MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Borrelia garinii BgVir plasmid lp54

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017804	CAATTC	2	12	1259	1270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386853319
2	NC_017804	AAATGA	2	12	2591	2602	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386853320
3	NC_017804	AAAGAA	2	12	4608	4619	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386853324
4	NC_017804	TAAAAC	2	12	6083	6094	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386853325
5	NC_017804	AAATGA	2	12	9004	9015	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386853328
6	NC_017804	TTGTTT	2	12	9755	9766	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	386853329
7	NC_017804	TAAAAA	2	12	12339	12350	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386853332
8	NC_017804	ATCTGA	2	12	16080	16091	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386853337
9	NC_017804	ATCCAA	2	12	16802	16813	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386853337
10	NC_017804	AGTTGT	2	12	17108	17119	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386853338
11	NC_017804	TCATCT	2	12	19344	19355	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386853343
12	NC_017804	TTTTTA	2	12	19794	19805	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386853343
13	NC_017804	ATATTT	2	12	19820	19831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386853343
14	NC_017804	ACTTCT	2	12	20246	20257	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386853344
15	NC_017804	ATTTAA	3	18	21222	21239	50 %	50 %	0 %	0 %	386853347
16	NC_017804	TTGGAA	2	12	23191	23202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386853352
17	NC_017804	TAAACT	2	12	23422	23433	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386853353
18	NC_017804	TAAAAC	2	12	24482	24493	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386853354
19	NC_017804	AATTAA	2	12	25852	25863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386853357
20	NC_017804	CATAAT	2	12	29108	29119	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386853363
21	NC_017804	TCAAAA	2	12	30301	30312	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386853364
22	NC_017804	ATATTA	2	12	36570	36581	50 %	50 %	0 %	0 %	386853370
23	NC_017804	AATAAA	2	12	37343	37354	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386853373
24	NC_017804	CTCCTT	2	12	37652	37663	0 %	50 %	0 %	50 %	386853373
25	NC_017804	AGGTTA	2	12	38519	38530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386853374
26	NC_017804	ATTTAA	2	12	38707	38718	50 %	50 %	0 %	0 %	386853375
27	NC_017804	TTTAAT	2	12	42415	42426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386853381
28	NC_017804	TTTTTG	2	12	42429	42440	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	386853381
29	NC_017804	AAGTTT	2	12	43591	43602	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386853384
30	NC_017804	GAAAAA	2	12	46134	46145	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386853389
31	NC_017804	TATTGT	2	12	49742	49753	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386853397
32	NC_017804	TGCTAA	2	12	50533	50544	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386853399
33	NC_017804	AATAAA	2	12	52592	52603	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386853401
34	NC_017804	GTTTAA	2	12	53628	53639	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386853402
35	NC_017804	ATTAAT	2	12	54620	54631	50 %	50 %	0 %	0 %	386853403
36	NC_017804	TGGAAA	2	12	57209	57220	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386853406
37	NC_017804	TTCTTT	2	12	58388	58399	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386853408

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.