MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 343

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017794	TCT	2	6	22	27	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017794	ATA	2	6	134	139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017794	TGC	2	6	348	353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858926
4	NC_017794	CTT	2	6	359	364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858926
5	NC_017794	TAT	2	6	378	383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858926
6	NC_017794	TAA	2	6	456	461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858926
7	NC_017794	CAG	2	6	465	470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858926
8	NC_017794	CAT	2	6	474	479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858926
9	NC_017794	TCC	2	6	500	505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_017794	CTG	3	9	641	649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858927
11	NC_017794	CTT	2	6	651	656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858927
12	NC_017794	CAG	2	6	665	670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858927
13	NC_017794	AGC	3	9	678	686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858927
14	NC_017794	TTA	2	6	865	870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017794	TAA	2	6	988	993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858928
16	NC_017794	TGC	2	6	1045	1050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858928
17	NC_017794	TCC	2	6	1096	1101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858928
18	NC_017794	CTG	2	6	1137	1142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858928
19	NC_017794	TTG	2	6	1143	1148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858928
20	NC_017794	CAA	2	6	1215	1220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858928
21	NC_017794	CTC	3	9	1317	1325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858928
22	NC_017794	TGT	2	6	1330	1335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858928
23	NC_017794	CCT	2	6	1349	1354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858928
24	NC_017794	TCT	2	6	1454	1459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858928
25	NC_017794	CTG	2	6	1482	1487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858928
26	NC_017794	TAC	2	6	1513	1518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858928
27	NC_017794	TAA	2	6	1530	1535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858928
28	NC_017794	AAG	2	6	1545	1550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858928
29	NC_017794	CTT	2	6	1558	1563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858928
30	NC_017794	TTA	2	6	1755	1760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858928
31	NC_017794	CTC	2	6	1851	1856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858928
32	NC_017794	TAT	2	6	1860	1865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858928
33	NC_017794	ATC	2	6	1877	1882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858928
34	NC_017794	ATT	2	6	1895	1900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858928
35	NC_017794	CTT	2	6	1945	1950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017794	TCT	2	6	1974	1979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017794	TAA	2	6	2020	2025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017794	ATT	2	6	2035	2040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858929
39	NC_017794	CAG	2	6	2049	2054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858929
40	NC_017794	CAG	2	6	2127	2132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858929
41	NC_017794	AGC	2	6	2140	2145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858929
42	NC_017794	CAA	2	6	2154	2159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858929
43	NC_017794	CAG	3	9	2160	2168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858929
44	NC_017794	CAA	2	6	2205	2210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858929
45	NC_017794	TAG	2	6	2253	2258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858929
46	NC_017794	CAA	2	6	2286	2291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858929
47	NC_017794	CAA	2	6	2298	2303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858929
48	NC_017794	CCG	2	6	2313	2318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386858929
49	NC_017794	CAA	2	6	2325	2330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858929
50	NC_017794	CAG	2	6	2331	2336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858929
51	NC_017794	TAA	2	6	2424	2429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017794	CAA	2	6	2517	2522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017794	CTC	2	6	2601	2606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858930
54	NC_017794	CAT	3	9	2638	2646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858930
55	NC_017794	CTT	2	6	2663	2668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858930
56	NC_017794	CTT	2	6	2725	2730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017794	CCT	2	6	2755	2760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_017794	CAA	2	6	3011	3016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017794	TAC	2	6	3132	3137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017794	AAC	2	6	3156	3161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858931
61	NC_017794	CCT	2	6	3193	3198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858931
62	NC_017794	TAA	2	6	3213	3218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858931
63	NC_017794	CTA	2	6	3227	3232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858931
64	NC_017794	GTA	2	6	3253	3258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858931
65	NC_017794	GTT	2	6	3268	3273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858931
66	NC_017794	CTA	2	6	3357	3362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858932
67	NC_017794	CTC	2	6	3441	3446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858932
68	NC_017794	CAA	2	6	3474	3479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858932
69	NC_017794	TTC	2	6	3493	3498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017794	CTT	3	9	3546	3554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017794	ATT	2	6	3568	3573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017794	ATT	2	6	3616	3621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017794	CAT	2	6	3678	3683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017794	CTG	2	6	3766	3771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017794	CTT	2	6	3804	3809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017794	TCC	2	6	3854	3859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_017794	TAA	2	6	3868	3873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017794	CTG	2	6	4087	4092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017794	CTT	2	6	4125	4130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017794	TCC	2	6	4175	4180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_017794	TAA	2	6	4189	4194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017794	TCA	3	9	4235	4243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017794	TTA	2	6	4244	4249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017794	CTG	3	9	4306	4314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858933
85	NC_017794	GCT	2	6	4320	4325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858933
86	NC_017794	CCT	2	6	4350	4355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858933
87	NC_017794	TTG	2	6	4375	4380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858933
88	NC_017794	GCT	2	6	4479	4484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858933
89	NC_017794	TTA	2	6	4542	4547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858933
90	NC_017794	CTT	2	6	4600	4605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858933
91	NC_017794	TGC	2	6	4667	4672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858933
92	NC_017794	CTC	2	6	4745	4750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858933
93	NC_017794	TGT	2	6	4829	4834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858933
94	NC_017794	TTC	2	6	4859	4864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858933
95	NC_017794	CTA	2	6	4885	4890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858933
96	NC_017794	TCT	2	6	4914	4919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858933
97	NC_017794	TTA	2	6	4932	4937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858933
98	NC_017794	CTC	2	6	4998	5003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858933
99	NC_017794	CAT	2	6	5012	5017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858933
100	NC_017794	CTC	2	6	5044	5049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858933
101	NC_017794	CTC	2	6	5071	5076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858933
102	NC_017794	CAT	2	6	5096	5101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858933
103	NC_017794	CAC	2	6	5102	5107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858933
104	NC_017794	CAT	3	9	5108	5116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858933
105	NC_017794	CTT	2	6	5130	5135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017794	TCT	2	6	5204	5209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017794	CTC	2	6	5210	5215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_017794	CTT	2	6	5223	5228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017794	TAT	2	6	5231	5236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017794	TTA	2	6	5319	5324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017794	ATC	2	6	5359	5364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017794	ATC	2	6	5392	5397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017794	AAC	2	6	5541	5546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017794	TTA	2	6	5590	5595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017794	TAG	2	6	5645	5650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858934
116	NC_017794	ATT	2	6	5734	5739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858934
117	NC_017794	TGC	2	6	5775	5780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858934
118	NC_017794	CAT	2	6	5807	5812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858934
119	NC_017794	CAT	2	6	5894	5899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858934
120	NC_017794	ACC	3	9	5910	5918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858934
121	NC_017794	AGT	2	6	5949	5954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858934
122	NC_017794	ACC	2	6	5961	5966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858934
123	NC_017794	ACC	2	6	6016	6021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858934
124	NC_017794	CAG	2	6	6023	6028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858934
125	NC_017794	AAT	2	6	6153	6158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858934
126	NC_017794	CAG	2	6	6200	6205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858934
127	NC_017794	ATT	2	6	6219	6224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858934
128	NC_017794	CTT	2	6	6248	6253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858934
129	NC_017794	AAT	2	6	6297	6302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858934
130	NC_017794	TAA	2	6	6317	6322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858934
131	NC_017794	AGA	2	6	6357	6362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858934
132	NC_017794	TAG	2	6	6395	6400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858934
133	NC_017794	AAC	2	6	6465	6470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858934
134	NC_017794	TTC	2	6	6565	6570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858934
135	NC_017794	CTC	2	6	6593	6598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858934
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.