MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Deinococcus gobiensis I-0 plasmid P2

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017791	CGCGT	2	10	20947	20956	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_017791	CTGGG	2	10	46311	46320	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017791	GGTAC	2	10	51200	51209	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017791	TGCCT	2	10	77344	77353	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_017791	CCTTG	2	10	77402	77411	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_017791	CGAGA	2	10	80470	80479	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017791	TGATC	2	10	83224	83233	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017791	GAGCC	2	10	90841	90850	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_017791	GGGCG	2	10	91249	91258	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017791	CCGCC	2	10	100254	100263	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
11	NC_017791	GCGCT	2	10	101901	101910	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_017791	GGCAC	2	10	101952	101961	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_017791	ACCCC	2	10	118324	118333	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
14	NC_017791	AGGCG	2	10	124087	124096	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017791	GGTGT	2	10	162983	162992	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017791	CGGTG	2	10	166068	166077	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017791	CACGA	2	10	183528	183537	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_017791	GGCGC	2	10	209349	209358	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19	NC_017791	CTCCC	2	10	212664	212673	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
20	NC_017791	GGGAA	2	10	215894	215903	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017791	GCGCA	2	10	246285	246294	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_017791	GCTCT	2	10	246592	246601	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_017791	CCTCT	2	10	254718	254727	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
24	NC_017791	CAGTC	2	10	263878	263887	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_017791	CCCCT	2	10	265312	265321	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
26	NC_017791	CTTCC	2	10	278178	278187	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
27	NC_017791	ACCGT	2	10	278558	278567	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_017791	GTTCG	2	10	278710	278719	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017791	TGGCA	2	10	279551	279560	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017791	TGCGC	2	10	279914	279923	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_017791	AGAGG	2	10	281704	281713	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017791	GCTGG	2	10	282684	282693	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017791	GCTGA	2	10	284351	284360	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017791	TCTGC	2	10	287894	287903	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_017791	GACAT	2	10	288625	288634	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017791	GAGCC	2	10	299982	299991	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_017791	CGTGA	2	10	308019	308028	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017791	AGGAG	2	10	312499	312508	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017791	GATCA	2	10	317649	317658	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017791	AGCGG	2	10	327810	327819	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017791	CCTTT	2	10	335789	335798	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_017791	CTGAG	2	10	337347	337356	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017791	GGGCA	2	10	337822	337831	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017791	CCCCA	2	10	338478	338487	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
45	NC_017791	CCTTG	2	10	339556	339565	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_017791	GGTGG	2	10	339844	339853	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017791	GGGTC	2	10	342328	342337	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017791	AGGTG	2	10	348906	348915	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017791	GAGAG	2	10	358261	358270	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017791	CCACC	2	10	360467	360476	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
51	NC_017791	GCCTT	2	10	360499	360508	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_017791	AGGGC	2	10	361871	361880	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017791	GGGGA	2	10	414070	414079	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017791	GTCCT	2	10	414224	414233	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_017791	TCACC	2	10	415143	415152	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
56	NC_017791	CACAA	2	10	415710	415719	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_017791	TCATG	2	10	419852	419861	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.