MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017796	TCTTA	2	10	1816	1825	20 %	60 %	0 %	20 %	386858763
2	NC_017796	ATTAA	2	10	1856	1865	60 %	40 %	0 %	0 %	386858763
3	NC_017796	TCACT	2	10	2418	2427	20 %	40 %	0 %	40 %	386858763
4	NC_017796	ATTTA	2	10	2500	2509	40 %	60 %	0 %	0 %	386858763
5	NC_017796	TTCTT	2	10	3266	3275	0 %	80 %	0 %	20 %	386858765
6	NC_017796	TTCTT	2	10	5994	6003	0 %	80 %	0 %	20 %	386858767
7	NC_017796	ACTTT	2	10	7445	7454	20 %	60 %	0 %	20 %	386858768
8	NC_017796	TCACT	2	10	10428	10437	20 %	40 %	0 %	40 %	386858772
9	NC_017796	TCTAT	2	10	10486	10495	20 %	60 %	0 %	20 %	386858772
10	NC_017796	TCATT	2	10	10571	10580	20 %	60 %	0 %	20 %	386858772
11	NC_017796	TCCTC	2	10	15316	15325	0 %	40 %	0 %	60 %	386858777
12	NC_017796	TTCCT	2	10	19802	19811	0 %	60 %	0 %	40 %	386858782
13	NC_017796	TTATC	2	10	22285	22294	20 %	60 %	0 %	20 %	386858785
14	NC_017796	ATTTA	2	10	24523	24532	40 %	60 %	0 %	0 %	386858787
15	NC_017796	AAATG	2	10	25066	25075	60 %	20 %	20 %	0 %	386858788
16	NC_017796	ATTTT	2	10	25076	25085	20 %	80 %	0 %	0 %	386858788
17	NC_017796	GATAA	2	10	26761	26770	60 %	20 %	20 %	0 %	386858791
18	NC_017796	AAAAC	2	10	28465	28474	80 %	0 %	0 %	20 %	386858792

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.