MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 245

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017794	TGC	2	6	348	353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858926
2	NC_017794	CTT	2	6	359	364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858926
3	NC_017794	TAT	2	6	378	383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858926
4	NC_017794	TAA	2	6	456	461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858926
5	NC_017794	CAG	2	6	465	470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858926
6	NC_017794	CAT	2	6	474	479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858926
7	NC_017794	CTG	3	9	641	649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858927
8	NC_017794	CTT	2	6	651	656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858927
9	NC_017794	CAG	2	6	665	670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858927
10	NC_017794	AGC	3	9	678	686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858927
11	NC_017794	TAA	2	6	988	993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858928
12	NC_017794	TGC	2	6	1045	1050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858928
13	NC_017794	TCC	2	6	1096	1101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858928
14	NC_017794	CTG	2	6	1137	1142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858928
15	NC_017794	TTG	2	6	1143	1148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858928
16	NC_017794	CAA	2	6	1215	1220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858928
17	NC_017794	CTC	3	9	1317	1325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858928
18	NC_017794	TGT	2	6	1330	1335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858928
19	NC_017794	CCT	2	6	1349	1354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858928
20	NC_017794	TCT	2	6	1454	1459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858928
21	NC_017794	CTG	2	6	1482	1487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858928
22	NC_017794	TAC	2	6	1513	1518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858928
23	NC_017794	TAA	2	6	1530	1535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858928
24	NC_017794	AAG	2	6	1545	1550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858928
25	NC_017794	CTT	2	6	1558	1563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858928
26	NC_017794	TTA	2	6	1755	1760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858928
27	NC_017794	CTC	2	6	1851	1856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858928
28	NC_017794	TAT	2	6	1860	1865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858928
29	NC_017794	ATC	2	6	1877	1882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858928
30	NC_017794	ATT	2	6	1895	1900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858928
31	NC_017794	ATT	2	6	2035	2040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858929
32	NC_017794	CAG	2	6	2049	2054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858929
33	NC_017794	CAG	2	6	2127	2132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858929
34	NC_017794	AGC	2	6	2140	2145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858929
35	NC_017794	CAA	2	6	2154	2159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858929
36	NC_017794	CAG	3	9	2160	2168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858929
37	NC_017794	CAA	2	6	2205	2210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858929
38	NC_017794	TAG	2	6	2253	2258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858929
39	NC_017794	CAA	2	6	2286	2291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858929
40	NC_017794	CAA	2	6	2298	2303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858929
41	NC_017794	CCG	2	6	2313	2318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386858929
42	NC_017794	CAA	2	6	2325	2330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858929
43	NC_017794	CAG	2	6	2331	2336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858929
44	NC_017794	CTC	2	6	2601	2606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858930
45	NC_017794	CAT	3	9	2638	2646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858930
46	NC_017794	CTT	2	6	2663	2668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858930
47	NC_017794	AAC	2	6	3156	3161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858931
48	NC_017794	CCT	2	6	3193	3198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858931
49	NC_017794	TAA	2	6	3213	3218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858931
50	NC_017794	CTA	2	6	3227	3232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858931
51	NC_017794	GTA	2	6	3253	3258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858931
52	NC_017794	GTT	2	6	3268	3273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858931
53	NC_017794	CTA	2	6	3357	3362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858932
54	NC_017794	CTC	2	6	3441	3446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858932
55	NC_017794	CAA	2	6	3474	3479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858932
56	NC_017794	CTG	3	9	4306	4314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858933
57	NC_017794	GCT	2	6	4320	4325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858933
58	NC_017794	CCT	2	6	4350	4355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858933
59	NC_017794	TTG	2	6	4375	4380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858933
60	NC_017794	GCT	2	6	4479	4484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858933
61	NC_017794	TTA	2	6	4542	4547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858933
62	NC_017794	CTT	2	6	4600	4605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858933
63	NC_017794	TGC	2	6	4667	4672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858933
64	NC_017794	CTC	2	6	4745	4750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858933
65	NC_017794	TGT	2	6	4829	4834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858933
66	NC_017794	TTC	2	6	4859	4864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858933
67	NC_017794	CTA	2	6	4885	4890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858933
68	NC_017794	TCT	2	6	4914	4919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858933
69	NC_017794	TTA	2	6	4932	4937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858933
70	NC_017794	CTC	2	6	4998	5003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858933
71	NC_017794	CAT	2	6	5012	5017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858933
72	NC_017794	CTC	2	6	5044	5049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858933
73	NC_017794	CTC	2	6	5071	5076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858933
74	NC_017794	CAT	2	6	5096	5101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858933
75	NC_017794	CAC	2	6	5102	5107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858933
76	NC_017794	CAT	3	9	5108	5116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858933
77	NC_017794	TAG	2	6	5645	5650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858934
78	NC_017794	ATT	2	6	5734	5739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858934
79	NC_017794	TGC	2	6	5775	5780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858934
80	NC_017794	CAT	2	6	5807	5812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858934
81	NC_017794	CAT	2	6	5894	5899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858934
82	NC_017794	ACC	3	9	5910	5918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858934
83	NC_017794	AGT	2	6	5949	5954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858934
84	NC_017794	ACC	2	6	5961	5966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858934
85	NC_017794	ACC	2	6	6016	6021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858934
86	NC_017794	CAG	2	6	6023	6028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858934
87	NC_017794	AAT	2	6	6153	6158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858934
88	NC_017794	CAG	2	6	6200	6205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858934
89	NC_017794	ATT	2	6	6219	6224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858934
90	NC_017794	CTT	2	6	6248	6253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858934
91	NC_017794	AAT	2	6	6297	6302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858934
92	NC_017794	TAA	2	6	6317	6322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858934
93	NC_017794	AGA	2	6	6357	6362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858934
94	NC_017794	TAG	2	6	6395	6400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858934
95	NC_017794	AAC	2	6	6465	6470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858934
96	NC_017794	TTC	2	6	6565	6570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858934
97	NC_017794	CTC	2	6	6593	6598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858934
98	NC_017794	CAT	2	6	6636	6641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858934
99	NC_017794	TTC	2	6	6671	6676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858934
100	NC_017794	CTC	2	6	6687	6692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858934
101	NC_017794	TTC	2	6	6705	6710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858934
102	NC_017794	CTT	2	6	6755	6760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858934
103	NC_017794	TCT	2	6	6764	6769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858934
104	NC_017794	CTA	2	6	7130	7135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858935
105	NC_017794	CCT	2	6	7222	7227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858935
106	NC_017794	TAT	2	6	7331	7336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858935
107	NC_017794	TCT	2	6	7348	7353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858935
108	NC_017794	CAC	2	6	7385	7390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858935
109	NC_017794	CTT	2	6	7430	7435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858935
110	NC_017794	AAC	2	6	7462	7467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858935
111	NC_017794	TAG	2	6	7502	7507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858935
112	NC_017794	CAA	2	6	7544	7549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858935
113	NC_017794	CTG	2	6	7601	7606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858935
114	NC_017794	TAG	2	6	7619	7624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858935
115	NC_017794	CAC	2	6	7625	7630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858935
116	NC_017794	TCT	2	6	7639	7644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858935
117	NC_017794	GCT	2	6	7660	7665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858935
118	NC_017794	CTT	2	6	7827	7832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858935
119	NC_017794	TCC	2	6	7950	7955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858935
120	NC_017794	CAT	2	6	7977	7982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858935
121	NC_017794	TAT	2	6	8007	8012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858935
122	NC_017794	TCT	2	6	8013	8018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858935
123	NC_017794	TCT	2	6	8386	8391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858936
124	NC_017794	TAA	2	6	8414	8419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858936
125	NC_017794	TGC	2	6	8426	8431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858936
126	NC_017794	GCT	2	6	8433	8438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858936
127	NC_017794	TCC	2	6	8462	8467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858936
128	NC_017794	ACC	2	6	8501	8506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858936
129	NC_017794	TCC	2	6	8531	8536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858936
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131	NC_017794	TCC	2	6	8588	8593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858936
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.