MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017787	TAAA	2	8	834	841	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017787	GTCA	2	8	1562	1569	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017787	TAAA	2	8	1665	1672	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017787	CAAA	2	8	1968	1975	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017787	AAAT	2	8	2310	2317	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017787	TTTA	2	8	2382	2389	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017787	TTTA	2	8	2409	2416	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017787	TTTA	2	8	2943	2950	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017787	TTTA	2	8	3069	3076	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017787	CAAA	2	8	3184	3191	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017787	ATTA	2	8	3281	3288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017787	CAAA	2	8	3293	3300	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017787	GTCA	2	8	3913	3920	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017787	AAGG	2	8	6826	6833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017787	ATTA	2	8	8493	8500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017787	TAAT	2	8	8508	8515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017787	ATGA	2	8	9950	9957	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017787	ATTC	2	8	11563	11570	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017787	TTTG	2	8	11575	11582	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017787	ATAA	2	8	11630	11637	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017787	TGAG	2	8	11825	11832	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017787	AATT	2	8	13162	13169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017787	TAAG	2	8	13917	13924	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017787	GAGT	2	8	14576	14583	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017787	TAAT	2	8	16517	16524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017787	TTTG	2	8	16672	16679	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017787	TTTG	2	8	16699	16706	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017787	AAAT	2	8	16722	16729	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017787	TTTA	2	8	18316	18323	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017787	AAAT	2	8	18496	18503	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017787	AAAT	2	8	18671	18678	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017787	TATT	2	8	18927	18934	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017787	TTTG	2	8	19118	19125	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017787	TTTA	2	8	19293	19300	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017787	TTGT	2	8	19913	19920	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017787	TTTA	2	8	21197	21204	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017787	CTTA	2	8	21399	21406	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017787	ATAA	2	8	21644	21651	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017787	AATT	2	8	21698	21705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017787	AAAT	2	8	22999	23006	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017787	ATGG	2	8	23013	23020	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017787	TTTA	2	8	23056	23063	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017787	TTTA	4	16	23120	23135	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017787	TTCT	2	8	23876	23883	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017787	ATTT	2	8	23977	23984	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017787	ATCT	2	8	27074	27081	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017787	CATA	2	8	28301	28308	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017787	ATAA	2	8	28309	28316	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017787	CAAA	2	8	30744	30751	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017787	TGAA	2	8	30793	30800	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017787	TCTT	2	8	30858	30865	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017787	TAAA	2	8	30957	30964	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017787	ATAA	2	8	32354	32361	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017787	ATAA	2	8	32373	32380	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017787	CACC	2	8	34757	34764	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
56	NC_017787	AATT	2	8	34770	34777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017787	AAGA	2	8	37564	37571	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017787	TATT	2	8	38844	38851	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017787	ATCA	2	8	39326	39333	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017787	TAAA	2	8	39695	39702	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017787	AAAT	2	8	39730	39737	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017787	TTAA	2	8	43228	43235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017787	TTAA	2	8	43454	43461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017787	GTTA	2	8	45074	45081	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017787	AGCA	2	8	45584	45591	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017787	AAAG	2	8	45779	45786	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017787	TTAG	2	8	46627	46634	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017787	AGAA	2	8	46768	46775	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017787	ACAA	2	8	48270	48277	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.