MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017786	CTTTT	2	10	89	98	0 %	80 %	0 %	20 %	386858707
2	NC_017786	ATTTT	2	10	175	184	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017786	AAATA	2	10	1670	1679	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017786	CTTTT	2	10	3081	3090	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017786	TACCT	2	10	5190	5199	20 %	40 %	0 %	40 %	386858716
6	NC_017786	CTCTT	2	10	5265	5274	0 %	60 %	0 %	40 %	386858716
7	NC_017786	CTCTT	2	10	5320	5329	0 %	60 %	0 %	40 %	386858716
8	NC_017786	CTTTA	2	10	5512	5521	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017786	TTATC	2	10	6244	6253	20 %	60 %	0 %	20 %	386858717
10	NC_017786	TTCTT	2	10	6309	6318	0 %	80 %	0 %	20 %	386858717
11	NC_017786	CTATT	2	10	6589	6598	20 %	60 %	0 %	20 %	386858718
12	NC_017786	ATACT	2	10	6628	6637	40 %	40 %	0 %	20 %	386858718
13	NC_017786	TAAGC	2	10	6694	6703	40 %	20 %	20 %	20 %	386858718
14	NC_017786	ATTAA	2	10	7991	8000	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017786	AAATT	2	10	8114	8123	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017786	TTTAC	2	10	8230	8239	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017786	AATAA	2	10	8835	8844	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017786	AGATA	2	10	10330	10339	60 %	20 %	20 %	0 %	386858720
19	NC_017786	TAACT	2	10	11483	11492	40 %	40 %	0 %	20 %	386858722
20	NC_017786	CATTT	2	10	12763	12772	20 %	60 %	0 %	20 %	386858724
21	NC_017786	CTATT	2	10	13413	13422	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017786	GGTTT	2	10	14443	14452	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017786	AAATA	2	10	16085	16094	80 %	20 %	0 %	0 %	386858728
24	NC_017786	TAGAT	2	10	16555	16564	40 %	40 %	20 %	0 %	386858728
25	NC_017786	ATTTT	2	10	17274	17283	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017786	AAAAT	2	10	17387	17396	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017786	AAGTA	2	10	20679	20688	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017786	CAGGT	2	10	21198	21207	20 %	20 %	40 %	20 %	386858731
29	NC_017786	AGGTA	2	10	24596	24605	40 %	20 %	40 %	0 %	386858735
30	NC_017786	AGGTA	2	10	27300	27309	40 %	20 %	40 %	0 %	386858737
31	NC_017786	GAGAA	2	10	28272	28281	60 %	0 %	40 %	0 %	386858738
32	NC_017786	GGAGA	2	10	28282	28291	40 %	0 %	60 %	0 %	386858738
33	NC_017786	AATTA	2	10	28955	28964	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017786	GGTAT	2	10	30509	30518	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017786	GAGAA	2	10	33114	33123	60 %	0 %	40 %	0 %	386858743
36	NC_017786	AAAGT	2	10	34572	34581	60 %	20 %	20 %	0 %	386858745
37	NC_017786	AGATA	2	10	35969	35978	60 %	20 %	20 %	0 %	386858746
38	NC_017786	ATTAG	2	10	38043	38052	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017786	AAAAT	2	10	38236	38245	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017786	GAGAA	2	10	38665	38674	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.