MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Deinococcus gobiensis I-0 chromosome

Total Repeats: 3622

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017790	GCCGG	2	10	417	426	0 %	0 %	60 %	40 %	386855209
2	NC_017790	GGGAG	2	10	2902	2911	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017790	GCGCT	2	10	4013	4022	0 %	20 %	40 %	40 %	386855211
4	NC_017790	ACCTC	2	10	6365	6374	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
5	NC_017790	GCGGG	2	10	6575	6584	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017790	GGCCG	2	10	8611	8620	0 %	0 %	60 %	40 %	386855214
7	NC_017790	CGCCA	2	10	9791	9800	20 %	0 %	20 %	60 %	386855216
8	NC_017790	GCCCG	2	10	9899	9908	0 %	0 %	40 %	60 %	386855216
9	NC_017790	GCGCC	2	10	10286	10295	0 %	0 %	40 %	60 %	386855217
10	NC_017790	CCTGC	2	10	11489	11498	0 %	20 %	20 %	60 %	386855218
11	NC_017790	CGGCG	2	10	14384	14393	0 %	0 %	60 %	40 %	386855222
12	NC_017790	CGCGC	3	15	15452	15466	0 %	0 %	40 %	60 %	386855223
13	NC_017790	GTCGG	2	10	17201	17210	0 %	20 %	60 %	20 %	386855224
14	NC_017790	TGTCC	2	10	17558	17567	0 %	40 %	20 %	40 %	386855226
15	NC_017790	GGGGC	2	10	21207	21216	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017790	CGACT	2	10	21471	21480	20 %	20 %	20 %	40 %	386855230
17	NC_017790	CGCGC	2	10	22067	22076	0 %	0 %	40 %	60 %	386855231
18	NC_017790	CGGTG	2	10	22108	22117	0 %	20 %	60 %	20 %	386855231
19	NC_017790	CAGGT	2	10	22143	22152	20 %	20 %	40 %	20 %	386855231
20	NC_017790	GACCA	2	10	23408	23417	40 %	0 %	20 %	40 %	386855232
21	NC_017790	GGCCG	2	10	25499	25508	0 %	0 %	60 %	40 %	386855235
22	NC_017790	GACCC	2	10	25671	25680	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_017790	GACGA	2	10	26328	26337	40 %	0 %	40 %	20 %	386855236
24	NC_017790	GGGGC	2	10	26977	26986	0 %	0 %	80 %	20 %	386855237
25	NC_017790	GGGCC	2	10	27890	27899	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
26	NC_017790	GCCGC	2	10	28074	28083	0 %	0 %	40 %	60 %	386855238
27	NC_017790	GCGCG	2	10	28153	28162	0 %	0 %	60 %	40 %	386855238
28	NC_017790	CCCTG	2	10	29733	29742	0 %	20 %	20 %	60 %	386855239
29	NC_017790	CCCCG	2	10	29865	29874	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
30	NC_017790	GGGCC	2	10	29996	30005	0 %	0 %	60 %	40 %	386855240
31	NC_017790	GCCCG	2	10	30234	30243	0 %	0 %	40 %	60 %	386855240
32	NC_017790	GTAAG	2	10	30641	30650	40 %	20 %	40 %	0 %	386855240
33	NC_017790	ACCGG	2	10	30712	30721	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_017790	GGCCG	2	10	33179	33188	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
35	NC_017790	CGAGG	2	10	34101	34110	20 %	0 %	60 %	20 %	386855243
36	NC_017790	CTCGC	2	10	36748	36757	0 %	20 %	20 %	60 %	386855246
37	NC_017790	GCCGC	2	10	38870	38879	0 %	0 %	40 %	60 %	386855249
38	NC_017790	CCGGG	2	10	39302	39311	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
39	NC_017790	GCGCG	2	10	39368	39377	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
40	NC_017790	CGCGC	2	10	39640	39649	0 %	0 %	40 %	60 %	386855251
41	NC_017790	TCCTG	2	10	40209	40218	0 %	40 %	20 %	40 %	386855252
42	NC_017790	GCGGG	2	10	43058	43067	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017790	ACCCG	2	10	43843	43852	20 %	0 %	20 %	60 %	386855256
44	NC_017790	TGGGC	2	10	44147	44156	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017790	CGACC	2	10	44830	44839	20 %	0 %	20 %	60 %	386855258
46	NC_017790	CGGCG	2	10	45728	45737	0 %	0 %	60 %	40 %	386855259
47	NC_017790	TGGGC	2	10	45901	45910	0 %	20 %	60 %	20 %	386855259
48	NC_017790	GGGCC	2	10	46672	46681	0 %	0 %	60 %	40 %	386855260
49	NC_017790	CGTGG	2	10	48203	48212	0 %	20 %	60 %	20 %	386855262
50	NC_017790	CTCAC	2	10	48546	48555	20 %	20 %	0 %	60 %	386855263
51	NC_017790	TGGGC	2	10	49996	50005	0 %	20 %	60 %	20 %	386855264
52	NC_017790	CGCGC	2	10	50042	50051	0 %	0 %	40 %	60 %	386855264
53	NC_017790	CGACC	2	10	51209	51218	20 %	0 %	20 %	60 %	386855265
54	NC_017790	CCGCG	2	10	52252	52261	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
55	NC_017790	GCGCC	2	10	52301	52310	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
56	NC_017790	GAGGC	2	10	53141	53150	20 %	0 %	60 %	20 %	386855267
57	NC_017790	GCGCG	2	10	54072	54081	0 %	0 %	60 %	40 %	386855268
58	NC_017790	CAGCC	2	10	54231	54240	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
59	NC_017790	GCCCC	2	10	54247	54256	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
60	NC_017790	CAGCC	2	10	54528	54537	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
61	NC_017790	GCGCC	2	10	56399	56408	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
62	NC_017790	GGCCG	2	10	56682	56691	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
63	NC_017790	ACCGT	2	10	56770	56779	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_017790	GCGCG	2	10	57861	57870	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
65	NC_017790	GGGCG	2	10	58041	58050	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017790	GCGCC	2	10	58088	58097	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
67	NC_017790	CGGCG	2	10	60312	60321	0 %	0 %	60 %	40 %	386855270
68	NC_017790	ACGAG	2	10	62332	62341	40 %	0 %	40 %	20 %	386855273
69	NC_017790	GGCGA	2	10	62889	62898	20 %	0 %	60 %	20 %	386855273
70	NC_017790	GCGGG	2	10	64092	64101	0 %	0 %	80 %	20 %	386855273
71	NC_017790	GCTGG	2	10	64480	64489	0 %	20 %	60 %	20 %	386855274
72	NC_017790	CGGCC	2	10	64753	64762	0 %	0 %	40 %	60 %	386855274
73	NC_017790	CTGCG	2	10	64817	64826	0 %	20 %	40 %	40 %	386855274
74	NC_017790	GGCGC	2	10	65058	65067	0 %	0 %	60 %	40 %	386855274
75	NC_017790	CGGCC	2	10	65390	65399	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
76	NC_017790	CCGGC	2	10	66329	66338	0 %	0 %	40 %	60 %	386855276
77	NC_017790	GGCGC	2	10	66516	66525	0 %	0 %	60 %	40 %	386855276
78	NC_017790	GGCCC	2	10	67832	67841	0 %	0 %	40 %	60 %	386855277
79	NC_017790	GCCGG	2	10	70557	70566	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
80	NC_017790	GGCGT	2	10	71405	71414	0 %	20 %	60 %	20 %	386855280
81	NC_017790	GCGCC	2	10	71817	71826	0 %	0 %	40 %	60 %	386855280
82	NC_017790	GACCA	2	10	72442	72451	40 %	0 %	20 %	40 %	386855281
83	NC_017790	CTGCG	2	10	73135	73144	0 %	20 %	40 %	40 %	386855283
84	NC_017790	GCTGG	2	10	74804	74813	0 %	20 %	60 %	20 %	386855284
85	NC_017790	GCAGC	2	10	75608	75617	20 %	0 %	40 %	40 %	386855285
86	NC_017790	GCGGT	2	10	76473	76482	0 %	20 %	60 %	20 %	386855285
87	NC_017790	CCCGG	2	10	76894	76903	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
88	NC_017790	GGGCC	2	10	77026	77035	0 %	0 %	60 %	40 %	386855286
89	NC_017790	TCGGC	2	10	77872	77881	0 %	20 %	40 %	40 %	386855286
90	NC_017790	CCCAG	2	10	78181	78190	20 %	0 %	20 %	60 %	386855287
91	NC_017790	CCGGC	2	10	78582	78591	0 %	0 %	40 %	60 %	386855287
92	NC_017790	AGGGG	2	10	79492	79501	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017790	CCCCT	2	10	79524	79533	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
94	NC_017790	GCGCC	2	10	85305	85314	0 %	0 %	40 %	60 %	386855293
95	NC_017790	CAGGG	2	10	85476	85485	20 %	0 %	60 %	20 %	386855294
96	NC_017790	CGTCC	2	10	86518	86527	0 %	20 %	20 %	60 %	386855295
97	NC_017790	CGGCG	2	10	88593	88602	0 %	0 %	60 %	40 %	386855297
98	NC_017790	TGGCG	2	10	88910	88919	0 %	20 %	60 %	20 %	386855297
99	NC_017790	TGGCG	2	10	89661	89670	0 %	20 %	60 %	20 %	386855298
100	NC_017790	GGGGT	2	10	90155	90164	0 %	20 %	80 %	0 %	386855298
101	NC_017790	CGGCG	2	10	91243	91252	0 %	0 %	60 %	40 %	386855300
102	NC_017790	CCGGG	2	10	91717	91726	0 %	0 %	60 %	40 %	386855300
103	NC_017790	GCGCG	2	10	91837	91846	0 %	0 %	60 %	40 %	386855300
104	NC_017790	TCGCC	2	10	92838	92847	0 %	20 %	20 %	60 %	386855301
105	NC_017790	CCGGC	2	10	94010	94019	0 %	0 %	40 %	60 %	386855302
106	NC_017790	GGCCG	2	10	94127	94136	0 %	0 %	60 %	40 %	386855302
107	NC_017790	CGCGC	2	10	94661	94670	0 %	0 %	40 %	60 %	386855302
108	NC_017790	CGGCG	2	10	94885	94894	0 %	0 %	60 %	40 %	386855302
109	NC_017790	ACCGG	2	10	95345	95354	20 %	0 %	40 %	40 %	386855302
110	NC_017790	ACCGG	2	10	96031	96040	20 %	0 %	40 %	40 %	386855303
111	NC_017790	GCCGC	2	10	96987	96996	0 %	0 %	40 %	60 %	386855305
112	NC_017790	AGCGC	2	10	97187	97196	20 %	0 %	40 %	40 %	386855305
113	NC_017790	GCCCC	2	10	97468	97477	0 %	0 %	20 %	80 %	386855305
114	NC_017790	GGGGA	2	10	98357	98366	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017790	TGGAT	2	10	100057	100066	20 %	40 %	40 %	0 %	386855308
116	NC_017790	GCCCC	2	10	100240	100249	0 %	0 %	20 %	80 %	386855308
117	NC_017790	CTGCC	2	10	101953	101962	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
118	NC_017790	GGCTC	2	10	102507	102516	0 %	20 %	40 %	40 %	386855311
119	NC_017790	GCCGC	2	10	103035	103044	0 %	0 %	40 %	60 %	386855312
120	NC_017790	GGCGC	2	10	103381	103390	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
121	NC_017790	GGACC	2	10	103934	103943	20 %	0 %	40 %	40 %	386855313
122	NC_017790	GACCG	2	10	104101	104110	20 %	0 %	40 %	40 %	386855313
123	NC_017790	GCGCC	2	10	104530	104539	0 %	0 %	40 %	60 %	386855314
124	NC_017790	CGGCC	2	10	104953	104962	0 %	0 %	40 %	60 %	386855314
125	NC_017790	GGCGG	2	10	105095	105104	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
126	NC_017790	GGGCT	2	10	105464	105473	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
127	NC_017790	TGCGC	2	10	105511	105520	0 %	20 %	40 %	40 %	386855315
128	NC_017790	GGGCG	2	10	106813	106822	0 %	0 %	80 %	20 %	386855315
129	NC_017790	CGGCG	2	10	107767	107776	0 %	0 %	60 %	40 %	386855316
130	NC_017790	GCCCT	2	10	108053	108062	0 %	20 %	20 %	60 %	386855316
131	NC_017790	GCGCC	2	10	108102	108111	0 %	0 %	40 %	60 %	386855316
132	NC_017790	GGCCT	2	10	108144	108153	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
133	NC_017790	AATTG	2	10	111588	111597	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017790	ACCCG	2	10	113708	113717	20 %	0 %	20 %	60 %	386855318
135	NC_017790	CGGCC	2	10	114053	114062	0 %	0 %	40 %	60 %	386855318
136	NC_017790	GCCTC	2	10	115266	115275	0 %	20 %	20 %	60 %	386855320
137	NC_017790	TCGTC	2	10	116214	116223	0 %	40 %	20 %	40 %	386855320
138	NC_017790	CGCGG	2	10	116675	116684	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
139	NC_017790	CGGGG	2	10	116951	116960	0 %	0 %	80 %	20 %	386855321
140	NC_017790	GCCGG	2	10	117554	117563	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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261	NC_017790	GCCCG	2	10	212415	212424	0 %	0 %	40 %	60 %	386855414
262	NC_017790	GCCCG	2	10	213193	213202	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
263	NC_017790	GCCCG	2	10	213567	213576	0 %	0 %	40 %	60 %	386855417
264	NC_017790	GGCGA	2	10	214313	214322	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
265	NC_017790	GCACA	2	10	214490	214499	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
266	NC_017790	GGGTG	2	10	214722	214731	0 %	20 %	80 %	0 %	386855418
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269	NC_017790	GCCCG	2	10	216094	216103	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
270	NC_017790	CCCAG	2	10	217041	217050	20 %	0 %	20 %	60 %	386855419
271	NC_017790	CCCGG	2	10	217207	217216	0 %	0 %	40 %	60 %	386855419
272	NC_017790	CCGGC	2	10	217290	217299	0 %	0 %	40 %	60 %	386855419
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