MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017787	AT	3	6	720	725	50 %	50 %	0 %	0 %	386858867
2	NC_017787	TA	4	8	794	801	50 %	50 %	0 %	0 %	386858867
3	NC_017787	AT	3	6	2642	2647	50 %	50 %	0 %	0 %	386858869
4	NC_017787	AT	3	6	2852	2857	50 %	50 %	0 %	0 %	386858869
5	NC_017787	GA	3	6	4347	4352	50 %	0 %	50 %	0 %	386858870
6	NC_017787	TA	3	6	4561	4566	50 %	50 %	0 %	0 %	386858870
7	NC_017787	TA	3	6	4937	4942	50 %	50 %	0 %	0 %	386858872
8	NC_017787	AG	3	6	5272	5277	50 %	0 %	50 %	0 %	386858872
9	NC_017787	TA	4	8	5700	5707	50 %	50 %	0 %	0 %	386858873
10	NC_017787	AT	3	6	5776	5781	50 %	50 %	0 %	0 %	386858873
11	NC_017787	AG	3	6	5958	5963	50 %	0 %	50 %	0 %	386858873
12	NC_017787	AT	3	6	6613	6618	50 %	50 %	0 %	0 %	386858874
13	NC_017787	AG	3	6	6656	6661	50 %	0 %	50 %	0 %	386858874
14	NC_017787	AT	3	6	8069	8074	50 %	50 %	0 %	0 %	386858876
15	NC_017787	GA	3	6	8408	8413	50 %	0 %	50 %	0 %	386858876
16	NC_017787	TA	3	6	8567	8572	50 %	50 %	0 %	0 %	386858877
17	NC_017787	GA	3	6	8670	8675	50 %	0 %	50 %	0 %	386858877
18	NC_017787	AG	3	6	8696	8701	50 %	0 %	50 %	0 %	386858877
19	NC_017787	GA	3	6	8803	8808	50 %	0 %	50 %	0 %	386858877
20	NC_017787	AT	3	6	9090	9095	50 %	50 %	0 %	0 %	386858877
21	NC_017787	GA	3	6	10065	10070	50 %	0 %	50 %	0 %	386858878
22	NC_017787	AG	3	6	10091	10096	50 %	0 %	50 %	0 %	386858878
23	NC_017787	AG	3	6	10100	10105	50 %	0 %	50 %	0 %	386858878
24	NC_017787	TC	3	6	11219	11224	0 %	50 %	0 %	50 %	386858879
25	NC_017787	GA	3	6	13960	13965	50 %	0 %	50 %	0 %	386858882
26	NC_017787	GA	3	6	15741	15746	50 %	0 %	50 %	0 %	386858885
27	NC_017787	AG	3	6	16303	16308	50 %	0 %	50 %	0 %	386858886
28	NC_017787	AG	3	6	16321	16326	50 %	0 %	50 %	0 %	386858886
29	NC_017787	AT	3	6	20463	20468	50 %	50 %	0 %	0 %	386858889
30	NC_017787	AT	3	6	22227	22232	50 %	50 %	0 %	0 %	386858892
31	NC_017787	TC	3	6	22905	22910	0 %	50 %	0 %	50 %	386858892
32	NC_017787	AT	3	6	24448	24453	50 %	50 %	0 %	0 %	386858894
33	NC_017787	CT	3	6	26168	26173	0 %	50 %	0 %	50 %	386858896
34	NC_017787	AT	3	6	27957	27962	50 %	50 %	0 %	0 %	386858898
35	NC_017787	TC	3	6	32096	32101	0 %	50 %	0 %	50 %	386858899
36	NC_017787	CT	3	6	32106	32111	0 %	50 %	0 %	50 %	386858899
37	NC_017787	TC	3	6	32112	32117	0 %	50 %	0 %	50 %	386858899
38	NC_017787	CT	3	6	32118	32123	0 %	50 %	0 %	50 %	386858899
39	NC_017787	TC	3	6	32132	32137	0 %	50 %	0 %	50 %	386858899
40	NC_017787	CT	3	6	32413	32418	0 %	50 %	0 %	50 %	386858900
41	NC_017787	AT	4	8	35205	35212	50 %	50 %	0 %	0 %	386858902
42	NC_017787	AT	3	6	37665	37670	50 %	50 %	0 %	0 %	386858905
43	NC_017787	AT	3	6	37938	37943	50 %	50 %	0 %	0 %	386858906
44	NC_017787	CT	3	6	38624	38629	0 %	50 %	0 %	50 %	386858907
45	NC_017787	TA	4	8	40427	40434	50 %	50 %	0 %	0 %	386858911
46	NC_017787	AT	3	6	40734	40739	50 %	50 %	0 %	0 %	386858911
47	NC_017787	AT	3	6	40743	40748	50 %	50 %	0 %	0 %	386858911
48	NC_017787	AT	3	6	40888	40893	50 %	50 %	0 %	0 %	386858911
49	NC_017787	CA	3	6	41210	41215	50 %	0 %	0 %	50 %	386858912
50	NC_017787	TA	3	6	41589	41594	50 %	50 %	0 %	0 %	386858912
51	NC_017787	AT	3	6	42055	42060	50 %	50 %	0 %	0 %	386858913
52	NC_017787	AT	3	6	42349	42354	50 %	50 %	0 %	0 %	386858913
53	NC_017787	AT	3	6	44631	44636	50 %	50 %	0 %	0 %	386858918
54	NC_017787	AG	3	6	46574	46579	50 %	0 %	50 %	0 %	386858920
55	NC_017787	AG	3	6	46833	46838	50 %	0 %	50 %	0 %	386858921
56	NC_017787	AG	3	6	47111	47116	50 %	0 %	50 %	0 %	386858921
57	NC_017787	GA	3	6	48577	48582	50 %	0 %	50 %	0 %	386858923
58	NC_017787	AG	3	6	48587	48592	50 %	0 %	50 %	0 %	386858923

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.