MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017794	ATAAA	2	10	164	173	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017794	TTTTA	2	10	227	236	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017794	TACTT	2	10	1630	1639	20 %	60 %	0 %	20 %	386858928
4	NC_017794	TCACT	2	10	2406	2415	20 %	40 %	0 %	40 %	386858929
5	NC_017794	AAAAT	2	10	2856	2865	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017794	TCTTA	2	10	2942	2951	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017794	TCCTT	2	10	3644	3653	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_017794	TCTCC	2	10	4447	4456	0 %	40 %	0 %	60 %	386858933
9	NC_017794	TACTT	2	10	6438	6447	20 %	60 %	0 %	20 %	386858934
10	NC_017794	CTTTT	2	10	6806	6815	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017794	ACATA	2	10	6878	6887	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017794	CTATT	2	10	9367	9376	20 %	60 %	0 %	20 %	386858938
13	NC_017794	CTTTT	2	10	9496	9505	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017794	ATAAG	2	10	10947	10956	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017794	TAAAA	2	10	11005	11014	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017794	ATATA	2	10	11318	11327	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017794	TAAAT	2	10	12639	12648	60 %	40 %	0 %	0 %	386858940
18	NC_017794	TATCT	2	10	13325	13334	20 %	60 %	0 %	20 %	386858941
19	NC_017794	ACATA	2	10	14577	14586	60 %	20 %	0 %	20 %	386858942
20	NC_017794	TAAAT	2	10	15300	15309	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017794	ATTTT	2	10	15707	15716	20 %	80 %	0 %	0 %	386858944
22	NC_017794	AGATA	2	10	16613	16622	60 %	20 %	20 %	0 %	386858945
23	NC_017794	GGAAG	2	10	17545	17554	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017794	AGATA	2	10	17818	17827	60 %	20 %	20 %	0 %	386858946

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.