MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Deinococcus gobiensis I-0 plasmid P2

Total Repeats: 318

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017791	CCGCT	2	10	1365	1374	0 %	20 %	20 %	60 %	386854606
2	NC_017791	GCCGC	2	10	1864	1873	0 %	0 %	40 %	60 %	386854606
3	NC_017791	GCTCC	2	10	2083	2092	0 %	20 %	20 %	60 %	386854607
4	NC_017791	GAACG	2	10	2431	2440	40 %	0 %	40 %	20 %	386854607
5	NC_017791	GGTCA	2	10	2705	2714	20 %	20 %	40 %	20 %	386854607
6	NC_017791	TCGTC	2	10	3760	3769	0 %	40 %	20 %	40 %	386854609
7	NC_017791	CCCAC	2	10	4346	4355	20 %	0 %	0 %	80 %	386854610
8	NC_017791	GGGGA	2	10	6192	6201	20 %	0 %	80 %	0 %	386854612
9	NC_017791	GGGTG	2	10	6416	6425	0 %	20 %	80 %	0 %	386854612
10	NC_017791	GCCAC	2	10	7119	7128	20 %	0 %	20 %	60 %	386854614
11	NC_017791	CGGGG	2	10	11677	11686	0 %	0 %	80 %	20 %	386854619
12	NC_017791	CAGCC	2	10	13561	13570	20 %	0 %	20 %	60 %	386854620
13	NC_017791	CGGCA	2	10	14866	14875	20 %	0 %	40 %	40 %	386854624
14	NC_017791	GGAAC	2	10	15258	15267	40 %	0 %	40 %	20 %	386854625
15	NC_017791	GACGC	2	10	16948	16957	20 %	0 %	40 %	40 %	386854627
16	NC_017791	CGCGC	2	10	17224	17233	0 %	0 %	40 %	60 %	386854627
17	NC_017791	GGTCT	2	10	18882	18891	0 %	40 %	40 %	20 %	386854630
18	NC_017791	CATGG	2	10	19118	19127	20 %	20 %	40 %	20 %	386854630
19	NC_017791	GTGGA	2	10	22415	22424	20 %	20 %	60 %	0 %	386854638
20	NC_017791	GGAAG	2	10	22946	22955	40 %	0 %	60 %	0 %	386854639
21	NC_017791	GGCGT	2	10	23843	23852	0 %	20 %	60 %	20 %	386854641
22	NC_017791	GGGCG	2	10	25389	25398	0 %	0 %	80 %	20 %	386854645
23	NC_017791	TGCAC	2	10	29364	29373	20 %	20 %	20 %	40 %	386854650
24	NC_017791	CGCAG	2	10	29738	29747	20 %	0 %	40 %	40 %	386854650
25	NC_017791	TGCCC	2	10	30200	30209	0 %	20 %	20 %	60 %	386854651
26	NC_017791	GGTCA	2	10	30800	30809	20 %	20 %	40 %	20 %	386854653
27	NC_017791	GCAGA	2	10	32426	32435	40 %	0 %	40 %	20 %	386854655
28	NC_017791	AGCCA	2	10	32517	32526	40 %	0 %	20 %	40 %	386854655
29	NC_017791	AGGGC	2	10	38663	38672	20 %	0 %	60 %	20 %	386854666
30	NC_017791	AGCGC	2	10	38742	38751	20 %	0 %	40 %	40 %	386854666
31	NC_017791	GGGGC	2	10	38826	38835	0 %	0 %	80 %	20 %	386854666
32	NC_017791	GACCA	2	10	42092	42101	40 %	0 %	20 %	40 %	386854670
33	NC_017791	CGAGT	2	10	42567	42576	20 %	20 %	40 %	20 %	386854670
34	NC_017791	CCCAG	2	10	45502	45511	20 %	0 %	20 %	60 %	386854675
35	NC_017791	TGGGC	2	10	47161	47170	0 %	20 %	60 %	20 %	386854678
36	NC_017791	GGGTC	2	10	48010	48019	0 %	20 %	60 %	20 %	386854679
37	NC_017791	GGTAC	2	10	49238	49247	20 %	20 %	40 %	20 %	386854679
38	NC_017791	CCATG	2	10	50589	50598	20 %	20 %	20 %	40 %	386854680
39	NC_017791	GCCAC	2	10	50746	50755	20 %	0 %	20 %	60 %	386854681
40	NC_017791	CCAGG	2	10	55968	55977	20 %	0 %	40 %	40 %	386854685
41	NC_017791	TGCGT	2	10	56006	56015	0 %	40 %	40 %	20 %	386854685
42	NC_017791	GCCCC	2	10	57016	57025	0 %	0 %	20 %	80 %	386854687
43	NC_017791	TCAGT	2	10	57567	57576	20 %	40 %	20 %	20 %	386854687
44	NC_017791	GAGGC	2	10	57944	57953	20 %	0 %	60 %	20 %	386854687
45	NC_017791	TCAGG	2	10	58437	58446	20 %	20 %	40 %	20 %	386854687
46	NC_017791	CGAAG	2	10	63999	64008	40 %	0 %	40 %	20 %	386854692
47	NC_017791	CGACC	2	10	65327	65336	20 %	0 %	20 %	60 %	386854693
48	NC_017791	CACCC	2	10	71779	71788	20 %	0 %	0 %	80 %	386854698
49	NC_017791	ACACC	2	10	72003	72012	40 %	0 %	0 %	60 %	386854698
50	NC_017791	CCATC	2	10	72054	72063	20 %	20 %	0 %	60 %	386854698
51	NC_017791	GGCCA	2	10	72115	72124	20 %	0 %	40 %	40 %	386854698
52	NC_017791	CCTCG	2	10	72636	72645	0 %	20 %	20 %	60 %	386854698
53	NC_017791	CAAAG	2	10	75045	75054	60 %	0 %	20 %	20 %	386854702
54	NC_017791	GCAGT	2	10	78125	78134	20 %	20 %	40 %	20 %	386854707
55	NC_017791	GCCGG	2	10	79138	79147	0 %	0 %	60 %	40 %	386854707
56	NC_017791	CAGCG	2	10	81146	81155	20 %	0 %	40 %	40 %	386854708
57	NC_017791	CACGC	2	10	81164	81173	20 %	0 %	20 %	60 %	386854708
58	NC_017791	GACCA	2	10	81308	81317	40 %	0 %	20 %	40 %	386854708
59	NC_017791	CAGGG	2	10	81747	81756	20 %	0 %	60 %	20 %	386854708
60	NC_017791	AGGTC	2	10	81912	81921	20 %	20 %	40 %	20 %	386854708
61	NC_017791	GCCGG	2	10	82237	82246	0 %	0 %	60 %	40 %	386854709
62	NC_017791	CCGCG	2	10	83960	83969	0 %	0 %	40 %	60 %	386854710
63	NC_017791	GGGAA	2	10	87854	87863	40 %	0 %	60 %	0 %	386854716
64	NC_017791	AGATC	2	10	89688	89697	40 %	20 %	20 %	20 %	386854719
65	NC_017791	ACGTC	2	10	94328	94337	20 %	20 %	20 %	40 %	386854725
66	NC_017791	GGGAA	2	10	94371	94380	40 %	0 %	60 %	0 %	386854725
67	NC_017791	ACCAA	2	10	95586	95595	60 %	0 %	0 %	40 %	386854727
68	NC_017791	ATGGC	2	10	96172	96181	20 %	20 %	40 %	20 %	386854728
69	NC_017791	CTTCA	2	10	98591	98600	20 %	40 %	0 %	40 %	386854732
70	NC_017791	TCATG	2	10	98721	98730	20 %	40 %	20 %	20 %	386854732
71	NC_017791	AAACC	2	10	99010	99019	60 %	0 %	0 %	40 %	386854733
72	NC_017791	GCGCC	2	10	99544	99553	0 %	0 %	40 %	60 %	386854734
73	NC_017791	GCGCC	2	10	101795	101804	0 %	0 %	40 %	60 %	386854736
74	NC_017791	TCACC	2	10	102170	102179	20 %	20 %	0 %	60 %	386854737
75	NC_017791	ATCGA	2	10	102316	102325	40 %	20 %	20 %	20 %	386854737
76	NC_017791	CCCAG	2	10	102979	102988	20 %	0 %	20 %	60 %	386854738
77	NC_017791	CACCC	2	10	103673	103682	20 %	0 %	0 %	80 %	386854739
78	NC_017791	GTCGC	2	10	107837	107846	0 %	20 %	40 %	40 %	386854745
79	NC_017791	CGGCC	2	10	108070	108079	0 %	0 %	40 %	60 %	386854745
80	NC_017791	GGCGT	2	10	109736	109745	0 %	20 %	60 %	20 %	386854746
81	NC_017791	GGCGA	2	10	110480	110489	20 %	0 %	60 %	20 %	386854747
82	NC_017791	GCTCA	2	10	110875	110884	20 %	20 %	20 %	40 %	386854748
83	NC_017791	GTGAC	2	10	111738	111747	20 %	20 %	40 %	20 %	386854750
84	NC_017791	CGACC	2	10	113262	113271	20 %	0 %	20 %	60 %	386854754
85	NC_017791	GCCGG	2	10	114815	114824	0 %	0 %	60 %	40 %	386854757
86	NC_017791	CACCC	2	10	116043	116052	20 %	0 %	0 %	80 %	386854760
87	NC_017791	GATCG	2	10	120663	120672	20 %	20 %	40 %	20 %	386854766
88	NC_017791	CGATC	2	10	122815	122824	20 %	20 %	20 %	40 %	386854771
89	NC_017791	GTCTC	2	10	125075	125084	0 %	40 %	20 %	40 %	386854776
90	NC_017791	CCCAC	2	10	126547	126556	20 %	0 %	0 %	80 %	386854779
91	NC_017791	CTCCC	2	10	132561	132570	0 %	20 %	0 %	80 %	386854784
92	NC_017791	GGCGG	2	10	133235	133244	0 %	0 %	80 %	20 %	386854784
93	NC_017791	GCCAC	2	10	133592	133601	20 %	0 %	20 %	60 %	386854784
94	NC_017791	CCAGT	2	10	133773	133782	20 %	20 %	20 %	40 %	386854784
95	NC_017791	CCCTC	2	10	134210	134219	0 %	20 %	0 %	80 %	386854785
96	NC_017791	GCCTG	2	10	135876	135885	0 %	20 %	40 %	40 %	386854785
97	NC_017791	GGCCA	2	10	135931	135940	20 %	0 %	40 %	40 %	386854785
98	NC_017791	CCGGG	2	10	138763	138772	0 %	0 %	60 %	40 %	386854787
99	NC_017791	GACCT	2	10	140206	140215	20 %	20 %	20 %	40 %	386854790
100	NC_017791	GTAAT	2	10	142928	142937	40 %	40 %	20 %	0 %	386854792
101	NC_017791	GGGTT	2	10	143246	143255	0 %	40 %	60 %	0 %	386854792
102	NC_017791	GGATG	2	10	146331	146340	20 %	20 %	60 %	0 %	386854796
103	NC_017791	TTCGC	2	10	147340	147349	0 %	40 %	20 %	40 %	386854797
104	NC_017791	CTGCC	2	10	147856	147865	0 %	20 %	20 %	60 %	386854798
105	NC_017791	TGGCC	2	10	148708	148717	0 %	20 %	40 %	40 %	386854799
106	NC_017791	GCGCT	2	10	149504	149513	0 %	20 %	40 %	40 %	386854800
107	NC_017791	CACCG	2	10	150244	150253	20 %	0 %	20 %	60 %	386854800
108	NC_017791	GCGTC	2	10	151527	151536	0 %	20 %	40 %	40 %	386854801
109	NC_017791	TTCAG	2	10	151885	151894	20 %	40 %	20 %	20 %	386854801
110	NC_017791	TTCCA	2	10	151912	151921	20 %	40 %	0 %	40 %	386854801
111	NC_017791	AGGGC	2	10	152324	152333	20 %	0 %	60 %	20 %	386854801
112	NC_017791	GGGTA	2	10	152415	152424	20 %	20 %	60 %	0 %	386854801
113	NC_017791	TCACC	2	10	154193	154202	20 %	20 %	0 %	60 %	386854802
114	NC_017791	CGAGG	2	10	155207	155216	20 %	0 %	60 %	20 %	386854803
115	NC_017791	CGCTT	2	10	155361	155370	0 %	40 %	20 %	40 %	386854803
116	NC_017791	CCTGG	2	10	155406	155415	0 %	20 %	40 %	40 %	386854803
117	NC_017791	TCGCC	2	10	161187	161196	0 %	20 %	20 %	60 %	386854812
118	NC_017791	ATCCC	2	10	162781	162790	20 %	20 %	0 %	60 %	386854815
119	NC_017791	GCGCG	2	10	163506	163515	0 %	0 %	60 %	40 %	386854816
120	NC_017791	CCGAG	2	10	164932	164941	20 %	0 %	40 %	40 %	386854817
121	NC_017791	GACTC	2	10	169499	169508	20 %	20 %	20 %	40 %	386854821
122	NC_017791	TGGTC	2	10	169975	169984	0 %	40 %	40 %	20 %	386854821
123	NC_017791	TGATG	2	10	171589	171598	20 %	40 %	40 %	0 %	386854822
124	NC_017791	GCAAC	2	10	172954	172963	40 %	0 %	20 %	40 %	386854823
125	NC_017791	TGACC	2	10	173908	173917	20 %	20 %	20 %	40 %	386854823
126	NC_017791	GCACG	2	10	174025	174034	20 %	0 %	40 %	40 %	386854823
127	NC_017791	CCGGA	2	10	176396	176405	20 %	0 %	40 %	40 %	386854826
128	NC_017791	GGTGA	2	10	177841	177850	20 %	20 %	60 %	0 %	386854826
129	NC_017791	TGGAA	2	10	178726	178735	40 %	20 %	40 %	0 %	386854828
130	NC_017791	CCCTC	2	10	178921	178930	0 %	20 %	0 %	80 %	386854828
131	NC_017791	ACCGC	2	10	179528	179537	20 %	0 %	20 %	60 %	386854828
132	NC_017791	CCCGC	2	10	184370	184379	0 %	0 %	20 %	80 %	386854834
133	NC_017791	ACTGG	2	10	184656	184665	20 %	20 %	40 %	20 %	386854835
134	NC_017791	GCAGT	2	10	185075	185084	20 %	20 %	40 %	20 %	386854835
135	NC_017791	CTCCC	2	10	185697	185706	0 %	20 %	0 %	80 %	386854836
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261	NC_017791	ACCGT	2	10	347646	347655	20 %	20 %	20 %	40 %	386855038
262	NC_017791	CCGGC	2	10	348460	348469	0 %	0 %	40 %	60 %	386855039
263	NC_017791	CCGAA	2	10	349902	349911	40 %	0 %	20 %	40 %	386855041
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.