MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017796	TTAT	2	8	1258	1265	25 %	75 %	0 %	0 %	386858761
2	NC_017796	GAGG	2	8	1501	1508	25 %	0 %	75 %	0 %	386858762
3	NC_017796	TGTT	2	8	1514	1521	0 %	75 %	25 %	0 %	386858762
4	NC_017796	TGAT	2	8	1535	1542	25 %	50 %	25 %	0 %	386858762
5	NC_017796	TACT	2	8	1836	1843	25 %	50 %	0 %	25 %	386858763
6	NC_017796	ATCA	2	8	2107	2114	50 %	25 %	0 %	25 %	386858763
7	NC_017796	AGCT	2	8	2146	2153	25 %	25 %	25 %	25 %	386858763
8	NC_017796	TATT	2	8	5245	5252	25 %	75 %	0 %	0 %	386858766
9	NC_017796	ATCA	2	8	5936	5943	50 %	25 %	0 %	25 %	386858767
10	NC_017796	ATTA	2	8	6680	6687	50 %	50 %	0 %	0 %	386858768
11	NC_017796	TCTT	2	8	8165	8172	0 %	75 %	0 %	25 %	386858769
12	NC_017796	CTTA	2	8	8614	8621	25 %	50 %	0 %	25 %	386858769
13	NC_017796	CTTT	2	8	9977	9984	0 %	75 %	0 %	25 %	386858771
14	NC_017796	TTAA	2	8	11868	11875	50 %	50 %	0 %	0 %	386858774
15	NC_017796	ACCT	2	8	12596	12603	25 %	25 %	0 %	50 %	386858775
16	NC_017796	ACTA	2	8	14397	14404	50 %	25 %	0 %	25 %	386858777
17	NC_017796	TAGT	2	8	14486	14493	25 %	50 %	25 %	0 %	386858777
18	NC_017796	TCCC	2	8	14582	14589	0 %	25 %	0 %	75 %	386858777
19	NC_017796	CTTT	2	8	14741	14748	0 %	75 %	0 %	25 %	386858777
20	NC_017796	TTAC	2	8	15274	15281	25 %	50 %	0 %	25 %	386858777
21	NC_017796	AACT	2	8	16010	16017	50 %	25 %	0 %	25 %	386858779
22	NC_017796	TTTC	2	8	16073	16080	0 %	75 %	0 %	25 %	386858779
23	NC_017796	AATT	2	8	16108	16115	50 %	50 %	0 %	0 %	386858779
24	NC_017796	TACT	2	8	16171	16178	25 %	50 %	0 %	25 %	386858779
25	NC_017796	CCTT	2	8	16207	16214	0 %	50 %	0 %	50 %	386858779
26	NC_017796	TCCT	2	8	16229	16236	0 %	50 %	0 %	50 %	386858779
27	NC_017796	ATTT	2	8	16686	16693	25 %	75 %	0 %	0 %	386858780
28	NC_017796	CTTT	2	8	16913	16920	0 %	75 %	0 %	25 %	386858780
29	NC_017796	TTGC	2	8	17124	17131	0 %	50 %	25 %	25 %	386858780
30	NC_017796	CTTT	2	8	17145	17152	0 %	75 %	0 %	25 %	386858780
31	NC_017796	ATTT	2	8	19472	19479	25 %	75 %	0 %	0 %	386858782
32	NC_017796	TTTC	2	8	19784	19791	0 %	75 %	0 %	25 %	386858782
33	NC_017796	ATCA	2	8	20559	20566	50 %	25 %	0 %	25 %	386858783
34	NC_017796	TTAG	2	8	20848	20855	25 %	50 %	25 %	0 %	386858783
35	NC_017796	TAAA	2	8	23429	23436	75 %	25 %	0 %	0 %	386858786
36	NC_017796	CCTT	2	8	23557	23564	0 %	50 %	0 %	50 %	386858786
37	NC_017796	TCTT	2	8	23838	23845	0 %	75 %	0 %	25 %	386858786
38	NC_017796	TTTA	2	8	24061	24068	25 %	75 %	0 %	0 %	386858787
39	NC_017796	TATT	2	8	24447	24454	25 %	75 %	0 %	0 %	386858787
40	NC_017796	TTTA	2	8	24556	24563	25 %	75 %	0 %	0 %	386858787
41	NC_017796	TAAA	2	8	24872	24879	75 %	25 %	0 %	0 %	386858788
42	NC_017796	AAAC	2	8	25095	25102	75 %	0 %	0 %	25 %	386858788
43	NC_017796	TAAG	2	8	26736	26743	50 %	25 %	25 %	0 %	386858791
44	NC_017796	AAAT	2	8	27919	27926	75 %	25 %	0 %	0 %	386858792
45	NC_017796	AATA	2	8	28064	28071	75 %	25 %	0 %	0 %	386858792
46	NC_017796	CAAT	2	8	28092	28099	50 %	25 %	0 %	25 %	386858792
47	NC_017796	ATAA	2	8	28560	28567	75 %	25 %	0 %	0 %	386858792

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.