MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Deinococcus gobiensis I-0 plasmid P2

Total Repeats: 213

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017791	CCGGTG	2	12	1457	1468	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386854606
2	NC_017791	GGGGGC	2	12	2815	2826	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	386854607
3	NC_017791	GGACCT	2	12	4099	4110	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386854609
4	NC_017791	GACGGT	2	12	6105	6116	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386854612
5	NC_017791	GCTCAC	2	12	8080	8091	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386854614
6	NC_017791	GAGGCG	2	12	8390	8401	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386854614
7	NC_017791	CGCAGG	2	12	12234	12245	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386854619
8	NC_017791	CGCAGG	2	12	12810	12821	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386854619
9	NC_017791	CCGCTG	2	12	13455	13466	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386854620
10	NC_017791	CTGGAG	2	12	13662	13673	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386854620
11	NC_017791	TGGAGG	2	12	14064	14075	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	386854622
12	NC_017791	TCGGCG	2	12	16505	16516	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386854627
13	NC_017791	CTGGTG	2	12	17451	17462	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386854628
14	NC_017791	CATCGA	2	12	18521	18532	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386854630
15	NC_017791	AACTCG	2	12	22837	22848	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386854639
16	NC_017791	CTTGCC	2	12	26442	26453	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386854646
17	NC_017791	GACTTC	2	12	28370	28381	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386854647
18	NC_017791	GTCAGG	2	12	30983	30994	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386854653
19	NC_017791	GACGAG	2	12	34523	34534	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386854656
20	NC_017791	GGGGTG	2	12	39451	39462	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	386854666
21	NC_017791	CGGGGC	2	12	40056	40067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386854667
22	NC_017791	TCTTCG	2	12	41916	41927	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386854670
23	NC_017791	CCCCCA	2	12	43583	43594	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	386854672
24	NC_017791	CGGAGG	2	12	44148	44159	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386854672
25	NC_017791	TGGAGG	2	12	44648	44659	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	386854673
26	NC_017791	CGTGGG	2	12	47996	48007	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386854679
27	NC_017791	GCCTGT	2	12	56113	56124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386854685
28	NC_017791	GAGGCG	2	12	56769	56780	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386854687
29	NC_017791	GGGCCA	2	12	57375	57386	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386854687
30	NC_017791	GTGCAG	2	12	58576	58587	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386854687
31	NC_017791	GTCAGC	2	12	58730	58741	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386854687
32	NC_017791	CTGGAG	2	12	61168	61179	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386854689
33	NC_017791	GCCCGC	2	12	63756	63767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386854692
34	NC_017791	CCTGAT	2	12	67296	67307	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386854694
35	NC_017791	ACGAGG	2	12	70698	70709	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386854697
36	NC_017791	CTCACC	2	12	72013	72024	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	386854698
37	NC_017791	CCTCCC	2	12	72198	72209	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	386854698
38	NC_017791	TACGCC	2	12	72800	72811	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386854698
39	NC_017791	GACCTC	2	12	77154	77165	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386854706
40	NC_017791	AGCCTG	2	12	77893	77904	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386854707
41	NC_017791	CTGAAC	2	12	81428	81439	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386854708
42	NC_017791	AGGTGC	2	12	83737	83748	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386854710
43	NC_017791	GCTGAC	2	12	83795	83806	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386854710
44	NC_017791	GGAGAA	2	12	89844	89855	50 %	0 %	50 %	0 %	386854719
45	NC_017791	TGGGTT	2	12	91396	91407	0 %	50 %	50 %	0 %	386854722
46	NC_017791	CCGCGC	2	12	95536	95547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386854727
47	NC_017791	GACCGA	2	12	96886	96897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386854729
48	NC_017791	TGGGCA	2	12	99498	99509	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386854734
49	NC_017791	ACCGCC	2	12	99809	99820	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386854735
50	NC_017791	TCCCCG	2	12	100002	100013	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386854735
51	NC_017791	CCGACG	2	12	101720	101731	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386854736
52	NC_017791	GCCGTC	2	12	108977	108988	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386854745
53	NC_017791	CCAGGC	2	12	111625	111636	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386854750
54	NC_017791	CCCCTG	2	12	112554	112565	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386854752
55	NC_017791	CCTGGC	2	12	114129	114140	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386854756
56	NC_017791	CTGGCC	2	12	117986	117997	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386854761
57	NC_017791	ATCGGC	2	12	120200	120211	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386854765
58	NC_017791	ACCTCC	2	12	122974	122985	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	386854771
59	NC_017791	GTCAGG	2	12	123324	123335	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386854772
60	NC_017791	GACCTC	2	12	125448	125459	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386854777
61	NC_017791	TCGCCC	2	12	127143	127154	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386854780
62	NC_017791	CCGGGA	2	12	128599	128610	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386854780
63	NC_017791	CCGGCG	2	12	130334	130345	0 %	0 %	50 %	50 %	386854782
64	NC_017791	CGCCAC	2	12	130815	130826	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386854782
65	NC_017791	ACCCCG	2	12	131578	131589	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386854782
66	NC_017791	CACGAC	2	12	133816	133827	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386854784
67	NC_017791	TCACGC	2	12	136097	136108	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386854785
68	NC_017791	CCCTCA	2	12	136575	136586	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	386854786
69	NC_017791	GTCATC	2	12	138983	138994	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386854787
70	NC_017791	ACGATC	2	12	139616	139627	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386854789
71	NC_017791	ACGTCG	2	12	141691	141702	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386854791
72	NC_017791	GTGACG	2	12	147266	147277	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386854797
73	NC_017791	TGGCGA	2	12	152750	152761	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386854801
74	NC_017791	GTTTCA	2	12	159099	159110	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386854809
75	NC_017791	TCCTGC	2	12	161517	161528	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386854812
76	NC_017791	GGTGAT	2	12	167443	167454	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386854819
77	NC_017791	CGAAGA	2	12	170149	170160	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386854821
78	NC_017791	GGCCAG	2	12	173105	173116	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386854823
79	NC_017791	ATCTGA	2	12	173349	173360	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386854823
80	NC_017791	CCAGTT	2	12	176184	176195	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386854826
81	NC_017791	GGGCGA	2	12	176664	176675	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386854826
82	NC_017791	GAGGGC	3	18	176791	176808	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386854826
83	NC_017791	GGAACT	2	12	181196	181207	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386854830
84	NC_017791	TGATCC	2	12	182305	182316	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386854832
85	NC_017791	GCACCT	2	12	182590	182601	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386854832
86	NC_017791	ACCGAC	2	12	183344	183355	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386854833
87	NC_017791	CCCTCG	2	12	185986	185997	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386854836
88	NC_017791	GCGGGT	2	12	186974	186985	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386854836
89	NC_017791	GGACGC	2	12	187295	187306	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386854836
90	NC_017791	CCGCTC	2	12	190584	190595	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386854839
91	NC_017791	CGTGAC	2	12	191873	191884	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386854841
92	NC_017791	GGACTG	2	12	192244	192255	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386854842
93	NC_017791	GTGGTC	3	18	193529	193546	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386854843
94	NC_017791	TTCCGG	2	12	193855	193866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386854843
95	NC_017791	TCATCC	2	12	194397	194408	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386854844
96	NC_017791	ATCGCC	2	12	194417	194428	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386854844
97	NC_017791	TACCTC	2	12	196752	196763	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386854846
98	NC_017791	CCCCAG	3	18	197492	197509	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386854847
99	NC_017791	GGCCAG	2	12	207406	207417	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386854855
100	NC_017791	AGGTGG	2	12	209887	209898	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	386854859
101	NC_017791	CAGCCC	2	12	210294	210305	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386854859
102	NC_017791	CGGCGA	2	12	212833	212844	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386854865
103	NC_017791	GAGCTG	2	12	214745	214756	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386854868
104	NC_017791	TGCCGG	2	12	220394	220405	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386854881
105	NC_017791	ACGTCA	2	12	220513	220524	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386854881
106	NC_017791	CGCCAA	2	12	222159	222170	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386854884
107	NC_017791	AGGTCA	2	12	222987	222998	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386854885
108	NC_017791	CCGCAC	2	12	223616	223627	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386854886
109	NC_017791	GCATGG	2	12	226122	226133	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386854887
110	NC_017791	CTCGAT	2	12	226269	226280	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386854888
111	NC_017791	GCGTAG	2	12	226549	226560	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386854888
112	NC_017791	TGACGT	2	12	228264	228275	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386854891
113	NC_017791	GGTGCC	2	12	228373	228384	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386854891
114	NC_017791	CCGCGC	2	12	231807	231818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386854898
115	NC_017791	CCAGGG	2	12	235159	235170	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386854902
116	NC_017791	CCAGCG	2	12	247850	247861	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386854919
117	NC_017791	AGGGCC	2	12	253367	253378	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386854923
118	NC_017791	CTATCA	2	12	255884	255895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386854925
119	NC_017791	GAGCGC	2	12	257129	257140	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386854926
120	NC_017791	GGGCGA	2	12	257959	257970	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386854926
121	NC_017791	TACCTG	2	12	259816	259827	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386854927
122	NC_017791	CCTGAA	2	12	264128	264139	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386854930
123	NC_017791	CCCTGC	2	12	266453	266464	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386854932
124	NC_017791	CCGTGA	2	12	267523	267534	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386854933
125	NC_017791	AGGTCG	2	12	269267	269278	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386854935
126	NC_017791	CAGGCG	2	12	269356	269367	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386854935
127	NC_017791	GTCCTC	2	12	282020	282031	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386854952
128	NC_017791	AGGCGC	2	12	282099	282110	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386854952
129	NC_017791	CCGGGT	2	12	282379	282390	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386854952
130	NC_017791	GCCACA	2	12	283193	283204	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386854953
131	NC_017791	TGCTGG	2	12	284856	284867	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386854955
132	NC_017791	TGCGCC	2	12	285432	285443	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386854957
133	NC_017791	CACCTG	2	12	286127	286138	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386854959
134	NC_017791	GCTCCA	2	12	288539	288550	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386854964
135	NC_017791	CTCCAG	2	12	288591	288602	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386854964
136	NC_017791	CAGGGC	2	12	289741	289752	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386854965
137	NC_017791	CCCCTG	2	12	292619	292630	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386854968
138	NC_017791	ATCGAT	2	12	295484	295495	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386854970
139	NC_017791	CGCCTG	2	12	298396	298407	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386854972
140	NC_017791	GGAGAA	2	12	298985	298996	50 %	0 %	50 %	0 %	386854973
141	NC_017791	CGCAGC	2	12	301724	301735	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386854978
142	NC_017791	CTCCGT	2	12	304247	304258	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386854979
143	NC_017791	CATCCG	2	12	304927	304938	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386854980
144	NC_017791	CCTCGT	2	12	305729	305740	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386854982
145	NC_017791	GACTTC	2	12	307292	307303	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386854984
146	NC_017791	GTCGCT	2	12	308421	308432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386854988
147	NC_017791	TGTGCC	2	12	308799	308810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386854988
148	NC_017791	TGGAGA	2	12	317156	317167	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386854993
149	NC_017791	GGCCCA	2	12	317202	317213	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386854993
150	NC_017791	AGGTCA	2	12	325743	325754	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386855002
151	NC_017791	GAGGTT	2	12	327131	327142	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386855004
152	NC_017791	GCGAGG	2	12	328238	328249	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386855006
153	NC_017791	GATCAT	2	12	329896	329907	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386855009
154	NC_017791	TGGGAG	2	12	330580	330591	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	386855011
155	NC_017791	GACGGC	2	12	332112	332123	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386855012
156	NC_017791	CGTGTA	2	12	332476	332487	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386855013
157	NC_017791	TACCTG	2	12	333152	333163	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386855013
158	NC_017791	GTGGCG	2	12	333442	333453	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386855014
159	NC_017791	GCCCTG	2	12	333595	333606	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386855014
160	NC_017791	GCTGGC	2	12	335342	335353	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386855019
161	NC_017791	CGGAAG	2	12	335548	335559	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386855019
162	NC_017791	GTACCG	2	12	335621	335632	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386855019
163	NC_017791	CAGGGC	2	12	338218	338229	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386855025
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166	NC_017791	GGAAGC	2	12	340899	340910	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386855030
167	NC_017791	TACCCC	2	12	346883	346894	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	386855038
168	NC_017791	GCAGGC	2	12	347456	347467	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386855038
169	NC_017791	CGGACG	2	12	349128	349139	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386855040
170	NC_017791	TGACGC	2	12	350132	350143	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386855041
171	NC_017791	CGTGCT	2	12	354912	354923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386855047
172	NC_017791	CAGGAC	2	12	356239	356250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386855047
173	NC_017791	TCCGGC	2	12	362757	362768	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386855056
174	NC_017791	CAGGCC	2	12	363506	363517	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386855057
175	NC_017791	GCCTGC	2	12	364804	364815	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386855060
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182	NC_017791	CTGGCG	2	12	372722	372733	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386855064
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184	NC_017791	CTCGGC	2	12	373559	373570	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386855064
185	NC_017791	GCCGAG	2	12	377027	377038	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386855064
186	NC_017791	TTCGAG	2	12	377675	377686	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386855066
187	NC_017791	CGTCGG	2	12	378611	378622	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386855068
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189	NC_017791	GTCGAG	2	12	380236	380247	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386855071
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192	NC_017791	CTGCAC	2	12	380938	380949	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386855073
193	NC_017791	TCCGGC	2	12	380963	380974	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386855073
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200	NC_017791	GGCGCA	2	12	395230	395241	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386855090
201	NC_017791	CCAGCA	2	12	395729	395740	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386855092
202	NC_017791	CTGCGC	2	12	396337	396348	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386855094
203	NC_017791	TCAGGA	2	12	399475	399486	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386855099
204	NC_017791	CCTCGC	2	12	404767	404778	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386855104
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207	NC_017791	GGCGTG	2	12	411770	411781	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386855115
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209	NC_017791	ACCGGT	2	12	418260	418271	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386855122
210	NC_017791	CGGCAG	2	12	421367	421378	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386855125
211	NC_017791	TCAAGG	2	12	422013	422024	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386855125
212	NC_017791	GACCCT	2	12	422026	422037	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386855125
213	NC_017791	CGGTCG	2	12	423267	423278	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386855125

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.