MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia garinii BgVir plasmid lp54

Total Repeats: 230

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017804	ATCA	2	8	12	19	50 %	25 %	0 %	25 %	386853318
2	NC_017804	GGTT	2	8	467	474	0 %	50 %	50 %	0 %	386853318
3	NC_017804	AATA	2	8	598	605	75 %	25 %	0 %	0 %	386853318
4	NC_017804	ATTT	2	8	1285	1292	25 %	75 %	0 %	0 %	386853319
5	NC_017804	ATAA	2	8	1918	1925	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017804	TAAA	2	8	1967	1974	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017804	TTGC	2	8	2156	2163	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017804	AAAC	2	8	2282	2289	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017804	TCAA	2	8	2435	2442	50 %	25 %	0 %	25 %	386853320
10	NC_017804	AATT	2	8	2605	2612	50 %	50 %	0 %	0 %	386853320
11	NC_017804	AATA	2	8	2696	2703	75 %	25 %	0 %	0 %	386853320
12	NC_017804	GTAT	2	8	3239	3246	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017804	AATC	2	8	3543	3550	50 %	25 %	0 %	25 %	386853321
14	NC_017804	ATTG	2	8	4145	4152	25 %	50 %	25 %	0 %	386853322
15	NC_017804	TTTA	2	8	4271	4278	25 %	75 %	0 %	0 %	386853323
16	NC_017804	AAAT	2	8	4581	4588	75 %	25 %	0 %	0 %	386853324
17	NC_017804	AAAT	2	8	4694	4701	75 %	25 %	0 %	0 %	386853324
18	NC_017804	AATT	2	8	4719	4726	50 %	50 %	0 %	0 %	386853324
19	NC_017804	ATAG	2	8	4936	4943	50 %	25 %	25 %	0 %	386853324
20	NC_017804	AAAG	2	8	5608	5615	75 %	0 %	25 %	0 %	386853325
21	NC_017804	AAAT	2	8	5631	5638	75 %	25 %	0 %	0 %	386853325
22	NC_017804	TTCA	2	8	5977	5984	25 %	50 %	0 %	25 %	386853325
23	NC_017804	ATTA	2	8	6226	6233	50 %	50 %	0 %	0 %	386853325
24	NC_017804	TTTA	2	8	6357	6364	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017804	AAAG	2	8	6583	6590	75 %	0 %	25 %	0 %	386853326
26	NC_017804	TAAA	2	8	6620	6627	75 %	25 %	0 %	0 %	386853326
27	NC_017804	CAAA	2	8	7197	7204	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017804	ACTT	2	8	7264	7271	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017804	ATTT	2	8	7309	7316	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017804	AAAT	2	8	7643	7650	75 %	25 %	0 %	0 %	386853327
31	NC_017804	AGAA	2	8	7765	7772	75 %	0 %	25 %	0 %	386853327
32	NC_017804	TTTA	2	8	8408	8415	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017804	TTTA	2	8	8419	8426	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017804	TTTA	2	8	8430	8437	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017804	TTTA	2	8	8441	8448	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017804	TTTA	2	8	8452	8459	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017804	TTTA	2	8	8463	8470	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017804	TTTA	2	8	8474	8481	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017804	TTTA	2	8	8485	8492	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017804	ATAA	2	8	8587	8594	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017804	AAAT	2	8	8807	8814	75 %	25 %	0 %	0 %	386853328
42	NC_017804	CTTT	2	8	9125	9132	0 %	75 %	0 %	25 %	386853328
43	NC_017804	ATGA	2	8	9369	9376	50 %	25 %	25 %	0 %	386853328
44	NC_017804	ATTA	2	8	9638	9645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017804	TAAT	2	8	9647	9654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017804	TAAT	2	8	9664	9671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017804	AAAC	2	8	9891	9898	75 %	0 %	0 %	25 %	386853329
48	NC_017804	CAAC	2	8	10217	10224	50 %	0 %	0 %	50 %	386853329
49	NC_017804	TACC	2	8	10263	10270	25 %	25 %	0 %	50 %	386853329
50	NC_017804	GAAA	2	8	10532	10539	75 %	0 %	25 %	0 %	386853329
51	NC_017804	CAAT	2	8	10746	10753	50 %	25 %	0 %	25 %	386853329
52	NC_017804	TTTA	2	8	10991	10998	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017804	TAAT	2	8	11479	11486	50 %	50 %	0 %	0 %	386853331
54	NC_017804	AGCA	2	8	11947	11954	50 %	0 %	25 %	25 %	386853331
55	NC_017804	TAAT	2	8	12116	12123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017804	AATT	2	8	12173	12180	50 %	50 %	0 %	0 %	386853332
57	NC_017804	GATT	2	8	12546	12553	25 %	50 %	25 %	0 %	386853332
58	NC_017804	AAAC	2	8	12867	12874	75 %	0 %	0 %	25 %	386853332
59	NC_017804	AAAG	2	8	13132	13139	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017804	TCTT	2	8	13155	13162	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017804	GTTT	2	8	13293	13300	0 %	75 %	25 %	0 %	386853333
62	NC_017804	TCAT	2	8	13353	13360	25 %	50 %	0 %	25 %	386853333
63	NC_017804	GCAA	2	8	13397	13404	50 %	0 %	25 %	25 %	386853333
64	NC_017804	TATT	2	8	13966	13973	25 %	75 %	0 %	0 %	386853334
65	NC_017804	AAAT	2	8	14098	14105	75 %	25 %	0 %	0 %	386853334
66	NC_017804	TAAA	2	8	14193	14200	75 %	25 %	0 %	0 %	386853334
67	NC_017804	TTAT	2	8	14208	14215	25 %	75 %	0 %	0 %	386853334
68	NC_017804	AATC	2	8	14421	14428	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017804	ATTA	2	8	14622	14629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017804	TAAT	2	8	14641	14648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017804	TAAA	2	8	14833	14840	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017804	ATTT	2	8	15629	15636	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017804	GAAA	2	8	16749	16756	75 %	0 %	25 %	0 %	386853337
74	NC_017804	ACAT	2	8	17139	17146	50 %	25 %	0 %	25 %	386853338
75	NC_017804	AACT	2	8	17290	17297	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017804	CTTT	2	8	17385	17392	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017804	AAAT	2	8	17945	17952	75 %	25 %	0 %	0 %	386853339
78	NC_017804	GCAA	2	8	18051	18058	50 %	0 %	25 %	25 %	386853339
79	NC_017804	TCAT	2	8	18091	18098	25 %	50 %	0 %	25 %	386853339
80	NC_017804	TATT	2	8	18660	18667	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017804	TAAT	2	8	18950	18957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017804	AATT	2	8	19222	19229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017804	TAAA	2	8	19248	19255	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017804	AATA	2	8	20111	20118	75 %	25 %	0 %	0 %	386853343
85	NC_017804	TTAA	2	8	20179	20186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017804	TAAA	2	8	20260	20267	75 %	25 %	0 %	0 %	386853344
87	NC_017804	TACT	2	8	20295	20302	25 %	50 %	0 %	25 %	386853344
88	NC_017804	ATTA	2	8	20479	20486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017804	TGCT	2	8	20688	20695	0 %	50 %	25 %	25 %	386853345
90	NC_017804	TTTA	2	8	21327	21334	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017804	TTAA	2	8	22881	22888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017804	TGCT	2	8	23218	23225	0 %	50 %	25 %	25 %	386853352
93	NC_017804	TCTT	2	8	24438	24445	0 %	75 %	0 %	25 %	386853354
94	NC_017804	TTTG	2	8	25178	25185	0 %	75 %	25 %	0 %	386853355
95	NC_017804	TTTA	2	8	25283	25290	25 %	75 %	0 %	0 %	386853355
96	NC_017804	CAAC	2	8	25896	25903	50 %	0 %	0 %	50 %	386853357
97	NC_017804	AACA	2	8	25919	25926	75 %	0 %	0 %	25 %	386853357
98	NC_017804	TATT	2	8	26380	26387	25 %	75 %	0 %	0 %	386853358
99	NC_017804	CATA	2	8	26611	26618	50 %	25 %	0 %	25 %	386853358
100	NC_017804	TAAT	2	8	26826	26833	50 %	50 %	0 %	0 %	386853358
101	NC_017804	ATCT	2	8	27251	27258	25 %	50 %	0 %	25 %	386853359
102	NC_017804	AATC	2	8	27993	28000	50 %	25 %	0 %	25 %	386853362
103	NC_017804	TTTA	2	8	28162	28169	25 %	75 %	0 %	0 %	386853362
104	NC_017804	TTAA	2	8	28256	28263	50 %	50 %	0 %	0 %	386853362
105	NC_017804	TTAA	2	8	28435	28442	50 %	50 %	0 %	0 %	386853363
106	NC_017804	TTTG	2	8	28866	28873	0 %	75 %	25 %	0 %	386853363
107	NC_017804	TAAA	2	8	29034	29041	75 %	25 %	0 %	0 %	386853363
108	NC_017804	CTTT	2	8	29422	29429	0 %	75 %	0 %	25 %	386853363
109	NC_017804	TAAG	2	8	29444	29451	50 %	25 %	25 %	0 %	386853363
110	NC_017804	AATT	2	8	29456	29463	50 %	50 %	0 %	0 %	386853363
111	NC_017804	TGTA	2	8	29679	29686	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017804	TACT	2	8	29795	29802	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017804	AATA	2	8	29880	29887	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017804	AGCT	2	8	30357	30364	25 %	25 %	25 %	25 %	386853364
115	NC_017804	TAGG	2	8	30405	30412	25 %	25 %	50 %	0 %	386853364
116	NC_017804	AACA	2	8	30889	30896	75 %	0 %	0 %	25 %	386853365
117	NC_017804	TCTG	2	8	31006	31013	0 %	50 %	25 %	25 %	386853365
118	NC_017804	TCTT	2	8	31700	31707	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017804	TCAA	2	8	31712	31719	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017804	CATA	2	8	32129	32136	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017804	TGAT	2	8	32252	32259	25 %	50 %	25 %	0 %	386853366
122	NC_017804	CAAC	2	8	32287	32294	50 %	0 %	0 %	50 %	386853366
123	NC_017804	AAAT	2	8	32367	32374	75 %	25 %	0 %	0 %	386853366
124	NC_017804	TTTC	2	8	32653	32660	0 %	75 %	0 %	25 %	386853366
125	NC_017804	TAAA	2	8	33170	33177	75 %	25 %	0 %	0 %	386853366
126	NC_017804	ATTT	2	8	33540	33547	25 %	75 %	0 %	0 %	386853367
127	NC_017804	TTTA	2	8	33806	33813	25 %	75 %	0 %	0 %	386853367
128	NC_017804	AAAG	2	8	33957	33964	75 %	0 %	25 %	0 %	386853367
129	NC_017804	TTCT	2	8	34230	34237	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017804	TCCC	2	8	34443	34450	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
131	NC_017804	TTTG	2	8	34874	34881	0 %	75 %	25 %	0 %	386853368
132	NC_017804	ATAA	2	8	34958	34965	75 %	25 %	0 %	0 %	386853368
133	NC_017804	ATTC	2	8	35167	35174	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017804	TAAA	2	8	35203	35210	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017804	TAAT	2	8	35541	35548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017804	TTGA	2	8	35822	35829	25 %	50 %	25 %	0 %	386853370
137	NC_017804	ATTT	2	8	35854	35861	25 %	75 %	0 %	0 %	386853370
138	NC_017804	CAAT	2	8	36258	36265	50 %	25 %	0 %	25 %	386853370
139	NC_017804	AGCA	2	8	36999	37006	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017804	CAAA	2	8	37479	37486	75 %	0 %	0 %	25 %	386853373
141	NC_017804	GGCT	2	8	37820	37827	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017804	AAAT	2	8	38614	38621	75 %	25 %	0 %	0 %	386853374
143	NC_017804	AAAG	2	8	38724	38731	75 %	0 %	25 %	0 %	386853375
144	NC_017804	AAAT	2	8	38855	38862	75 %	25 %	0 %	0 %	386853376
145	NC_017804	GGGT	2	8	39110	39117	0 %	25 %	75 %	0 %	386853376
146	NC_017804	TTTC	2	8	39411	39418	0 %	75 %	0 %	25 %	386853377
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148	NC_017804	TTTA	2	8	40036	40043	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.