %	20 %	60 %	20 %	386858308
74	NC_017805	GCGCG	2	10	84060	84069	0 %	0 %	60 %	40 %	386858308
75	NC_017805	CACGG	2	10	85292	85301	20 %	0 %	40 %	40 %	386858309
76	NC_017805	GGCCG	2	10	86586	86595	0 %	0 %	60 %	40 %	386858310
77	NC_017805	CGGCG	2	10	86987	86996	0 %	0 %	60 %	40 %	386858311
78	NC_017805	GCCCA	2	10	87078	87087	20 %	0 %	20 %	60 %	386858311
79	NC_017805	CTCGC	2	10	88025	88034	0 %	20 %	20 %	60 %	386858312
80	NC_017805	CGGCT	2	10	88834	88843	0 %	20 %	40 %	40 %	386858313
81	NC_017805	GGCCC	2	10	91134	91143	0 %	0 %	40 %	60 %	386858315
82	NC_017805	CGGGG	2	10	94474	94483	0 %	0 %	80 %	20 %	386858317
83	NC_017805	GCGCG	2	10	95116	95125	0 %	0 %	60 %	40 %	386858318
84	NC_017805	CCAGG	2	10	96740	96749	20 %	0 %	40 %	40 %	386858318
85	NC_017805	CTCGC	2	10	98413	98422	0 %	20 %	20 %	60 %	386858319
86	NC_017805	CGAGG	2	10	99039	99048	20 %	0 %	60 %	20 %	386858320
87	NC_017805	TCGTC	2	10	99056	99065	0 %	40 %	20 %	40 %	386858320
88	NC_017805	AGCCC	2	10	101311	101320	20 %	0 %	20 %	60 %	386858322
89	NC_017805	GCGGG	2	10	102964	102973	0 %	0 %	80 %	20 %	386858323
90	NC_017805	TGACC	2	10	103168	103177	20 %	20 %	20 %	40 %	386858323
91	NC_017805	CGGGC	2	10	103352	103361	0 %	0 %	60 %	40 %	386858323
92	NC_017805	GAACT	2	10	103382	103391	40 %	20 %	20 %	20 %	386858323
93	NC_017805	CTGGC	2	10	104062	104071	0 %	20 %	40 %	40 %	386858324
94	NC_017805	GGCCC	2	10	105099	105108	0 %	0 %	40 %	60 %	386858325
95	NC_017805	CTGCC	2	10	105110	105119	0 %	20 %	20 %	60 %	386858325
96	NC_017805	GGCAG	2	10	106910	106919	20 %	0 %	60 %	20 %	386858326
97	NC_017805	GGCCC	2	10	108355	108364	0 %	0 %	40 %	60 %	386858329
98	NC_017805	CGCTG	2	10	109521	109530	0 %	20 %	40 %	40 %	386858331
99	NC_017805	CGCGG	2	10	110270	110279	0 %	0 %	60 %	40 %	386858331
100	NC_017805	AGGGC	2	10	110323	110332	20 %	0 %	60 %	20 %	386858331
101	NC_017805	CGGCG	2	10	110407	110416	0 %	0 %	60 %	40 %	386858331
102	NC_017805	GCGCC	2	10	111606	111615	0 %	0 %	40 %	60 %	386858333
103	NC_017805	CCAGG	2	10	111645	111654	20 %	0 %	40 %	40 %	386858333
104	NC_017805	GCCGG	2	10	111881	111890	0 %	0 %	60 %	40 %	386858334
105	NC_017805	GCCGG	2	10	112084	112093	0 %	0 %	60 %	40 %	386858334
106	NC_017805	TTCGA	2	10	113410	113419	20 %	40 %	20 %	20 %	386858335
107	NC_017805	CGCGG	2	10	114567	114576	0 %	0 %	60 %	40 %	386858336
108	NC_017805	GCCAG	2	10	114815	114824	20 %	0 %	40 %	40 %	386858336
109	NC_017805	CCAGG	2	10	114861	114870	20 %	0 %	40 %	40 %	386858336
110	NC_017805	GGCCT	2	10	115728	115737	0 %	20 %	40 %	40 %	386858337
111	NC_017805	ACGGC	2	10	116839	116848	20 %	0 %	40 %	40 %	386858337
112	NC_017805	CGGCC	2	10	117517	117526	0 %	0 %	40 %	60 %	386858338
113	NC_017805	GCCCA	2	10	118322	118331	20 %	0 %	20 %	60 %	386858338
114	NC_017805	AACGG	2	10	120126	120135	40 %	0 %	40 %	20 %	386858339
115	NC_017805	CCCGT	2	10	120236	120245	0 %	20 %	20 %	60 %	386858339
116	NC_017805	TCGAC	2	10	122724	122733	20 %	20 %	20 %	40 %	386858339
117	NC_017805	GCTGG	2	10	123379	123388	0 %	20 %	60 %	20 %	386858339
118	NC_017805	AAGGC	2	10	123389	123398	40 %	0 %	40 %	20 %	386858339
119	NC_017805	CTTCT	2	10	124632	124641	0 %	60 %	0 %	40 %	386858341
120	NC_017805	CTCAC	2	10	125904	125913	20 %	20 %	0 %	60 %	386858342
121	NC_017805	CGTGA	2	10	127079	127088	20 %	20 %	40 %	20 %	386858344
122	NC_017805	GGTCA	2	10	127196	127205	20 %	20 %	40 %	20 %	386858344
123	NC_017805	GCCGC	2	10	130826	130835	0 %	0 %	40 %	60 %	386858347
124	NC_017805	CGGTG	2	10	133998	134007	0 %	20 %	60 %	20 %	386858350
125	NC_017805	CCTGG	2	10	134462	134471	0 %	20 %	40 %	40 %	386858351
126	NC_017805	GGTCT	2	10	134604	134613	0 %	40 %	40 %	20 %	386858351
127	NC_017805	TCCGG	2	10	136360	136369	0 %	20 %	40 %	40 %	386858353
128	NC_017805	ACGCC	2	10	137660	137669	20 %	0 %	20 %	60 %	386858355
129	NC_017805	ACCAC	2	10	137821	137830	40 %	0 %	0 %	60 %	386858355
130	NC_017805	CAGCG	2	10	139532	139541	20 %	0 %	40 %	40 %	386858357
131	NC_017805	GGGCC	2	10	139639	139648	0 %	0 %	60 %	40 %	386858357
132	NC_017805	ACGCG	2	10	139703	139712	20 %	0 %	40 %	40 %	386858357
133	NC_017805	GGCCG	2	10	143841	143850	0 %	0 %	60 %	40 %	386858361
134	NC_017805	GACGC	2	10	145416	145425	20 %	0 %	40 %	40 %	386858362
135	NC_017805	TGGGC	2	10	145937	145946	0 %	20 %	60 %	20 %	386858362
136	NC_017805	GACCT	2	10	146553	146562	20 %	20 %	20 %	40 %	386858362
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.