MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017796	CT	3	6	153	158	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017796	AT	3	6	994	999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017796	TA	3	6	1271	1276	50 %	50 %	0 %	0 %	386858761
4	NC_017796	TA	3	6	1292	1297	50 %	50 %	0 %	0 %	386858761
5	NC_017796	AT	3	6	1366	1371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017796	TA	4	8	1456	1463	50 %	50 %	0 %	0 %	386858762
7	NC_017796	TC	3	6	1485	1490	0 %	50 %	0 %	50 %	386858762
8	NC_017796	AT	3	6	1598	1603	50 %	50 %	0 %	0 %	386858762
9	NC_017796	TC	3	6	3474	3479	0 %	50 %	0 %	50 %	386858765
10	NC_017796	TC	3	6	3570	3575	0 %	50 %	0 %	50 %	386858765
11	NC_017796	AT	4	8	5129	5136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017796	AC	3	6	5144	5149	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017796	CT	3	6	5970	5975	0 %	50 %	0 %	50 %	386858767
14	NC_017796	CT	3	6	6034	6039	0 %	50 %	0 %	50 %	386858767
15	NC_017796	CT	4	8	6433	6440	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017796	CT	5	10	6445	6454	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017796	CT	3	6	6457	6462	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017796	TC	3	6	6549	6554	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017796	CT	3	6	6616	6621	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017796	AT	3	6	6650	6655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017796	TA	4	8	6657	6664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017796	TC	3	6	6719	6724	0 %	50 %	0 %	50 %	386858768
23	NC_017796	AT	3	6	7055	7060	50 %	50 %	0 %	0 %	386858768
24	NC_017796	TC	3	6	7706	7711	0 %	50 %	0 %	50 %	386858768
25	NC_017796	TA	3	6	7806	7811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017796	AT	3	6	7897	7902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017796	TC	3	6	7965	7970	0 %	50 %	0 %	50 %	386858769
28	NC_017796	AT	3	6	8307	8312	50 %	50 %	0 %	0 %	386858769
29	NC_017796	CT	4	8	10563	10570	0 %	50 %	0 %	50 %	386858772
30	NC_017796	TC	3	6	10611	10616	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017796	TA	3	6	10642	10647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017796	AT	3	6	10986	10991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017796	TA	3	6	11107	11112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017796	AT	3	6	11614	11619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017796	TA	3	6	11675	11680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017796	TA	3	6	11688	11693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017796	AT	3	6	11763	11768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017796	TC	3	6	13473	13478	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017796	CA	3	6	13825	13830	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017796	CT	3	6	13991	13996	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017796	CT	3	6	14000	14005	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017796	TC	3	6	14189	14194	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017796	AT	3	6	14690	14695	50 %	50 %	0 %	0 %	386858777
44	NC_017796	TC	4	8	15390	15397	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017796	TC	3	6	15418	15423	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017796	TC	5	10	16342	16351	0 %	50 %	0 %	50 %	386858779
47	NC_017796	TC	3	6	16356	16361	0 %	50 %	0 %	50 %	386858779
48	NC_017796	TC	3	6	16377	16382	0 %	50 %	0 %	50 %	386858779
49	NC_017796	TA	3	6	16468	16473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017796	CT	3	6	16514	16519	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017796	CT	3	6	16600	16605	0 %	50 %	0 %	50 %	386858780
52	NC_017796	CT	3	6	17489	17494	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017796	TC	3	6	18679	18684	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017796	CT	3	6	18689	18694	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017796	TA	3	6	18799	18804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017796	TC	3	6	19745	19750	0 %	50 %	0 %	50 %	386858782
57	NC_017796	CT	3	6	19920	19925	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017796	TC	3	6	20267	20272	0 %	50 %	0 %	50 %	386858783
59	NC_017796	CT	3	6	21269	21274	0 %	50 %	0 %	50 %	386858784
60	NC_017796	TC	3	6	21287	21292	0 %	50 %	0 %	50 %	386858784
61	NC_017796	TC	3	6	21314	21319	0 %	50 %	0 %	50 %	386858784
62	NC_017796	TA	3	6	21577	21582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017796	AT	3	6	21943	21948	50 %	50 %	0 %	0 %	386858785
64	NC_017796	TA	3	6	22606	22611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017796	TA	3	6	23184	23189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017796	TA	3	6	23327	23332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017796	TC	3	6	23850	23855	0 %	50 %	0 %	50 %	386858786
68	NC_017796	AT	3	6	24033	24038	50 %	50 %	0 %	0 %	386858787
69	NC_017796	CT	3	6	24109	24114	0 %	50 %	0 %	50 %	386858787
70	NC_017796	AC	3	6	24313	24318	50 %	0 %	0 %	50 %	386858787
71	NC_017796	AT	4	8	24547	24554	50 %	50 %	0 %	0 %	386858787
72	NC_017796	TA	3	6	24933	24938	50 %	50 %	0 %	0 %	386858788
73	NC_017796	AT	3	6	25476	25481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017796	TA	3	6	25757	25762	50 %	50 %	0 %	0 %	386858789
75	NC_017796	AT	3	6	25892	25897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017796	TA	4	8	25948	25955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017796	TA	3	6	25990	25995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017796	AT	3	6	26222	26227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017796	TA	3	6	27070	27075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017796	AT	3	6	27153	27158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017796	TA	4	8	27660	27667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017796	AT	3	6	27706	27711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017796	AT	3	6	27755	27760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017796	TA	3	6	28503	28508	50 %	50 %	0 %	0 %	386858792

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.