MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 149

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017787	TTTA	3	12	1	12	25 %	75 %	0 %	0 %	386858866
2	NC_017787	TTTA	2	8	696	703	25 %	75 %	0 %	0 %	386858867
3	NC_017787	ATAA	2	8	736	743	75 %	25 %	0 %	0 %	386858867
4	NC_017787	TAAA	2	8	834	841	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017787	GTCA	2	8	1562	1569	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017787	TAAA	2	8	1665	1672	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017787	CAAA	2	8	1968	1975	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017787	AAAT	2	8	2310	2317	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017787	TTTA	2	8	2382	2389	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017787	TTTA	2	8	2409	2416	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017787	TTTA	2	8	2943	2950	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017787	TTTA	2	8	3069	3076	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017787	CAAA	2	8	3184	3191	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017787	ATTA	2	8	3281	3288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017787	CAAA	2	8	3293	3300	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017787	GTCA	2	8	3913	3920	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017787	AAAT	2	8	4250	4257	75 %	25 %	0 %	0 %	386858870
18	NC_017787	ATTT	2	8	4385	4392	25 %	75 %	0 %	0 %	386858870
19	NC_017787	ATTG	2	8	4822	4829	25 %	50 %	25 %	0 %	386858872
20	NC_017787	ATGA	2	8	4961	4968	50 %	25 %	25 %	0 %	386858872
21	NC_017787	TTTG	2	8	5394	5401	0 %	75 %	25 %	0 %	386858872
22	NC_017787	TTTG	2	8	5560	5567	0 %	75 %	25 %	0 %	386858873
23	NC_017787	TCGT	2	8	6619	6626	0 %	50 %	25 %	25 %	386858874
24	NC_017787	AAGG	2	8	6826	6833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017787	TTAG	2	8	6923	6930	25 %	50 %	25 %	0 %	386858875
26	NC_017787	AAAG	2	8	7207	7214	75 %	0 %	25 %	0 %	386858875
27	NC_017787	TAGA	2	8	7218	7225	50 %	25 %	25 %	0 %	386858875
28	NC_017787	CGAT	2	8	7281	7288	25 %	25 %	25 %	25 %	386858875
29	NC_017787	AAAG	2	8	7915	7922	75 %	0 %	25 %	0 %	386858876
30	NC_017787	ATTT	2	8	7979	7986	25 %	75 %	0 %	0 %	386858876
31	NC_017787	ATAA	2	8	8392	8399	75 %	25 %	0 %	0 %	386858876
32	NC_017787	ATTA	2	8	8493	8500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017787	TAAT	2	8	8508	8515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017787	AGCA	2	8	9001	9008	50 %	0 %	25 %	25 %	386858877
35	NC_017787	ATGA	2	8	9950	9957	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017787	GATA	2	8	10798	10805	50 %	25 %	25 %	0 %	386858878
37	NC_017787	AGTA	2	8	11062	11069	50 %	25 %	25 %	0 %	386858878
38	NC_017787	TAAA	2	8	11170	11177	75 %	25 %	0 %	0 %	386858878
39	NC_017787	TTAT	2	8	11244	11251	25 %	75 %	0 %	0 %	386858879
40	NC_017787	TTAA	2	8	11286	11293	50 %	50 %	0 %	0 %	386858879
41	NC_017787	ACAA	2	8	11321	11328	75 %	0 %	0 %	25 %	386858879
42	NC_017787	ATTC	2	8	11563	11570	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017787	TTTG	2	8	11575	11582	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017787	ATAA	2	8	11630	11637	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017787	TGAG	2	8	11825	11832	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017787	AATT	2	8	13162	13169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017787	CAAT	2	8	13322	13329	50 %	25 %	0 %	25 %	386858880
48	NC_017787	TAAG	2	8	13917	13924	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017787	GAGT	2	8	14576	14583	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017787	AAGA	2	8	15811	15818	75 %	0 %	25 %	0 %	386858885
51	NC_017787	AGGA	2	8	16277	16284	50 %	0 %	50 %	0 %	386858886
52	NC_017787	AAGG	2	8	16293	16300	50 %	0 %	50 %	0 %	386858886
53	NC_017787	AAGA	2	8	16392	16399	75 %	0 %	25 %	0 %	386858886
54	NC_017787	GAAA	2	8	16425	16432	75 %	0 %	25 %	0 %	386858886
55	NC_017787	AAAT	2	8	16439	16446	75 %	25 %	0 %	0 %	386858886
56	NC_017787	TAAT	2	8	16517	16524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017787	TTTG	2	8	16672	16679	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017787	TTTG	2	8	16699	16706	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017787	AAAT	2	8	16722	16729	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017787	TTTA	2	8	18316	18323	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017787	AAAT	2	8	18496	18503	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017787	AAAT	2	8	18671	18678	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017787	TATT	2	8	18927	18934	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017787	TTTG	2	8	19118	19125	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017787	TTTA	2	8	19293	19300	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017787	CTTT	2	8	19495	19502	0 %	75 %	0 %	25 %	386858887
67	NC_017787	TCCT	2	8	19774	19781	0 %	50 %	0 %	50 %	386858888
68	NC_017787	TTGT	2	8	19913	19920	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017787	TACT	2	8	20095	20102	25 %	50 %	0 %	25 %	386858889
70	NC_017787	CTTT	2	8	20666	20673	0 %	75 %	0 %	25 %	386858889
71	NC_017787	TTAC	2	8	20753	20760	25 %	50 %	0 %	25 %	386858889
72	NC_017787	TTTA	2	8	21197	21204	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017787	CTTA	2	8	21399	21406	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017787	ATAA	2	8	21644	21651	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017787	AATT	2	8	21698	21705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017787	CTGC	2	8	22437	22444	0 %	25 %	25 %	50 %	386858892
77	NC_017787	AACT	2	8	22525	22532	50 %	25 %	0 %	25 %	386858892
78	NC_017787	TTTA	2	8	22942	22949	25 %	75 %	0 %	0 %	386858892
79	NC_017787	AAAT	2	8	22999	23006	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017787	ATGG	2	8	23013	23020	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017787	TTTA	2	8	23056	23063	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017787	TTTA	4	16	23120	23135	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017787	TACT	2	8	23683	23690	25 %	50 %	0 %	25 %	386858893
84	NC_017787	CCTT	2	8	23719	23726	0 %	50 %	0 %	50 %	386858893
85	NC_017787	TTCT	2	8	23876	23883	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017787	ATTT	2	8	23977	23984	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017787	AATT	2	8	24740	24747	50 %	50 %	0 %	0 %	386858894
88	NC_017787	TTAC	2	8	25031	25038	25 %	50 %	0 %	25 %	386858895
89	NC_017787	CATT	2	8	25233	25240	25 %	50 %	0 %	25 %	386858895
90	NC_017787	TTAC	2	8	26366	26373	25 %	50 %	0 %	25 %	386858896
91	NC_017787	TCCT	2	8	26404	26411	0 %	50 %	0 %	50 %	386858896
92	NC_017787	ACTC	2	8	26500	26507	25 %	25 %	0 %	50 %	386858896
93	NC_017787	GATG	2	8	26674	26681	25 %	25 %	50 %	0 %	386858897
94	NC_017787	ATCT	2	8	27074	27081	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017787	TTTA	2	8	27193	27200	25 %	75 %	0 %	0 %	386858898
96	NC_017787	CTTT	2	8	27651	27658	0 %	75 %	0 %	25 %	386858898
97	NC_017787	CATA	2	8	28301	28308	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017787	ATAA	2	8	28309	28316	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017787	CAAA	2	8	30744	30751	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017787	TGAA	2	8	30793	30800	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017787	TCTT	2	8	30858	30865	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017787	TAAA	2	8	30957	30964	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017787	ATTT	2	8	31012	31019	25 %	75 %	0 %	0 %	386858899
104	NC_017787	TATC	2	8	31403	31410	25 %	50 %	0 %	25 %	386858899
105	NC_017787	TAGT	2	8	31691	31698	25 %	50 %	25 %	0 %	386858899
106	NC_017787	CAAT	2	8	31703	31710	50 %	25 %	0 %	25 %	386858899
107	NC_017787	TTTC	2	8	32159	32166	0 %	75 %	0 %	25 %	386858899
108	NC_017787	ATAA	2	8	32354	32361	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017787	ATAA	2	8	32373	32380	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017787	CACC	2	8	34757	34764	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
111	NC_017787	AATT	2	8	34770	34777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017787	AATA	2	8	34972	34979	75 %	25 %	0 %	0 %	386858902
113	NC_017787	TACA	2	8	35655	35662	50 %	25 %	0 %	25 %	386858904
114	NC_017787	AAGA	2	8	37564	37571	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017787	CCTT	2	8	37748	37755	0 %	50 %	0 %	50 %	386858905
116	NC_017787	TATT	2	8	38844	38851	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017787	AACG	2	8	39276	39283	50 %	0 %	25 %	25 %	386858909
118	NC_017787	ATCA	2	8	39326	39333	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017787	TAAA	2	8	39695	39702	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017787	AAAT	2	8	39730	39737	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017787	AGAA	2	8	40203	40210	75 %	0 %	25 %	0 %	386858910
122	NC_017787	AAAG	2	8	40598	40605	75 %	0 %	25 %	0 %	386858911
123	NC_017787	AACA	2	8	40968	40975	75 %	0 %	0 %	25 %	386858911
124	NC_017787	AATG	2	8	41221	41228	50 %	25 %	25 %	0 %	386858912
125	NC_017787	AAAT	2	8	41263	41270	75 %	25 %	0 %	0 %	386858912
126	NC_017787	GATA	2	8	42180	42187	50 %	25 %	25 %	0 %	386858913
127	NC_017787	TGGA	2	8	42733	42740	25 %	25 %	50 %	0 %	386858914
128	NC_017787	CAAA	2	8	42761	42768	75 %	0 %	0 %	25 %	386858914
129	NC_017787	TTAA	2	8	43228	43235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017787	TTAA	2	8	43454	43461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017787	TTCT	2	8	43905	43912	0 %	75 %	0 %	25 %	386858916
132	NC_017787	TAAG	2	8	44313	44320	50 %	25 %	25 %	0 %	386858918
133	NC_017787	AAAG	2	8	44770	44777	75 %	0 %	25 %	0 %	386858918
134	NC_017787	AGTA	2	8	44899	44906	50 %	25 %	25 %	0 %	386858918
135	NC_017787	GTTA	2	8	45074	45081	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017787	AGCA	2	8	45584	45591	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017787	AAAG	2	8	45779	45786	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017787	AGTG	2	8	46378	46385	25 %	25 %	50 %	0 %	386858920
139	NC_017787	TTAG	2	8	46627	46634	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017787	AGAA	2	8	46768	46775	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017787	GATA	2	8	47890	47897	50 %	25 %	25 %	0 %	386858921
142	NC_017787	AAAT	2	8	47932	47939	75 %	25 %	0 %	0 %	386858921
143	NC_017787	ACAA	2	8	48270	48277	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017787	AATC	2	8	48374	48381	50 %	25 %	0 %	25 %	386858922
145	NC_017787	ATTC	2	8	48424	48431	25 %	50 %	0 %	25 %	386858922
146	NC_017787	GCGA	2	8	49292	49299	25 %	0 %	50 %	25 %	386858923
147	NC_017787	AAAT	2	8	49520	49527	75 %	25 %	0 %	0 %	386858923
148	NC_017787	ACAA	3	12	49726	49737	75 %	0 %	0 %	25 %	386858924
149	NC_017787	TCTT	2	8	49776	49783	0 %	75 %	0 %	25 %	386858924

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.