MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017786	TAATCT	2	12	1093	1104	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386858708
2	NC_017786	CCATCA	2	12	1549	1560	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386858708
3	NC_017786	ACAAAA	2	12	1613	1624	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	386858709
4	NC_017786	CATTAG	2	12	2369	2380	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386858710
5	NC_017786	TAGTAT	2	12	5617	5628	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386858717
6	NC_017786	TCACCA	2	12	6015	6026	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386858717
7	NC_017786	AAATTG	2	12	10277	10288	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386858720
8	NC_017786	TCTTTT	2	12	11429	11440	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386858722
9	NC_017786	TTTATC	2	12	11878	11889	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386858723
10	NC_017786	TAGTTT	2	12	13618	13629	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386858725
11	NC_017786	ATCCTA	2	12	16599	16610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858728
12	NC_017786	GTAGCA	2	12	24900	24911	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386858735
13	NC_017786	TTTAGC	2	12	25022	25033	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386858735
14	NC_017786	GCAAAT	2	12	26188	26199	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386858736
15	NC_017786	TTGGCT	2	12	27727	27738	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386858737
16	NC_017786	GTACTG	2	12	27743	27754	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386858737
17	NC_017786	ATGAAA	2	12	28308	28319	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386858738
18	NC_017786	GTGATG	2	12	28335	28346	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386858738
19	NC_017786	AGGAGA	2	12	32539	32550	50 %	0 %	50 %	0 %	386858742
20	NC_017786	AGCAGG	2	12	32647	32658	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386858742
21	NC_017786	GTGATG	2	12	35652	35663	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386858746
22	NC_017786	ATTAAT	2	12	36585	36596	50 %	50 %	0 %	0 %	386858746
23	NC_017786	TGCTAA	2	12	39837	39848	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386858750

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.