MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia garinii BgVir plasmid lp54

Total Repeats: 16

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017804	TTAATT	2	12	4435	4446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017804	TTTAAA	2	12	5319	5330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017804	TTTAAA	2	12	6378	6389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017804	TTTAAA	2	12	7331	7342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017804	TTTAAA	2	12	8495	8506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017804	TAAAAT	2	12	15734	15745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017804	TTAAAA	2	12	18813	18824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017804	ACTCTA	2	12	31659	31670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017804	TTGGAA	2	12	31886	31897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017804	ATAAAT	2	12	34057	34068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017804	TCTTAG	2	12	36754	36765	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017804	TTTATA	2	12	43237	43248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017804	AATATA	2	12	46026	46037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017804	CTCAAT	2	12	49211	49222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017804	ATAGAT	2	12	55029	55040	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017804	ATTTTT	2	12	59739	59750	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.