MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017794	TGAT	2	8	30	37	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017794	ATAA	2	8	178	185	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017794	TTAC	2	8	873	880	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017794	CTGT	2	8	933	940	0 %	50 %	25 %	25 %	386858928
5	NC_017794	TTTA	2	8	994	1001	25 %	75 %	0 %	0 %	386858928
6	NC_017794	TTGC	2	8	1584	1591	0 %	50 %	25 %	25 %	386858928
7	NC_017794	TCCT	2	8	1840	1847	0 %	50 %	0 %	50 %	386858928
8	NC_017794	ATCA	2	8	2092	2099	50 %	25 %	0 %	25 %	386858929
9	NC_017794	CTTT	2	8	2769	2776	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017794	TAAC	2	8	2839	2846	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017794	TTTA	2	8	2934	2941	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017794	TATT	2	8	3555	3562	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017794	TCTT	2	8	3600	3607	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017794	CTTC	2	8	3628	3635	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017794	TTTA	2	8	4195	4202	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017794	CTTT	2	8	4645	4652	0 %	75 %	0 %	25 %	386858933
17	NC_017794	ACCT	2	8	4700	4707	25 %	25 %	0 %	50 %	386858933
18	NC_017794	TTAT	2	8	5373	5380	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017794	TTAA	2	8	5427	5434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017794	AACA	2	8	5479	5486	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017794	ATTT	2	8	5608	5615	25 %	75 %	0 %	0 %	386858934
22	NC_017794	ATCA	2	8	5988	5995	50 %	25 %	0 %	25 %	386858934
23	NC_017794	GCAA	2	8	6067	6074	50 %	0 %	25 %	25 %	386858934
24	NC_017794	TTAT	2	8	7048	7055	25 %	75 %	0 %	0 %	386858935
25	NC_017794	CTTA	2	8	7113	7120	25 %	50 %	0 %	25 %	386858935
26	NC_017794	TCTT	2	8	7240	7247	0 %	75 %	0 %	25 %	386858935
27	NC_017794	TTTC	2	8	7265	7272	0 %	75 %	0 %	25 %	386858935
28	NC_017794	TTTC	2	8	8084	8091	0 %	75 %	0 %	25 %	386858935
29	NC_017794	AAAT	2	8	8167	8174	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017794	TAAA	2	8	8203	8210	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017794	ATCT	2	8	8345	8352	25 %	50 %	0 %	25 %	386858936
32	NC_017794	ACCT	2	8	9080	9087	25 %	25 %	0 %	50 %	386858936
33	NC_017794	ATGA	2	8	9543	9550	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017794	AAAC	2	8	9697	9704	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017794	TATT	2	8	10344	10351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017794	TATT	2	8	10354	10361	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017794	ATTA	2	8	10449	10456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017794	AGCT	2	8	10576	10583	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017794	ACTC	2	8	10754	10761	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017794	TTAA	2	8	10887	10894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017794	TTAA	2	8	10914	10921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017794	GTTA	2	8	11080	11087	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017794	TTAA	2	8	11371	11378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017794	GAAT	2	8	11419	11426	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017794	AATT	2	8	11446	11453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017794	TTAT	2	8	12182	12189	25 %	75 %	0 %	0 %	386858939
47	NC_017794	TATC	2	8	12875	12882	25 %	50 %	0 %	25 %	386858940
48	NC_017794	AAAT	2	8	13307	13314	75 %	25 %	0 %	0 %	386858941
49	NC_017794	TAAA	2	8	13339	13346	75 %	25 %	0 %	0 %	386858941
50	NC_017794	TTAA	2	8	13544	13551	50 %	50 %	0 %	0 %	386858942
51	NC_017794	ATTG	2	8	13624	13631	25 %	50 %	25 %	0 %	386858942
52	NC_017794	TGTC	2	8	13662	13669	0 %	50 %	25 %	25 %	386858942
53	NC_017794	TGTT	2	8	13699	13706	0 %	75 %	25 %	0 %	386858942
54	NC_017794	TGTT	2	8	13760	13767	0 %	75 %	25 %	0 %	386858942
55	NC_017794	GTTT	2	8	13999	14006	0 %	75 %	25 %	0 %	386858942
56	NC_017794	GAAA	2	8	14127	14134	75 %	0 %	25 %	0 %	386858942
57	NC_017794	TATT	2	8	14337	14344	25 %	75 %	0 %	0 %	386858942
58	NC_017794	TGCT	2	8	14619	14626	0 %	50 %	25 %	25 %	386858942
59	NC_017794	ACTT	2	8	14971	14978	25 %	50 %	0 %	25 %	386858943
60	NC_017794	CGAT	2	8	15498	15505	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017794	TTAA	2	8	15738	15745	50 %	50 %	0 %	0 %	386858944
62	NC_017794	ATTA	2	8	15839	15846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017794	ATCC	5	20	15933	15952	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017794	GAAA	2	8	16035	16042	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017794	TGAG	2	8	16375	16382	25 %	25 %	50 %	0 %	386858945
66	NC_017794	AAGG	2	8	17100	17107	50 %	0 %	50 %	0 %	386858945
67	NC_017794	ATAA	2	8	17244	17251	75 %	25 %	0 %	0 %	386858945
68	NC_017794	ATTA	2	8	17345	17352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.