MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Deinococcus gobiensis I-0 chromosome

Total Repeats: 370

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017790	CGCCGA	2	12	20354	20365	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017790	GGGCAG	2	12	21195	21206	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017790	GGGCCG	2	12	24350	24361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017790	GCTCCT	2	12	28608	28619	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017790	TTCGCC	2	12	46841	46852	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017790	TCCGGT	2	12	50586	50597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017790	CCCGGC	2	12	52398	52409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_017790	GGCCCC	2	12	54328	54339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_017790	CGCGCC	2	12	56527	56538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_017790	CGCGCT	2	12	58158	58169	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017790	ACGGCG	2	12	70524	70535	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017790	GCTGTG	2	12	90365	90376	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017790	CCGGGC	2	12	101046	101057	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017790	CGGGGG	2	12	101938	101949	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017790	CGCGCT	2	12	105478	105489	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017790	GCTATG	2	12	111058	111069	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017790	TGGGCG	2	12	117406	117417	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017790	GCCGGA	2	12	118018	118029	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017790	CTGGCA	2	12	149912	149923	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017790	GGGCCG	2	12	162881	162892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017790	GGCCCC	2	12	170929	170940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_017790	CCAGCC	2	12	173792	173803	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_017790	CCATCT	2	12	185617	185628	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017790	GAGGTC	2	12	208673	208684	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017790	CACGAA	2	12	214219	214230	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017790	CGGGGA	2	12	217308	217319	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017790	CGGTGC	2	12	220359	220370	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017790	CGTCTC	2	12	221583	221594	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017790	CAGCGA	2	12	225469	225480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017790	CTTCAG	2	12	225484	225495	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017790	CGGTGC	2	12	233623	233634	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017790	GGGCTG	2	12	246866	246877	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017790	CAGGGA	2	12	256148	256159	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017790	GCGCCC	2	12	276999	277010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_017790	CGACCT	2	12	294363	294374	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017790	TCTGCC	2	12	315451	315462	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017790	CGGCAG	2	12	325680	325691	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017790	GCACAG	2	12	329584	329595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017790	GGCGTA	2	12	334445	334456	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017790	GGGCGG	2	12	348662	348673	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017790	CCTCGT	2	12	376914	376925	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017790	GGGCCG	2	12	387550	387561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017790	GGGGGT	2	12	403722	403733	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017790	TGCAGG	2	12	407739	407750	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017790	TGCCGG	2	12	417909	417920	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017790	GCCGGG	2	12	418288	418299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017790	GGGCGG	2	12	425459	425470	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017790	GCGCCC	2	12	426265	426276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_017790	ACCAGC	3	18	437975	437992	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017790	GTCCGG	2	12	439598	439609	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017790	CTTCGA	2	12	452481	452492	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017790	GGGCCG	2	12	460538	460549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017790	GCCGAG	2	12	461019	461030	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017790	GCCCGC	2	12	479302	479313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_017790	GCCCAA	2	12	480479	480490	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017790	CCCGCC	2	12	512820	512831	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
57	NC_017790	GGCACC	2	12	524695	524706	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017790	GGGGGC	2	12	526565	526576	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017790	CGAGGT	2	12	565573	565584	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017790	AGGACC	2	12	565602	565613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017790	CAGGCC	2	12	565823	565834	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017790	CAGGCG	2	12	566058	566069	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017790	CGCCCG	2	12	566133	566144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_017790	TTGTCG	2	12	566194	566205	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017790	GTCCAG	2	12	566619	566630	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017790	CCAGCC	2	12	583668	583679	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_017790	CCCCGA	2	12	590303	590314	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_017790	TCGACC	2	12	592518	592529	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017790	CGGGAC	2	12	598805	598816	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017790	GGGGAC	2	12	618747	618758	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017790	GGAAGG	2	12	626266	626277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017790	GGGCCG	2	12	627097	627108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017790	CGCCCT	2	12	633450	633461	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_017790	GTGCGG	2	12	650779	650790	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017790	CTATCT	2	12	650898	650909	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017790	GTCGAT	2	12	661118	661129	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017790	CCGCTT	2	12	666497	666508	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017790	GTGGGC	2	12	669145	669156	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017790	CCCCAC	2	12	690715	690726	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
80	NC_017790	CGGGCA	2	12	691977	691988	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017790	GCCTGG	2	12	709769	709780	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017790	ACGGGT	2	12	744930	744941	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_017790	GGTCGG	2	12	745375	745386	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017790	CAGCGC	2	12	745574	745585	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017790	CCTGAC	2	12	749652	749663	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017790	CGGCCA	2	12	749759	749770	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017790	GCAGGG	2	12	759860	759871	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017790	TCGCTC	2	12	788693	788704	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017790	GGGACG	2	12	791316	791327	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_017790	GGCCCC	2	12	795823	795834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_017790	GCCAGG	2	12	800428	800439	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017790	GAATTC	2	12	800806	800817	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_017790	GCTATG	2	12	804677	804688	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017790	CGGCCC	2	12	817335	817346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_017790	CCGACG	2	12	817615	817626	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017790	TTCCCC	2	12	831651	831662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_017790	GCCCCC	2	12	870452	870463	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
98	NC_017790	CGCGAC	2	12	881159	881170	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017790	TCAGGA	2	12	885768	885779	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017790	CATAGC	2	12	908095	908106	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017790	TGCCGG	2	12	912713	912724	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017790	GAAGAT	2	12	914511	914522	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017790	GCCGGG	2	12	921059	921070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017790	GAACTG	2	12	924460	924471	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_017790	TTCCCT	2	12	925339	925350	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017790	GCTCAG	2	12	928648	928659	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017790	CCGGGG	2	12	956224	956235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017790	GCATGG	2	12	957269	957280	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_017790	CTGGGA	2	12	967368	967379	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_017790	TGCCGG	2	12	973395	973406	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017790	ACCGCC	2	12	983101	983112	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_017790	GGCCCC	2	12	1010955	1010966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_017790	CAGCGA	2	12	1014014	1014025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017790	GGGGTC	2	12	1014948	1014959	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_017790	CGTTGC	2	12	1015099	1015110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017790	CAGCGC	2	12	1026126	1026137	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017790	CCTGAC	2	12	1030185	1030196	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017790	GCGGGG	2	12	1030782	1030793	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_017790	GGCCTG	2	12	1038311	1038322	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017790	CGCTGG	2	12	1038498	1038509	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017790	CGGCTG	2	12	1038734	1038745	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017790	CGCAGG	2	12	1039326	1039337	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017790	GCCTGC	2	12	1051269	1051280	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017790	CCCGGA	2	12	1069932	1069943	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017790	GGCCCT	2	12	1071411	1071422	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017790	GTGTGG	2	12	1075421	1075432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017790	TCCCGC	2	12	1079319	1079330	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_017790	CGCCGG	2	12	1081528	1081539	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017790	GGGGCC	2	12	1082038	1082049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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250	NC_017790	CCCTGG	2	12	2087358	2087369	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
251	NC_017790	TCAGCA	2	12	2095859	2095870	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
252	NC_017790	TGCGCC	2	12	2100537	2100548	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
253	NC_017790	CCCTCT	2	12	2119207	2119218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
254	NC_017790	CTTCCA	2	12	2124137	2124148	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
255	NC_017790	CCGCGC	2	12	2124211	2124222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
256	NC_017790	CCAAGG	2	12	2124883	2124894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
257	NC_017790	CCACCC	2	12	2143000	2143011	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
258	NC_017790	CCCACA	2	12	2143013	2143024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
259	NC_017790	CCCTGA	2	12	2154580	2154591	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
260	NC_017790	GACCCT	2	12	2154665	2154676	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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262	NC_017790	GAGAGG	2	12	2181191	2181202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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264	NC_017790	GGGCCA	2	12	2194671	2194682	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
265	NC_017790	CCGGCT	2	12	2201494	2201505	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
266	NC_017790	TCCCCG	2	12	2219648	2219659	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
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269	NC_017790	GGAAGA	2	12	2234412	2234423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
270	NC_017790	CGCCGG	2	12	2242132	2242143	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
271	NC_017790	CGGCCC	2	12	2270243	2270254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
272	NC_017790	GTGTCG	2	12	2290169	2290180	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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274	NC_017790	CCCGCG	2	12	2294828	2294839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
275	NC_017790	CCGGGA	2	12	2301487	2301498	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
276	NC_017790	CGGGGC	2	12	2301533	2301544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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280	NC_017790	GGGCCG	2	12	2315157	2315168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_017790	GGGCCG	2	12	2322779	2322790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_017790	CGCGGG	2	12	2322828	2322839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_017790	CCGCGC	2	12	2324752	2324763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
284	NC_017790	CGTCGC	2	12	2339387	2339398	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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290	NC_017790	GGTCTG	2	12	2365000	2365011	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
291	NC_017790	GGGCCG	2	12	2365195	2365206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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359	NC_017790	CGCTGG	2	12	3024673	3024684	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
360	NC_017790	CCAGCT	2	12	3036360	3036371	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
361	NC_017790	CCAGCA	2	12	3050984	3050995	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
362	NC_017790	AGTGCG	2	12	3058819	3058830	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
363	NC_017790	GCCAGC	2	12	3059023	3059034	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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367	NC_017790	CGCCTG	2	12	3104231	3104242	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
368	NC_017790	GCCGAA	2	12	3110332	3110343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
369	NC_017790	GGCGCA	2	12	3110623	3110634	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
370	NC_017790	GGGCAG	2	12	3126378	3126389	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.