MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017788	TAT	3	9	4	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858755
2	NC_017788	TCT	2	6	36	41	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858755
3	NC_017788	TAA	2	6	49	54	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858755
4	NC_017788	TTG	2	6	56	61	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858755
5	NC_017788	ATT	2	6	98	103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858755
6	NC_017788	ATT	2	6	116	121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858755
7	NC_017788	TTA	2	6	197	202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017788	TAA	2	6	269	274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017788	CTT	2	6	275	280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017788	ATT	2	6	285	290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017788	TAA	5	15	354	368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017788	ACA	2	6	372	377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017788	CTT	2	6	557	562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858756
14	NC_017788	TAT	2	6	563	568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858756
15	NC_017788	TAA	2	6	622	627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858756
16	NC_017788	TCT	2	6	630	635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858756
17	NC_017788	TCC	2	6	737	742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858756
18	NC_017788	TCT	2	6	769	774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858756
19	NC_017788	ATT	2	6	821	826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858756
20	NC_017788	TTC	2	6	854	859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858756
21	NC_017788	TCA	2	6	873	878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858756
22	NC_017788	ATT	3	9	902	910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858756
23	NC_017788	TTA	2	6	921	926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858756
24	NC_017788	TAT	2	6	968	973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017788	TTA	2	6	995	1000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017788	TAA	2	6	1028	1033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858757
27	NC_017788	ATA	2	6	1062	1067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858757
28	NC_017788	ACA	2	6	1097	1102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858757
29	NC_017788	TCT	2	6	1119	1124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858757
30	NC_017788	TAA	3	9	1213	1221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858757
31	NC_017788	CTT	2	6	1240	1245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858757
32	NC_017788	ACT	2	6	1319	1324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858757
33	NC_017788	TAA	3	9	1452	1460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858757
34	NC_017788	TAT	2	6	1507	1512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858757
35	NC_017788	TAA	2	6	1522	1527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858757
36	NC_017788	GTA	2	6	1626	1631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858757
37	NC_017788	ATC	2	6	1640	1645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858757
38	NC_017788	ATT	2	6	1695	1700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858757
39	NC_017788	AAT	2	6	1840	1845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858758
40	NC_017788	AGA	2	6	1897	1902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858758
41	NC_017788	TAC	2	6	1926	1931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858758
42	NC_017788	ATA	2	6	1954	1959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858758
43	NC_017788	TCT	2	6	2005	2010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858758
44	NC_017788	ATA	2	6	2041	2046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858758
45	NC_017788	CTT	2	6	2214	2219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858758
46	NC_017788	TGT	2	6	2243	2248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858758
47	NC_017788	CAA	2	6	2319	2324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858759
48	NC_017788	TCT	2	6	2402	2407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858759
49	NC_017788	ATT	2	6	2533	2538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858759
50	NC_017788	TAT	2	6	2544	2549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858759
51	NC_017788	TGT	2	6	2618	2623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858759
52	NC_017788	CAA	2	6	2664	2669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858759
53	NC_017788	TAA	2	6	2764	2769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858759
54	NC_017788	AAT	2	6	2779	2784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858759
55	NC_017788	TTA	2	6	2789	2794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858759
56	NC_017788	ATT	2	6	2834	2839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858759
57	NC_017788	TGT	2	6	2952	2957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858759
58	NC_017788	AAT	2	6	3056	3061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.