MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017794	CTGT	2	8	933	940	0 %	50 %	25 %	25 %	386858928
2	NC_017794	TTTA	2	8	994	1001	25 %	75 %	0 %	0 %	386858928
3	NC_017794	TTGC	2	8	1584	1591	0 %	50 %	25 %	25 %	386858928
4	NC_017794	TCCT	2	8	1840	1847	0 %	50 %	0 %	50 %	386858928
5	NC_017794	ATCA	2	8	2092	2099	50 %	25 %	0 %	25 %	386858929
6	NC_017794	CTTT	2	8	4645	4652	0 %	75 %	0 %	25 %	386858933
7	NC_017794	ACCT	2	8	4700	4707	25 %	25 %	0 %	50 %	386858933
8	NC_017794	ATTT	2	8	5608	5615	25 %	75 %	0 %	0 %	386858934
9	NC_017794	ATCA	2	8	5988	5995	50 %	25 %	0 %	25 %	386858934
10	NC_017794	GCAA	2	8	6067	6074	50 %	0 %	25 %	25 %	386858934
11	NC_017794	TTAT	2	8	7048	7055	25 %	75 %	0 %	0 %	386858935
12	NC_017794	CTTA	2	8	7113	7120	25 %	50 %	0 %	25 %	386858935
13	NC_017794	TCTT	2	8	7240	7247	0 %	75 %	0 %	25 %	386858935
14	NC_017794	TTTC	2	8	7265	7272	0 %	75 %	0 %	25 %	386858935
15	NC_017794	TTTC	2	8	8084	8091	0 %	75 %	0 %	25 %	386858935
16	NC_017794	ATCT	2	8	8345	8352	25 %	50 %	0 %	25 %	386858936
17	NC_017794	ACCT	2	8	9080	9087	25 %	25 %	0 %	50 %	386858936
18	NC_017794	TTAT	2	8	12182	12189	25 %	75 %	0 %	0 %	386858939
19	NC_017794	TATC	2	8	12875	12882	25 %	50 %	0 %	25 %	386858940
20	NC_017794	AAAT	2	8	13307	13314	75 %	25 %	0 %	0 %	386858941
21	NC_017794	TAAA	2	8	13339	13346	75 %	25 %	0 %	0 %	386858941
22	NC_017794	TTAA	2	8	13544	13551	50 %	50 %	0 %	0 %	386858942
23	NC_017794	ATTG	2	8	13624	13631	25 %	50 %	25 %	0 %	386858942
24	NC_017794	TGTC	2	8	13662	13669	0 %	50 %	25 %	25 %	386858942
25	NC_017794	TGTT	2	8	13699	13706	0 %	75 %	25 %	0 %	386858942
26	NC_017794	TGTT	2	8	13760	13767	0 %	75 %	25 %	0 %	386858942
27	NC_017794	GTTT	2	8	13999	14006	0 %	75 %	25 %	0 %	386858942
28	NC_017794	GAAA	2	8	14127	14134	75 %	0 %	25 %	0 %	386858942
29	NC_017794	TATT	2	8	14337	14344	25 %	75 %	0 %	0 %	386858942
30	NC_017794	TGCT	2	8	14619	14626	0 %	50 %	25 %	25 %	386858942
31	NC_017794	ACTT	2	8	14971	14978	25 %	50 %	0 %	25 %	386858943
32	NC_017794	TTAA	2	8	15738	15745	50 %	50 %	0 %	0 %	386858944
33	NC_017794	TGAG	2	8	16375	16382	25 %	25 %	50 %	0 %	386858945
34	NC_017794	AAGG	2	8	17100	17107	50 %	0 %	50 %	0 %	386858945
35	NC_017794	ATAA	2	8	17244	17251	75 %	25 %	0 %	0 %	386858945

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.