MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017787	TATTT	2	10	2451	2460	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017787	GAAAG	2	10	7102	7111	60 %	0 %	40 %	0 %	386858875
3	NC_017787	TTTTA	2	10	7441	7450	20 %	80 %	0 %	0 %	386858876
4	NC_017787	AAAAG	2	10	7725	7734	80 %	0 %	20 %	0 %	386858876
5	NC_017787	AAAAG	2	10	8600	8609	80 %	0 %	20 %	0 %	386858877
6	NC_017787	AGAGA	2	10	8684	8693	60 %	0 %	40 %	0 %	386858877
7	NC_017787	AGGTA	2	10	9118	9127	40 %	20 %	40 %	0 %	386858877
8	NC_017787	ATTAT	2	10	9795	9804	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017787	GAGAG	2	10	10080	10089	40 %	0 %	60 %	0 %	386858878
10	NC_017787	GATAA	2	10	11078	11087	60 %	20 %	20 %	0 %	386858878
11	NC_017787	ATGTG	2	10	11203	11212	20 %	40 %	40 %	0 %	386858879
12	NC_017787	ATTTT	2	10	11583	11592	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017787	GAGAG	2	10	11714	11723	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017787	GGAGA	2	10	13495	13504	40 %	0 %	60 %	0 %	386858881
15	NC_017787	TCAAA	2	10	13520	13529	60 %	20 %	0 %	20 %	386858881
16	NC_017787	AGTTT	2	10	13985	13994	20 %	60 %	20 %	0 %	386858882
17	NC_017787	CAAAA	2	10	15532	15541	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017787	AATAA	2	10	15577	15586	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017787	TAGTT	2	10	15637	15646	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017787	TGTCT	2	10	15969	15978	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017787	TAAAA	2	10	19229	19238	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017787	CTTTA	2	10	19265	19274	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017787	ATTTA	2	10	19960	19969	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017787	TCACT	2	10	20112	20121	20 %	40 %	0 %	40 %	386858889
25	NC_017787	CTTTT	2	10	21219	21228	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017787	TAAAC	2	10	22585	22594	60 %	20 %	0 %	20 %	386858892
27	NC_017787	TCCTC	2	10	22811	22820	0 %	40 %	0 %	60 %	386858892
28	NC_017787	TTTCT	2	10	23384	23393	0 %	80 %	0 %	20 %	386858893
29	NC_017787	TTATT	2	10	24051	24060	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017787	ATCAT	2	10	24066	24075	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017787	TTCTT	2	10	24858	24867	0 %	80 %	0 %	20 %	386858894
32	NC_017787	CTATT	2	10	25143	25152	20 %	60 %	0 %	20 %	386858895
33	NC_017787	TAAAA	2	10	25345	25354	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017787	CTTTA	2	10	25381	25390	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017787	TTATT	2	10	25403	25412	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017787	TTATC	2	10	26127	26136	20 %	60 %	0 %	20 %	386858896
37	NC_017787	TTCTT	2	10	26192	26201	0 %	80 %	0 %	20 %	386858896
38	NC_017787	CTTTT	2	10	30725	30734	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017787	ATTTT	2	10	30810	30819	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017787	ATCAA	2	10	31144	31153	60 %	20 %	0 %	20 %	386858899
41	NC_017787	TCTCC	2	10	32750	32759	0 %	40 %	0 %	60 %	386858901
42	NC_017787	TTTAA	2	10	35268	35277	40 %	60 %	0 %	0 %	386858903
43	NC_017787	TATCT	2	10	38243	38252	20 %	60 %	0 %	20 %	386858907
44	NC_017787	ATATG	2	10	39657	39666	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017787	ATAAA	2	10	39848	39857	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017787	GCAAA	2	10	40105	40114	60 %	0 %	20 %	20 %	386858910
47	NC_017787	AAAGA	2	10	40447	40456	80 %	0 %	20 %	0 %	386858911
48	NC_017787	AAAAT	2	10	40465	40474	80 %	20 %	0 %	0 %	386858911
49	NC_017787	ATAAA	2	10	40807	40816	80 %	20 %	0 %	0 %	386858911
50	NC_017787	AAGCC	2	10	42692	42701	40 %	0 %	20 %	40 %	386858914
51	NC_017787	AGAAA	2	10	42828	42837	80 %	0 %	20 %	0 %	386858914
52	NC_017787	ATATT	2	10	43266	43275	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017787	TAAAA	2	10	43615	43624	80 %	20 %	0 %	0 %	386858915
54	NC_017787	AGGTA	2	10	44284	44293	40 %	20 %	40 %	0 %	386858917
55	NC_017787	GAGAA	2	10	45231	45240	60 %	0 %	40 %	0 %	386858919
56	NC_017787	AGGAG	2	10	45265	45274	40 %	0 %	60 %	0 %	386858919
57	NC_017787	GAGAG	2	10	45977	45986	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017787	CAAAA	2	10	47880	47889	80 %	0 %	0 %	20 %	386858921
59	NC_017787	TAAAG	2	10	48124	48133	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017787	ATTTT	2	10	48444	48453	20 %	80 %	0 %	0 %	386858922
61	NC_017787	AATAA	2	10	49554	49563	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017787	TAAAG	2	10	49578	49587	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017787	CTCTT	2	10	49906	49915	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.