MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017798	TCTT	2	8	101	108	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017798	TTTG	2	8	300	307	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017798	CCTT	2	8	1062	1069	0 %	50 %	0 %	50 %	386858794
4	NC_017798	TCCT	2	8	1084	1091	0 %	50 %	0 %	50 %	386858794
5	NC_017798	ATCA	2	8	1201	1208	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017798	ATTT	2	8	1464	1471	25 %	75 %	0 %	0 %	386858795
7	NC_017798	GACT	2	8	1497	1504	25 %	25 %	25 %	25 %	386858795
8	NC_017798	TAAT	2	8	2146	2153	50 %	50 %	0 %	0 %	386858795
9	NC_017798	CTTT	2	8	3514	3521	0 %	75 %	0 %	25 %	386858796
10	NC_017798	TCTT	2	8	4089	4096	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017798	TTAT	2	8	4114	4121	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017798	CACT	2	8	4391	4398	25 %	25 %	0 %	50 %	386858798
13	NC_017798	CTTT	2	8	4832	4839	0 %	75 %	0 %	25 %	386858798
14	NC_017798	ACCT	2	8	4887	4894	25 %	25 %	0 %	50 %	386858798
15	NC_017798	CTTG	2	8	5025	5032	0 %	50 %	25 %	25 %	386858798
16	NC_017798	TTCT	3	12	5329	5340	0 %	75 %	0 %	25 %	386858798
17	NC_017798	CACT	2	8	6097	6104	25 %	25 %	0 %	50 %	386858799
18	NC_017798	ATGC	2	8	6852	6859	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017798	TTTA	2	8	7130	7137	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017798	ACTT	2	8	7161	7168	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017798	TTAT	2	8	7246	7253	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017798	ATTT	2	8	7274	7281	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017798	ATTT	2	8	8223	8230	25 %	75 %	0 %	0 %	386858800
24	NC_017798	TACA	2	8	9851	9858	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017798	TAAT	2	8	10046	10053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017798	ATTT	2	8	10208	10215	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017798	ACAA	2	8	10440	10447	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017798	TAAA	2	8	10592	10599	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017798	AATA	2	8	12622	12629	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017798	AAAT	2	8	12818	12825	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017798	ATTA	2	8	12937	12944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017798	TAAT	3	12	12957	12968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017798	ATAA	2	8	13442	13449	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017798	ACCA	2	8	14411	14418	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017798	CTAC	2	8	14454	14461	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017798	AAAT	2	8	14532	14539	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017798	ATTC	2	8	14765	14772	25 %	50 %	0 %	25 %	386858802
38	NC_017798	TTAC	2	8	14812	14819	25 %	50 %	0 %	25 %	386858802
39	NC_017798	GTTT	2	8	14824	14831	0 %	75 %	25 %	0 %	386858802
40	NC_017798	TATT	2	8	15021	15028	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017798	AAAT	2	8	15095	15102	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017798	TTAT	2	8	15280	15287	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017798	AACA	2	8	15468	15475	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017798	AAGA	2	8	16444	16451	75 %	0 %	25 %	0 %	386858803
45	NC_017798	ATCA	2	8	16816	16823	50 %	25 %	0 %	25 %	386858804
46	NC_017798	AATC	2	8	17088	17095	50 %	25 %	0 %	25 %	386858804
47	NC_017798	TATT	2	8	17558	17565	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017798	GATG	2	8	18044	18051	25 %	25 %	50 %	0 %	386858805
49	NC_017798	AAGA	2	8	18066	18073	75 %	0 %	25 %	0 %	386858805
50	NC_017798	TATT	2	8	18149	18156	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017798	TTAA	2	8	18275	18282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017798	TTAG	2	8	18291	18298	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017798	TTAA	2	8	18304	18311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.