MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017794	AC	3	6	112	117	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017794	AT	3	6	250	255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017794	AT	3	6	266	271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017794	AT	3	6	887	892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017794	AT	3	6	1704	1709	50 %	50 %	0 %	0 %	386858928
6	NC_017794	CT	4	8	2682	2689	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017794	CT	4	8	2692	2699	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017794	CT	3	6	2704	2709	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017794	TC	3	6	2736	2741	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017794	CA	3	6	2877	2882	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017794	CT	3	6	3051	3056	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017794	TC	3	6	3634	3639	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017794	CT	3	6	3714	3719	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017794	CT	3	6	3787	3792	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017794	CT	3	6	4108	4113	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017794	TC	3	6	4486	4491	0 %	50 %	0 %	50 %	386858933
17	NC_017794	GA	3	6	4687	4692	50 %	0 %	50 %	0 %	386858933
18	NC_017794	AT	3	6	4807	4812	50 %	50 %	0 %	0 %	386858933
19	NC_017794	TC	4	8	5137	5144	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017794	CT	3	6	5147	5152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017794	TC	3	6	5153	5158	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017794	CT	3	6	5159	5164	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017794	TC	4	8	5175	5182	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017794	AT	3	6	6377	6382	50 %	50 %	0 %	0 %	386858934
25	NC_017794	TA	4	8	6862	6869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017794	CT	3	6	6916	6921	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017794	TC	3	6	7034	7039	0 %	50 %	0 %	50 %	386858935
28	NC_017794	AT	3	6	7376	7381	50 %	50 %	0 %	0 %	386858935
29	NC_017794	CT	3	6	8031	8036	0 %	50 %	0 %	50 %	386858935
30	NC_017794	TC	3	6	8037	8042	0 %	50 %	0 %	50 %	386858935
31	NC_017794	CT	3	6	8043	8048	0 %	50 %	0 %	50 %	386858935
32	NC_017794	TC	3	6	8057	8062	0 %	50 %	0 %	50 %	386858935
33	NC_017794	TA	3	6	8182	8187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017794	CT	4	8	8228	8235	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017794	TA	4	8	8271	8278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017794	TA	3	6	10858	10863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017794	TA	3	6	10992	10997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017794	AT	3	6	11253	11258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017794	AG	3	6	11271	11276	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017794	AC	4	8	11486	11493	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017794	TA	3	6	11580	11585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017794	CT	3	6	11921	11926	0 %	50 %	0 %	50 %	386858939
43	NC_017794	AT	3	6	12302	12307	50 %	50 %	0 %	0 %	386858940
44	NC_017794	AT	4	8	12792	12799	50 %	50 %	0 %	0 %	386858940
45	NC_017794	TA	3	6	13042	13047	50 %	50 %	0 %	0 %	386858941
46	NC_017794	TA	3	6	13178	13183	50 %	50 %	0 %	0 %	386858941
47	NC_017794	TA	3	6	13399	13404	50 %	50 %	0 %	0 %	386858941
48	NC_017794	AT	4	8	14225	14232	50 %	50 %	0 %	0 %	386858942
49	NC_017794	GA	3	6	14899	14904	50 %	0 %	50 %	0 %	386858943
50	NC_017794	AG	3	6	15031	15036	50 %	0 %	50 %	0 %	386858943
51	NC_017794	AT	3	6	15400	15405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017794	GA	3	6	15609	15614	50 %	0 %	50 %	0 %	386858944
53	NC_017794	AT	3	6	15671	15676	50 %	50 %	0 %	0 %	386858944
54	NC_017794	AT	3	6	16921	16926	50 %	50 %	0 %	0 %	386858945
55	NC_017794	GA	3	6	17260	17265	50 %	0 %	50 %	0 %	386858945
56	NC_017794	AT	3	6	17328	17333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017794	CT	3	6	17385	17390	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017794	GT	3	6	17634	17639	0 %	50 %	50 %	0 %	386858946

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.