MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Actinoplanes sp. SE50/110 chromosome

Total Repeats: 7521

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017803	CTCCGG	2	12	6715380	6715391	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386851069
5502	NC_017803	CTGGCC	2	12	6715579	6715590	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386851070
5503	NC_017803	CGTCGG	2	12	6715610	6715621	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386851070
5504	NC_017803	CGAGGT	2	12	6717515	6717526	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386851071
5505	NC_017803	GCCGGT	2	12	6717645	6717656	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386851071
5506	NC_017803	CCCGGC	2	12	6719441	6719452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386851072
5507	NC_017803	GCCGTC	2	12	6720925	6720936	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386851073
5508	NC_017803	GCTGAC	2	12	6721182	6721193	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386851073
5509	NC_017803	ACCTCG	2	12	6721838	6721849	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386851073
5510	NC_017803	GCATCG	2	12	6722096	6722107	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386851073
5511	NC_017803	GCGACG	2	12	6722420	6722431	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386851074
5512	NC_017803	GGTGGC	2	12	6722526	6722537	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386851074
5513	NC_017803	CGGCCC	2	12	6722843	6722854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5514	NC_017803	CCGGTA	2	12	6722929	6722940	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386851075
5515	NC_017803	GACGTC	2	12	6725728	6725739	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386851076
5516	NC_017803	CCGACG	2	12	6726103	6726114	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386851077
5517	NC_017803	ACGCCG	2	12	6726143	6726154	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386851077
5518	NC_017803	GGACCG	2	12	6727106	6727117	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386851078
5519	NC_017803	GCGGCC	2	12	6729093	6729104	0 %	0 %	50 %	50 %	386851079
5520	NC_017803	GGGTCG	2	12	6729598	6729609	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386851079
5521	NC_017803	TCGGCG	2	12	6729970	6729981	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386851079
5522	NC_017803	GCCGGC	2	12	6732377	6732388	0 %	0 %	50 %	50 %	386851079
5523	NC_017803	GGTCGC	2	12	6733103	6733114	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386851079
5524	NC_017803	CAAGGA	2	12	6734625	6734636	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386851081
5525	NC_017803	GCTCCT	2	12	6734640	6734651	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386851081
5526	NC_017803	TCGGCC	2	12	6736971	6736982	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386851083
5527	NC_017803	GCGCCC	2	12	6738614	6738625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386851084
5528	NC_017803	CGGTGC	2	12	6741354	6741365	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386851087
5529	NC_017803	ACCGGA	2	12	6744100	6744111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386851088
5530	NC_017803	GCAGGT	2	12	6744520	6744531	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386851088
5531	NC_017803	GCCCGG	2	12	6745660	6745671	0 %	0 %	50 %	50 %	386851088
5532	NC_017803	GAAGCC	2	12	6746357	6746368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386851088
5533	NC_017803	GTGCCG	2	12	6746667	6746678	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386851088
5534	NC_017803	CGTCGG	2	12	6746905	6746916	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386851088
5535	NC_017803	CGGTCC	2	12	6747160	6747171	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386851088
5536	NC_017803	CGGCCG	2	12	6749398	6749409	0 %	0 %	50 %	50 %	386851088
5537	NC_017803	GGCCGG	2	12	6749882	6749893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386851088
5538	NC_017803	CGGTGC	2	12	6750262	6750273	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386851088
5539	NC_017803	CAGGTC	2	12	6751657	6751668	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386851089
5540	NC_017803	CGGTGG	2	12	6752385	6752396	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386851089
5541	NC_017803	CGTCGA	2	12	6753507	6753518	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386851089
5542	NC_017803	GCACCG	2	12	6756243	6756254	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386851089
5543	NC_017803	CGAAGG	2	12	6757634	6757645	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386851090
5544	NC_017803	CGGGTT	2	12	6758439	6758450	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386851090
5545	NC_017803	GGCCGG	2	12	6759217	6759228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386851091
5546	NC_017803	CGGCCA	2	12	6759939	6759950	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386851091
5547	NC_017803	CCGGGC	2	12	6761217	6761228	0 %	0 %	50 %	50 %	386851092
5548	NC_017803	ATGACG	2	12	6761656	6761667	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386851092
5549	NC_017803	GCCATC	2	12	6762018	6762029	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386851093
5550	NC_017803	CGCCGG	2	12	6765601	6765612	0 %	0 %	50 %	50 %	386851095
5551	NC_017803	CCGGGC	2	12	6770151	6770162	0 %	0 %	50 %	50 %	386851098
5552	NC_017803	CGGCCG	2	12	6770663	6770674	0 %	0 %	50 %	50 %	386851098
5553	NC_017803	GACAGC	2	12	6774681	6774692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386851099
5554	NC_017803	CGAGCA	2	12	6774778	6774789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386851099
5555	NC_017803	GCCAGC	2	12	6775077	6775088	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386851099
5556	NC_017803	CAGGAC	2	12	6775687	6775698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386851100
5557	NC_017803	GGTGAG	2	12	6777912	6777923	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	386851101
5558	NC_017803	GGGTGA	2	12	6778478	6778489	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	386851101
5559	NC_017803	TGCACC	2	12	6779223	6779234	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386851102
5560	NC_017803	CCCGGG	2	12	6790601	6790612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5561	NC_017803	CGGCGC	2	12	6792290	6792301	0 %	0 %	50 %	50 %	386851111
5562	NC_017803	GGTCCG	2	12	6794530	6794541	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386851112
5563	NC_017803	GTGCCG	2	12	6796009	6796020	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5564	NC_017803	AGGTCC	2	12	6796459	6796470	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386851114
5565	NC_017803	CCCGCC	2	12	6797912	6797923	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	386851115
5566	NC_017803	TCACCG	2	12	6799108	6799119	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386851115
5567	NC_017803	GGGCTC	2	12	6802705	6802716	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386851118
5568	NC_017803	AGGCCA	2	12	6803984	6803995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386851120
5569	NC_017803	CGGCCG	2	12	6804635	6804646	0 %	0 %	50 %	50 %	386851121
5570	NC_017803	CAGCGG	2	12	6805018	6805029	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386851121
5571	NC_017803	GCATGA	2	12	6807972	6807983	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386851123
5572	NC_017803	TGCCGT	2	12	6809096	6809107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386851125
5573	NC_017803	TTCGGC	2	12	6813512	6813523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386851130
5574	NC_017803	CTGGTC	2	12	6813974	6813985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386851130
5575	NC_017803	ACCGCT	2	12	6814212	6814223	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386851130
5576	NC_017803	GCGCCG	2	12	6814295	6814306	0 %	0 %	50 %	50 %	386851131
5577	NC_017803	GGCACC	2	12	6814585	6814596	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386851131
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5579	NC_017803	CCGCTG	2	12	6815705	6815716	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386851132
5580	NC_017803	CAGCGG	2	12	6816945	6816956	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386851133
5581	NC_017803	CGACGC	2	12	6817079	6817090	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386851134
5582	NC_017803	CCTGGC	2	12	6818045	6818056	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386851134
5583	NC_017803	AGCTGG	2	12	6818542	6818553	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386851134
5584	NC_017803	GCGCCC	2	12	6819786	6819797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386851134
5585	NC_017803	CCGGCC	2	12	6820423	6820434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386851134
5586	NC_017803	TCGGTG	2	12	6821281	6821292	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386851134
5587	NC_017803	GGTCGC	2	12	6824594	6824605	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386851138
5588	NC_017803	CGCCGG	2	12	6824789	6824800	0 %	0 %	50 %	50 %	386851138
5589	NC_017803	ACCGGC	2	12	6826181	6826192	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386851139
5590	NC_017803	GGTGCT	2	12	6826339	6826350	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386851139
5591	NC_017803	CCTGCG	2	12	6826740	6826751	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386851140
5592	NC_017803	ACGCCA	2	12	6826916	6826927	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386851140
5593	NC_017803	TCAGGG	2	12	6827064	6827075	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386851140
5594	NC_017803	CGGCTG	2	12	6827257	6827268	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386851140
5595	NC_017803	CGCCGG	2	12	6829879	6829890	0 %	0 %	50 %	50 %	386851143
5596	NC_017803	GCATCG	2	12	6831028	6831039	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386851143
5597	NC_017803	GCGGAT	2	12	6835251	6835262	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386851146
5598	NC_017803	GGTGCT	2	12	6836105	6836116	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386851147
5599	NC_017803	ATGCCC	2	12	6836767	6836778	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386851148
5600	NC_017803	GCCGGT	2	12	6837413	6837424	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386851148
5601	NC_017803	TCGGCC	2	12	6838350	6838361	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386851149
5602	NC_017803	CCCGGC	2	12	6840419	6840430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5603	NC_017803	TGCCGC	2	12	6841288	6841299	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386851153
5604	NC_017803	CGCGGA	2	12	6844203	6844214	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386851155
5605	NC_017803	TCGCCG	2	12	6844356	6844367	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386851155
5606	NC_017803	ACGGCA	2	12	6845161	6845172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386851155
5607	NC_017803	CGACAT	2	12	6847579	6847590	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386851156
5608	NC_017803	GCGCCT	2	12	6849246	6849257	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386851157
5609	NC_017803	CTCGAT	2	12	6849469	6849480	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386851157
5610	NC_017803	GCGTTC	2	12	6849545	6849556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386851157
5611	NC_017803	GGATCA	2	12	6849627	6849638	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386851157
5612	NC_017803	GCGGTT	2	12	6850555	6850566	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386851157
5613	NC_017803	CTCCCG	2	12	6851949	6851960	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386851157
5614	NC_017803	CGCGGT	2	12	6852117	6852128	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386851158
5615	NC_017803	GCCCGC	2	12	6852387	6852398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386851158
5616	NC_017803	GCAGAT	2	12	6857232	6857243	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386851163
5617	NC_017803	ACGTCG	2	12	6864929	6864940	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386851172
5618	NC_017803	GATCTC	2	12	6865143	6865154	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386851173
5619	NC_017803	GAAGTC	2	12	6865791	6865802	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386851173
5620	NC_017803	GATGAC	2	12	6870164	6870175	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386851176
5621	NC_017803	GTCGTG	2	12	6871882	6871893	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386851177
5622	NC_017803	GAAACC	2	12	6873224	6873235	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386851178
5623	NC_017803	TCGATC	2	12	6874906	6874917	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386851179
5624	NC_017803	GCTGTA	2	12	6875821	6875832	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386851180
5625	NC_017803	TCGACG	2	12	6876626	6876637	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386851180
5626	NC_017803	CGTAGA	2	12	6879329	6879340	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386851183
5627	NC_017803	CGCGAC	2	12	6881394	6881405	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5628	NC_017803	CGCTCT	2	12	6882692	6882703	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5629	NC_017803	CTCGAT	2	12	6884903	6884914	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386851187
5630	NC_017803	TGCCCG	2	12	6885207	6885218	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386851187
5631	NC_017803	AGATCC	2	12	6886637	6886648	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386851188
5632	NC_017803	GGCGAC	2	12	6890265	6890276	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5633	NC_017803	ACGGCA	2	12	6890938	6890949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5634	NC_017803	CCGTCG	2	12	6896661	6896672	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5635	NC_017803	GCGAAA	2	12	6900556	6900567	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5636	NC_017803	ACCCTG	2	12	6903521	6903532	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386851211
5637	NC_017803	TGCCGT	2	12	6905659	6905670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5638	NC_017803	AGCCGA	2	12	6905892	6905903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386851214
5639	NC_017803	GGCCTG	2	12	6907668	6907679	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5640	NC_017803	GCCGTA	2	12	6907962	6907973	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5641	NC_017803	TAGGTG	2	12	6908934	6908945	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
5642	NC_017803	CGTCGG	2	12	6909787	6909798	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5643	NC_017803	GTCGGG	2	12	6910079	6910090	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
5644	NC_017803	TCGGTC	2	12	6910154	6910165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5645	NC_017803	ACGGCG	2	12	6914434	6914445	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5646	NC_017803	CTCGGA	2	12	6917099	6917110	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386851220
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5650	NC_017803	ACCCGC	2	12	6933978	6933989	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386851245
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5654	NC_017803	GCCGAG	2	12	6936938	6936949	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386851248
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5662	NC_017803	CGGCTC	2	12	6949283	6949294	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386851259
5663	NC_017803	GGCCGG	2	12	6950515	6950526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386851261
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5674	NC_017803	GGCGAG	2	12	6961573	6961584	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386851273
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5680	NC_017803	GCACGA	2	12	6967133	6967144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386851280
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5683	NC_017803	CACCGG	2	12	6970291	6970302	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386851282
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5685	NC_017803	GGATCT	2	12	6971363	6971374	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386851283
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5703	NC_017803	CGGCCG	2	12	6984042	6984053	0 %	0 %	50 %	50 %	386851292
5704	NC_017803	CGCCGG	2	12	6985859	6985870	0 %	0 %	50 %	50 %	386851294
5705	NC_017803	CGCCTG	2	12	6987787	6987798	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386851296
5706	NC_017803	TCCTCG	2	12	6989611	6989622	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386851299
5707	NC_017803	GTCCTC	2	12	6989817	6989828	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386851299
5708	NC_017803	GGCGTA	2	12	6990069	6990080	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386851299
5709	NC_017803	CGGTCA	2	12	6990802	6990813	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386851300
5710	NC_017803	CACGGT	2	12	6992009	6992020	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5711	NC_017803	CGGTCA	2	12	6992278	6992289	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5712	NC_017803	ACCCAA	2	12	6993613	6993624	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5713	NC_017803	GCGGTC	2	12	7000623	7000634	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386851303
5714	NC_017803	AACGGC	2	12	7001608	7001619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386851304
5715	NC_017803	TCCACC	2	12	7001944	7001955	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	386851304
5716	NC_017803	ACCGCC	2	12	7002184	7002195	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386851304
5717	NC_017803	GCGCCG	2	12	7002509	7002520	0 %	0 %	50 %	50 %	386851304
5718	NC_017803	GTCGGC	2	12	7004484	7004495	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386851308
5719	NC_017803	CCGGCG	2	12	7004859	7004870	0 %	0 %	50 %	50 %	386851309
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5721	NC_017803	CTTTGT	2	12	7007751	7007762	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5722	NC_017803	GCGGGA	2	12	7008394	7008405	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386851312
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5828	NC_017803	CGGCAC	2	12	7148294	7148305	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386851441
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5832	NC_017803	GGGCCC	2	12	7153336	7153347	0 %	0 %	50 %	50 %	386851446
5833	NC_017803	CGACCC	2	12	7154635	7154646	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386851447
5834	NC_017803	CGCGGC	2	12	7154728	7154739	0 %	0 %	50 %	50 %	386851447
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5931	NC_017803	ACCTCG	2	12	7265625	7265636	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386851558
5932	NC_017803	GGTGCC	2	12	7269827	7269838	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386851560
5933	NC_017803	CCGGTG	2	12	7270606	7270617	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386851560
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5936	NC_017803	CGGTGG	2	12	7274460	7274471	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386851562
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5938	NC_017803	CGGTGG	2	12	7277789	7277800	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386851566
5939	NC_017803	GCAGGG	2	12	7278074	7278085	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386851566
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5941	NC_017803	CGCGGC	2	12	7280186	7280197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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