MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 475

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017796	TCC	2	6	39	44	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_017796	CAA	2	6	99	104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017796	TCT	2	6	176	181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017796	AGA	2	6	292	297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017796	AAT	2	6	302	307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017796	TTA	2	6	320	325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017796	TCA	2	6	326	331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017796	TTA	3	9	344	352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017796	TCC	2	6	404	409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_017796	CAT	2	6	456	461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017796	TTA	2	6	498	503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017796	TTA	2	6	539	544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017796	TCT	2	6	551	556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017796	TCA	2	6	566	571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017796	ATT	2	6	580	585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017796	ACA	2	6	587	592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017796	TAT	2	6	621	626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017796	AAT	2	6	629	634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017796	TAA	2	6	670	675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017796	CTT	2	6	707	712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017796	TAA	2	6	719	724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017796	ATT	2	6	881	886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017796	TTA	2	6	890	895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017796	ATT	2	6	945	950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017796	ACT	2	6	977	982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017796	TAT	2	6	1006	1011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017796	TTA	2	6	1136	1141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017796	TTA	2	6	1374	1379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017796	ATG	2	6	1523	1528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858762
30	NC_017796	ATA	2	6	1637	1642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017796	GAG	2	6	1689	1694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017796	TAG	2	6	1734	1739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858763
33	NC_017796	AGT	2	6	1750	1755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858763
34	NC_017796	ATT	2	6	1924	1929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858763
35	NC_017796	CTA	2	6	1980	1985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858763
36	NC_017796	ACC	2	6	2026	2031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858763
37	NC_017796	CAT	2	6	2049	2054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858763
38	NC_017796	CCT	2	6	2139	2144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858763
39	NC_017796	AGC	4	12	2167	2178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858763
40	NC_017796	CAG	2	6	2193	2198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858763
41	NC_017796	CAG	2	6	2214	2219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858763
42	NC_017796	CAG	2	6	2232	2237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858763
43	NC_017796	GCA	2	6	2336	2341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858763
44	NC_017796	CAG	2	6	2343	2348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858763
45	NC_017796	TAA	2	6	2436	2441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858763
46	NC_017796	CAA	2	6	2628	2633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858764
47	NC_017796	TAT	2	6	2731	2736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858764
48	NC_017796	CAG	3	9	2740	2748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858764
49	NC_017796	CAC	2	6	2878	2883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858764
50	NC_017796	CTT	2	6	2921	2926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858764
51	NC_017796	AGC	2	6	2951	2956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858764
52	NC_017796	AAC	2	6	2961	2966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858764
53	NC_017796	CAG	3	9	2983	2991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858764
54	NC_017796	ATC	2	6	3026	3031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858764
55	NC_017796	CAT	2	6	3037	3042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858764
56	NC_017796	CTT	2	6	3049	3054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858764
57	NC_017796	CTA	2	6	3067	3072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017796	CTA	2	6	3088	3093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858765
59	NC_017796	CAA	2	6	3109	3114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858765
60	NC_017796	ATC	2	6	3152	3157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858765
61	NC_017796	TAT	2	6	3199	3204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858765
62	NC_017796	ATC	2	6	3283	3288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858765
63	NC_017796	TTA	2	6	3296	3301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858765
64	NC_017796	ATG	2	6	3414	3419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858765
65	NC_017796	CCA	2	6	3450	3455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858765
66	NC_017796	TCC	2	6	3487	3492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858765
67	NC_017796	CTC	2	6	3498	3503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858765
68	NC_017796	CAC	4	12	3520	3531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858765
69	NC_017796	CAT	3	9	3532	3540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858765
70	NC_017796	ATC	2	6	3542	3547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858765
71	NC_017796	ATC	2	6	3566	3571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858765
72	NC_017796	TTC	2	6	3587	3592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858765
73	NC_017796	TTA	2	6	5030	5035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017796	ATA	2	6	5104	5109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017796	ATT	2	6	5221	5226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017796	TAC	2	6	5280	5285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858766
77	NC_017796	GCA	2	6	5290	5295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858766
78	NC_017796	CTT	2	6	5315	5320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858766
79	NC_017796	TCA	2	6	5338	5343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858766
80	NC_017796	ATT	2	6	5386	5391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858766
81	NC_017796	CTG	2	6	5399	5404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858766
82	NC_017796	GCA	2	6	5416	5421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858766
83	NC_017796	CAT	2	6	5426	5431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858766
84	NC_017796	GCA	2	6	5437	5442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858766
85	NC_017796	CTC	2	6	5489	5494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858766
86	NC_017796	TTG	2	6	5501	5506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858766
87	NC_017796	CAC	2	6	5558	5563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858766
88	NC_017796	TGC	2	6	5619	5624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858766
89	NC_017796	ATT	2	6	5646	5651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017796	AAT	2	6	5683	5688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017796	CAG	2	6	5708	5713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017796	TAC	2	6	5787	5792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017796	CAG	2	6	5840	5845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017796	TAG	2	6	5858	5863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017796	TAT	2	6	5927	5932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858767
96	NC_017796	CAA	2	6	6016	6021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858767
97	NC_017796	TTA	2	6	6024	6029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858767
98	NC_017796	TCA	3	9	6394	6402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017796	ATT	2	6	6405	6410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017796	CTT	2	6	6478	6483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017796	CCT	2	6	6508	6513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_017796	AGA	2	6	6562	6567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017796	AAT	2	6	6638	6643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017796	TTC	2	6	6846	6851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858768
105	NC_017796	AGC	2	6	6861	6866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858768
106	NC_017796	CCT	2	6	6904	6909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858768
107	NC_017796	AGC	2	6	6954	6959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858768
108	NC_017796	CAC	2	6	7064	7069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858768
109	NC_017796	ACT	2	6	7072	7077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858768
110	NC_017796	TGC	2	6	7092	7097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858768
111	NC_017796	CAG	2	6	7121	7126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858768
112	NC_017796	TAG	2	6	7178	7183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858768
113	NC_017796	CTG	2	6	7268	7273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858768
114	NC_017796	TGC	2	6	7275	7280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858768
115	NC_017796	CAG	2	6	7289	7294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858768
116	NC_017796	CAT	2	6	7313	7318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858768
117	NC_017796	TGC	2	6	7335	7340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858768
118	NC_017796	CTG	2	6	7352	7357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858768
119	NC_017796	TAA	2	6	7379	7384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858768
120	NC_017796	TTC	2	6	7423	7428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858768
121	NC_017796	AGT	2	6	7455	7460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858768
122	NC_017796	CTT	2	6	7506	7511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858768
123	NC_017796	CAT	2	6	7653	7658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858768
124	NC_017796	TAC	2	6	7671	7676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858768
125	NC_017796	CTT	2	6	7700	7705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858768
126	NC_017796	TTC	2	6	7718	7723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858768
127	NC_017796	CCT	2	6	7727	7732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858768
128	NC_017796	ATT	2	6	7867	7872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017796	TTC	2	6	8092	8097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858769
130	NC_017796	TCC	2	6	8116	8121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858769
131	NC_017796	CCT	2	6	8147	8152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858769
132	NC_017796	CTT	2	6	8194	8199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858769
133	NC_017796	ATC	2	6	8200	8205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858769
134	NC_017796	ATT	2	6	8263	8268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858769
135	NC_017796	TCT	2	6	8279	8284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858769
136	NC_017796	TGC	4	12	8344	8355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858769
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138	NC_017796	CAT	2	6	8370	8375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858769
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146	NC_017796	CTC	2	6	8944	8949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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