MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017787	TTTA	3	12	1	12	25 %	75 %	0 %	0 %	386858866
2	NC_017787	TTTA	2	8	696	703	25 %	75 %	0 %	0 %	386858867
3	NC_017787	ATAA	2	8	736	743	75 %	25 %	0 %	0 %	386858867
4	NC_017787	AAAT	2	8	4250	4257	75 %	25 %	0 %	0 %	386858870
5	NC_017787	ATTT	2	8	4385	4392	25 %	75 %	0 %	0 %	386858870
6	NC_017787	ATTG	2	8	4822	4829	25 %	50 %	25 %	0 %	386858872
7	NC_017787	ATGA	2	8	4961	4968	50 %	25 %	25 %	0 %	386858872
8	NC_017787	TTTG	2	8	5394	5401	0 %	75 %	25 %	0 %	386858872
9	NC_017787	TTTG	2	8	5560	5567	0 %	75 %	25 %	0 %	386858873
10	NC_017787	TCGT	2	8	6619	6626	0 %	50 %	25 %	25 %	386858874
11	NC_017787	TTAG	2	8	6923	6930	25 %	50 %	25 %	0 %	386858875
12	NC_017787	AAAG	2	8	7207	7214	75 %	0 %	25 %	0 %	386858875
13	NC_017787	TAGA	2	8	7218	7225	50 %	25 %	25 %	0 %	386858875
14	NC_017787	CGAT	2	8	7281	7288	25 %	25 %	25 %	25 %	386858875
15	NC_017787	AAAG	2	8	7915	7922	75 %	0 %	25 %	0 %	386858876
16	NC_017787	ATTT	2	8	7979	7986	25 %	75 %	0 %	0 %	386858876
17	NC_017787	ATAA	2	8	8392	8399	75 %	25 %	0 %	0 %	386858876
18	NC_017787	AGCA	2	8	9001	9008	50 %	0 %	25 %	25 %	386858877
19	NC_017787	GATA	2	8	10798	10805	50 %	25 %	25 %	0 %	386858878
20	NC_017787	AGTA	2	8	11062	11069	50 %	25 %	25 %	0 %	386858878
21	NC_017787	TAAA	2	8	11170	11177	75 %	25 %	0 %	0 %	386858878
22	NC_017787	TTAT	2	8	11244	11251	25 %	75 %	0 %	0 %	386858879
23	NC_017787	TTAA	2	8	11286	11293	50 %	50 %	0 %	0 %	386858879
24	NC_017787	ACAA	2	8	11321	11328	75 %	0 %	0 %	25 %	386858879
25	NC_017787	CAAT	2	8	13322	13329	50 %	25 %	0 %	25 %	386858880
26	NC_017787	AAGA	2	8	15811	15818	75 %	0 %	25 %	0 %	386858885
27	NC_017787	AGGA	2	8	16277	16284	50 %	0 %	50 %	0 %	386858886
28	NC_017787	AAGG	2	8	16293	16300	50 %	0 %	50 %	0 %	386858886
29	NC_017787	AAGA	2	8	16392	16399	75 %	0 %	25 %	0 %	386858886
30	NC_017787	GAAA	2	8	16425	16432	75 %	0 %	25 %	0 %	386858886
31	NC_017787	AAAT	2	8	16439	16446	75 %	25 %	0 %	0 %	386858886
32	NC_017787	CTTT	2	8	19495	19502	0 %	75 %	0 %	25 %	386858887
33	NC_017787	TCCT	2	8	19774	19781	0 %	50 %	0 %	50 %	386858888
34	NC_017787	TACT	2	8	20095	20102	25 %	50 %	0 %	25 %	386858889
35	NC_017787	CTTT	2	8	20666	20673	0 %	75 %	0 %	25 %	386858889
36	NC_017787	TTAC	2	8	20753	20760	25 %	50 %	0 %	25 %	386858889
37	NC_017787	CTGC	2	8	22437	22444	0 %	25 %	25 %	50 %	386858892
38	NC_017787	AACT	2	8	22525	22532	50 %	25 %	0 %	25 %	386858892
39	NC_017787	TTTA	2	8	22942	22949	25 %	75 %	0 %	0 %	386858892
40	NC_017787	TACT	2	8	23683	23690	25 %	50 %	0 %	25 %	386858893
41	NC_017787	CCTT	2	8	23719	23726	0 %	50 %	0 %	50 %	386858893
42	NC_017787	AATT	2	8	24740	24747	50 %	50 %	0 %	0 %	386858894
43	NC_017787	TTAC	2	8	25031	25038	25 %	50 %	0 %	25 %	386858895
44	NC_017787	CATT	2	8	25233	25240	25 %	50 %	0 %	25 %	386858895
45	NC_017787	TTAC	2	8	26366	26373	25 %	50 %	0 %	25 %	386858896
46	NC_017787	TCCT	2	8	26404	26411	0 %	50 %	0 %	50 %	386858896
47	NC_017787	ACTC	2	8	26500	26507	25 %	25 %	0 %	50 %	386858896
48	NC_017787	GATG	2	8	26674	26681	25 %	25 %	50 %	0 %	386858897
49	NC_017787	TTTA	2	8	27193	27200	25 %	75 %	0 %	0 %	386858898
50	NC_017787	CTTT	2	8	27651	27658	0 %	75 %	0 %	25 %	386858898
51	NC_017787	ATTT	2	8	31012	31019	25 %	75 %	0 %	0 %	386858899
52	NC_017787	TATC	2	8	31403	31410	25 %	50 %	0 %	25 %	386858899
53	NC_017787	TAGT	2	8	31691	31698	25 %	50 %	25 %	0 %	386858899
54	NC_017787	CAAT	2	8	31703	31710	50 %	25 %	0 %	25 %	386858899
55	NC_017787	TTTC	2	8	32159	32166	0 %	75 %	0 %	25 %	386858899
56	NC_017787	AATA	2	8	34972	34979	75 %	25 %	0 %	0 %	386858902
57	NC_017787	TACA	2	8	35655	35662	50 %	25 %	0 %	25 %	386858904
58	NC_017787	CCTT	2	8	37748	37755	0 %	50 %	0 %	50 %	386858905
59	NC_017787	AACG	2	8	39276	39283	50 %	0 %	25 %	25 %	386858909
60	NC_017787	AGAA	2	8	40203	40210	75 %	0 %	25 %	0 %	386858910
61	NC_017787	AAAG	2	8	40598	40605	75 %	0 %	25 %	0 %	386858911
62	NC_017787	AACA	2	8	40968	40975	75 %	0 %	0 %	25 %	386858911
63	NC_017787	AATG	2	8	41221	41228	50 %	25 %	25 %	0 %	386858912
64	NC_017787	AAAT	2	8	41263	41270	75 %	25 %	0 %	0 %	386858912
65	NC_017787	GATA	2	8	42180	42187	50 %	25 %	25 %	0 %	386858913
66	NC_017787	TGGA	2	8	42733	42740	25 %	25 %	50 %	0 %	386858914
67	NC_017787	CAAA	2	8	42761	42768	75 %	0 %	0 %	25 %	386858914
68	NC_017787	TTCT	2	8	43905	43912	0 %	75 %	0 %	25 %	386858916
69	NC_017787	TAAG	2	8	44313	44320	50 %	25 %	25 %	0 %	386858918
70	NC_017787	AAAG	2	8	44770	44777	75 %	0 %	25 %	0 %	386858918
71	NC_017787	AGTA	2	8	44899	44906	50 %	25 %	25 %	0 %	386858918
72	NC_017787	AGTG	2	8	46378	46385	25 %	25 %	50 %	0 %	386858920
73	NC_017787	GATA	2	8	47890	47897	50 %	25 %	25 %	0 %	386858921
74	NC_017787	AAAT	2	8	47932	47939	75 %	25 %	0 %	0 %	386858921
75	NC_017787	AATC	2	8	48374	48381	50 %	25 %	0 %	25 %	386858922
76	NC_017787	ATTC	2	8	48424	48431	25 %	50 %	0 %	25 %	386858922
77	NC_017787	GCGA	2	8	49292	49299	25 %	0 %	50 %	25 %	386858923
78	NC_017787	AAAT	2	8	49520	49527	75 %	25 %	0 %	0 %	386858923
79	NC_017787	ACAA	3	12	49726	49737	75 %	0 %	0 %	25 %	386858924
80	NC_017787	TCTT	2	8	49776	49783	0 %	75 %	0 %	25 %	386858924

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.