MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017787	TA	3	6	554	559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017787	AG	3	6	1705	1710	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017787	AT	3	6	2068	2073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017787	TA	3	6	2231	2236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017787	TA	3	6	2375	2380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017787	AG	3	6	4056	4061	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017787	TA	4	8	6147	6154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017787	AT	3	6	8476	8481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017787	CT	3	6	8534	8539	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017787	AG	3	6	11690	11695	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017787	AG	3	6	11725	11730	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017787	AG	3	6	11734	11739	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017787	AG	3	6	13154	13159	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017787	TA	3	6	16029	16034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017787	TA	4	8	16038	16045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017787	TA	3	6	16829	16834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017787	TA	3	6	18306	18311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017787	TA	3	6	18546	18551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017787	AC	3	6	19221	19226	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017787	TA	3	6	21254	21259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017787	AT	3	6	21765	21770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017787	TA	3	6	23178	23183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017787	CT	4	8	23839	23846	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017787	CT	4	8	23849	23856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017787	CT	3	6	23861	23866	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017787	CA	3	6	25313	25318	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017787	TA	3	6	25420	25425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017787	TC	3	6	26516	26521	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017787	CT	5	10	30644	30653	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017787	AT	3	6	30850	30855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017787	AT	3	6	30927	30932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017787	CA	3	6	32225	32230	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017787	TA	3	6	32268	32273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017787	CT	3	6	32314	32319	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017787	TC	3	6	38884	38889	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017787	AT	3	6	39495	39500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017787	AC	3	6	39673	39678	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017787	AT	3	6	43021	43026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017787	AT	3	6	43047	43052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017787	AT	3	6	43081	43086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017787	TA	3	6	43133	43138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017787	TA	3	6	43316	43321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017787	AT	3	6	43820	43825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017787	CT	3	6	45097	45102	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017787	TA	3	6	45118	45123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017787	AT	3	6	45475	45480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017787	AT	3	6	45619	45624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017787	AG	3	6	46647	46652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017787	CT	3	6	46661	46666	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017787	TA	3	6	46708	46713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017787	AT	3	6	47993	47998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.