MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 138

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017797	T	6	6	18	23	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017797	A	6	6	79	84	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017797	A	6	6	99	104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017797	A	6	6	142	147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017797	A	7	7	267	273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017797	T	6	6	670	675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017797	T	6	6	971	976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017797	A	6	6	2076	2081	100 %	0 %	0 %	0 %	386859204
9	NC_017797	C	7	7	2161	2167	0 %	0 %	0 %	100 %	386859204
10	NC_017797	N	593	593	2220	2812	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017797	A	6	6	2874	2879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017797	T	6	6	3109	3114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017797	A	6	6	3168	3173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017797	A	6	6	3328	3333	100 %	0 %	0 %	0 %	386859205
15	NC_017797	A	6	6	3429	3434	100 %	0 %	0 %	0 %	386859205
16	NC_017797	A	6	6	3748	3753	100 %	0 %	0 %	0 %	386859205
17	NC_017797	A	6	6	3825	3830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017797	A	6	6	3881	3886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017797	T	9	9	4038	4046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017797	T	6	6	4055	4060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017797	A	8	8	4201	4208	100 %	0 %	0 %	0 %	386859206
22	NC_017797	T	7	7	4696	4702	0 %	100 %	0 %	0 %	386859206
23	NC_017797	A	6	6	4862	4867	100 %	0 %	0 %	0 %	386859207
24	NC_017797	A	6	6	4906	4911	100 %	0 %	0 %	0 %	386859207
25	NC_017797	T	6	6	4939	4944	0 %	100 %	0 %	0 %	386859207
26	NC_017797	T	6	6	5313	5318	0 %	100 %	0 %	0 %	386859207
27	NC_017797	T	7	7	5339	5345	0 %	100 %	0 %	0 %	386859207
28	NC_017797	A	6	6	5457	5462	100 %	0 %	0 %	0 %	386859207
29	NC_017797	T	7	7	5634	5640	0 %	100 %	0 %	0 %	386859208
30	NC_017797	A	6	6	5686	5691	100 %	0 %	0 %	0 %	386859208
31	NC_017797	T	6	6	5699	5704	0 %	100 %	0 %	0 %	386859208
32	NC_017797	T	7	7	5968	5974	0 %	100 %	0 %	0 %	386859209
33	NC_017797	A	7	7	5999	6005	100 %	0 %	0 %	0 %	386859209
34	NC_017797	T	6	6	6121	6126	0 %	100 %	0 %	0 %	386859210
35	NC_017797	T	8	8	6331	6338	0 %	100 %	0 %	0 %	386859210
36	NC_017797	A	6	6	6351	6356	100 %	0 %	0 %	0 %	386859210
37	NC_017797	T	8	8	6529	6536	0 %	100 %	0 %	0 %	386859210
38	NC_017797	T	6	6	6576	6581	0 %	100 %	0 %	0 %	386859210
39	NC_017797	T	7	7	6691	6697	0 %	100 %	0 %	0 %	386859210
40	NC_017797	T	6	6	6781	6786	0 %	100 %	0 %	0 %	386859210
41	NC_017797	T	6	6	6821	6826	0 %	100 %	0 %	0 %	386859210
42	NC_017797	T	7	7	6880	6886	0 %	100 %	0 %	0 %	386859210
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44	NC_017797	T	8	8	7319	7326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017797	T	8	8	7341	7348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017797	T	6	6	7375	7380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017797	T	6	6	7629	7634	0 %	100 %	0 %	0 %	386859211
48	NC_017797	A	6	6	7687	7692	100 %	0 %	0 %	0 %	386859211
49	NC_017797	A	6	6	7725	7730	100 %	0 %	0 %	0 %	386859211
50	NC_017797	A	9	9	7977	7985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017797	A	6	6	8063	8068	100 %	0 %	0 %	0 %	386859212
52	NC_017797	A	6	6	8086	8091	100 %	0 %	0 %	0 %	386859212
53	NC_017797	A	6	6	8097	8102	100 %	0 %	0 %	0 %	386859212
54	NC_017797	T	7	7	8315	8321	0 %	100 %	0 %	0 %	386859212
55	NC_017797	A	6	6	8583	8588	100 %	0 %	0 %	0 %	386859212
56	NC_017797	T	7	7	9433	9439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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58	NC_017797	T	7	7	9638	9644	0 %	100 %	0 %	0 %	386859213
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60	NC_017797	T	6	6	9751	9756	0 %	100 %	0 %	0 %	386859213
61	NC_017797	T	7	7	9803	9809	0 %	100 %	0 %	0 %	386859213
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67	NC_017797	T	6	6	10272	10277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017797	T	6	6	10361	10366	0 %	100 %	0 %	0 %	386859215
69	NC_017797	T	6	6	10913	10918	0 %	100 %	0 %	0 %	386859215
70	NC_017797	A	7	7	10997	11003	100 %	0 %	0 %	0 %	386859215
71	NC_017797	A	6	6	11339	11344	100 %	0 %	0 %	0 %	386859215
72	NC_017797	A	6	6	11443	11448	100 %	0 %	0 %	0 %	386859215
73	NC_017797	T	6	6	11740	11745	0 %	100 %	0 %	0 %	386859215
74	NC_017797	T	6	6	12115	12120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017797	T	6	6	12219	12224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017797	T	6	6	12303	12308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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109	NC_017797	T	6	6	16681	16686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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112	NC_017797	T	6	6	17810	17815	0 %	100 %	0 %	0 %	386859220
113	NC_017797	T	6	6	17876	17881	0 %	100 %	0 %	0 %	386859220
114	NC_017797	A	6	6	17896	17901	100 %	0 %	0 %	0 %	386859220
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117	NC_017797	T	6	6	18083	18088	0 %	100 %	0 %	0 %	386859220
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119	NC_017797	T	7	7	18266	18272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017797	T	7	7	18386	18392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017797	N	202	202	18652	18853	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017797	A	6	6	18866	18871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017797	T	6	6	19283	19288	0 %	100 %	0 %	0 %	386859221
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130	NC_017797	A	7	7	22163	22169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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132	NC_017797	T	6	6	22328	22333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017797	A	6	6	22564	22569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017797	A	7	7	22652	22658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017797	T	8	8	22681	22688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017797	A	6	6	22987	22992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017797	A	9	9	23320	23328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017797	A	6	6	23330	23335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.