MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Deinococcus gobiensis I-0 plasmid P1

Total Repeats: 198

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017805	CCGA	2	8	177	184	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017805	AGGG	2	8	7343	7350	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017805	TGGC	2	8	7698	7705	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017805	CAAT	2	8	13427	13434	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017805	CGCC	2	8	13554	13561	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6	NC_017805	CCGA	2	8	16618	16625	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017805	GCCA	2	8	17708	17715	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017805	GGCC	2	8	25062	25069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017805	CCTT	2	8	25356	25363	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017805	GGCA	2	8	28311	28318	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017805	CGGG	2	8	30148	30155	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017805	AGGT	2	8	32317	32324	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017805	GCCC	2	8	35117	35124	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14	NC_017805	GCCG	2	8	39081	39088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017805	CGCC	2	8	39359	39366	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16	NC_017805	CCGC	2	8	47518	47525	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17	NC_017805	CCCG	2	8	48101	48108	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18	NC_017805	GGTG	2	8	51989	51996	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017805	GGTC	2	8	52136	52143	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017805	CAGC	2	8	52518	52525	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017805	CCGG	2	8	53584	53591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017805	GCCC	2	8	53822	53829	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
23	NC_017805	CCGA	2	8	54010	54017	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017805	TGCT	2	8	54109	54116	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017805	GGCC	2	8	54200	54207	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017805	GGGC	2	8	61129	61136	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017805	GGCA	2	8	69152	69159	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017805	GCCC	2	8	69169	69176	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
29	NC_017805	ACAG	2	8	69617	69624	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017805	GGGC	2	8	71483	71490	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017805	GGGT	2	8	73090	73097	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017805	CCGG	2	8	80288	80295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017805	ACGC	2	8	87859	87866	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017805	CGCC	2	8	87867	87874	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
35	NC_017805	TGCG	2	8	87936	87943	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017805	CCTG	2	8	89644	89651	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017805	CTTC	2	8	93569	93576	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017805	CGCC	2	8	94699	94706	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_017805	CCCG	2	8	94797	94804	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
40	NC_017805	ACCG	2	8	104438	104445	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017805	CTCG	2	8	104496	104503	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017805	ACCT	2	8	104992	104999	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017805	GCGG	2	8	108573	108580	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017805	CGGG	2	8	108790	108797	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017805	CTGG	2	8	108809	108816	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017805	GCGG	2	8	112593	112600	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017805	GGGC	2	8	116939	116946	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017805	GCTC	2	8	119657	119664	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017805	AGGA	2	8	124205	124212	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017805	GACT	2	8	124863	124870	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017805	GCCG	2	8	126730	126737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017805	CGGG	2	8	127359	127366	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017805	ACAG	2	8	127612	127619	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017805	GGAA	2	8	127630	127637	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017805	CTGC	2	8	128245	128252	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017805	GCCT	2	8	128352	128359	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017805	AGGC	2	8	128595	128602	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017805	CCGT	2	8	128784	128791	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017805	CGGG	2	8	128908	128915	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017805	CCTA	2	8	133445	133452	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017805	TTTA	2	8	135149	135156	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017805	AACT	2	8	135485	135492	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017805	CGGA	2	8	135784	135791	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017805	GCCG	2	8	138405	138412	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017805	ACCC	2	8	140345	140352	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
66	NC_017805	GGGC	2	8	140576	140583	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017805	CCCA	2	8	140653	140660	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
68	NC_017805	CCGG	2	8	144474	144481	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017805	ATTC	2	8	148529	148536	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017805	AGGG	2	8	149716	149723	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017805	CCAC	3	12	149785	149796	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
72	NC_017805	CGTC	2	8	155297	155304	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017805	CCGA	2	8	155422	155429	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017805	ATGA	2	8	155497	155504	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017805	CGCC	2	8	160415	160422	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
76	NC_017805	GGCC	2	8	160723	160730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017805	GGGC	2	8	163857	163864	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017805	CCGC	2	8	164932	164939	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
79	NC_017805	CGAT	2	8	168606	168613	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017805	GCAG	2	8	170120	170127	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017805	CCGG	2	8	177068	177075	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017805	CGGG	2	8	177143	177150	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017805	AGGA	2	8	177175	177182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017805	CCTC	2	8	178385	178392	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
85	NC_017805	TTCC	2	8	180715	180722	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017805	CCGG	2	8	186140	186147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017805	CGTC	2	8	186201	186208	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017805	CCGC	2	8	186339	186346	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
89	NC_017805	TCGT	2	8	186389	186396	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017805	CTGG	2	8	186656	186663	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017805	CTGC	2	8	191562	191569	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017805	CTGG	2	8	193391	193398	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017805	TCTA	2	8	193461	193468	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017805	GCCC	2	8	194954	194961	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
95	NC_017805	CGGC	2	8	199604	199611	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017805	CACC	2	8	199726	199733	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
97	NC_017805	CCGG	2	8	200348	200355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017805	GCCA	2	8	201184	201191	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017805	GGCG	2	8	201297	201304	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017805	CAGC	2	8	201554	201561	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017805	CCAC	2	8	201605	201612	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
102	NC_017805	CGGG	2	8	216622	216629	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017805	GGCG	2	8	216784	216791	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017805	AGGC	2	8	216952	216959	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017805	GGCC	2	8	223132	223139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017805	GGCC	2	8	223160	223167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017805	GCCC	2	8	227031	227038	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
108	NC_017805	CAGA	2	8	231457	231464	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017805	GGGC	2	8	231519	231526	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017805	GGGC	2	8	231551	231558	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017805	GGCG	2	8	231759	231766	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017805	CGCC	2	8	231915	231922	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
113	NC_017805	CGGC	2	8	232208	232215	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017805	GGGC	2	8	233555	233562	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017805	GCCC	2	8	233574	233581	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
116	NC_017805	TTCG	2	8	236632	236639	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017805	CTTC	2	8	236696	236703	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017805	CCGG	2	8	236755	236762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017805	CGGG	2	8	241010	241017	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017805	CCCT	2	8	246870	246877	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
121	NC_017805	CGCC	2	8	252858	252865	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
122	NC_017805	GGAA	2	8	253666	253673	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017805	TTCC	2	8	253682	253689	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017805	GCGG	2	8	255166	255173	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017805	GGCG	2	8	255737	255744	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017805	GTTC	2	8	255749	255756	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017805	GCCG	2	8	266423	266430	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017805	TGCC	2	8	267790	267797	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017805	ACCT	2	8	269298	269305	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017805	GCCT	2	8	272591	272598	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017805	AGGG	2	8	275821	275828	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017805	CCCA	2	8	277700	277707	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
133	NC_017805	AGCA	2	8	283889	283896	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017805	CCAT	2	8	284232	284239	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017805	TCGT	2	8	284293	284300	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017805	GTTC	2	8	287617	287624	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017805	GTTC	2	8	287782	287789	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017805	TGAA	2	8	288852	288859	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017805	TAAC	2	8	288991	288998	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017805	TAAG	2	8	295946	295953	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017805	GAAC	2	8	300580	300587	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017805	GGGC	2	8	302262	302269	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017805	CTGC	2	8	308089	308096	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_017805	CTTC	2	8	308748	308755	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017805	GTTT	2	8	311146	311153	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017805	CGGG	2	8	311649	311656	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017805	CCGG	2	8	314084	314091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_017805	GCGG	2	8	318216	318223	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017805	CCGG	2	8	318356	318363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_017805	TCGG	2	8	320157	320164	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_017805	CCGG	2	8	322626	322633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_017805	GACC	2	8	327376	327383	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
153	NC_017805	CCTT	2	8	331533	331540	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_017805	CGCC	2	8	333632	333639	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
155	NC_017805	GGGC	2	8	333812	333819	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
156	NC_017805	GACG	2	8	335812	335819	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
157	NC_017805	CGCC	2	8	337190	337197	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
158	NC_017805	CGGG	2	8	339815	339822	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
159	NC_017805	CGGC	2	8	341914	341921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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163	NC_017805	GCCG	2	8	353183	353190	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
164	NC_017805	CCTC	2	8	353272	353279	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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168	NC_017805	CTGC	2	8	358092	358099	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
169	NC_017805	GCAC	2	8	360323	360330	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
170	NC_017805	TCGG	3	12	360376	360387	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
171	NC_017805	CGCA	2	8	362730	362737	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
172	NC_017805	GCCC	2	8	364234	364241	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
173	NC_017805	CACG	2	8	364393	364400	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
174	NC_017805	AGTC	2	8	366818	366825	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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177	NC_017805	CGGG	2	8	369593	369600	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
178	NC_017805	ATCA	2	8	369612	369619	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
179	NC_017805	CGCC	2	8	373154	373161	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
180	NC_017805	ACCG	2	8	381159	381166	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
181	NC_017805	GGCG	3	12	382594	382605	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
182	NC_017805	CGGC	2	8	382612	382619	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
183	NC_017805	CCTT	2	8	385973	385980	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
184	NC_017805	AGGT	2	8	386134	386141	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
185	NC_017805	CGTG	2	8	394722	394729	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
186	NC_017805	CGCC	2	8	400502	400509	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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189	NC_017805	CCCA	2	8	420065	420072	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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191	NC_017805	GGGC	2	8	420268	420275	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
192	NC_017805	CCCG	2	8	420701	420708	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
193	NC_017805	GCCG	2	8	420742	420749	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
194	NC_017805	GGGC	2	8	424746	424753	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
195	NC_017805	AGGT	2	8	430623	430630	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
196	NC_017805	GCGG	2	8	430646	430653	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
197	NC_017805	CAGC	2	8	432316	432323	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
198	NC_017805	GGCG	2	8	432557	432564	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.