MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017786	CTTTT	2	10	89	98	0 %	80 %	0 %	20 %	386858707
2	NC_017786	TACCT	2	10	5190	5199	20 %	40 %	0 %	40 %	386858716
3	NC_017786	CTCTT	2	10	5265	5274	0 %	60 %	0 %	40 %	386858716
4	NC_017786	CTCTT	2	10	5320	5329	0 %	60 %	0 %	40 %	386858716
5	NC_017786	TTATC	2	10	6244	6253	20 %	60 %	0 %	20 %	386858717
6	NC_017786	TTCTT	2	10	6309	6318	0 %	80 %	0 %	20 %	386858717
7	NC_017786	CTATT	2	10	6589	6598	20 %	60 %	0 %	20 %	386858718
8	NC_017786	ATACT	2	10	6628	6637	40 %	40 %	0 %	20 %	386858718
9	NC_017786	TAAGC	2	10	6694	6703	40 %	20 %	20 %	20 %	386858718
10	NC_017786	AGATA	2	10	10330	10339	60 %	20 %	20 %	0 %	386858720
11	NC_017786	TAACT	2	10	11483	11492	40 %	40 %	0 %	20 %	386858722
12	NC_017786	CATTT	2	10	12763	12772	20 %	60 %	0 %	20 %	386858724
13	NC_017786	AAATA	2	10	16085	16094	80 %	20 %	0 %	0 %	386858728
14	NC_017786	TAGAT	2	10	16555	16564	40 %	40 %	20 %	0 %	386858728
15	NC_017786	CAGGT	2	10	21198	21207	20 %	20 %	40 %	20 %	386858731
16	NC_017786	AGGTA	2	10	24596	24605	40 %	20 %	40 %	0 %	386858735
17	NC_017786	AGGTA	2	10	27300	27309	40 %	20 %	40 %	0 %	386858737
18	NC_017786	GAGAA	2	10	28272	28281	60 %	0 %	40 %	0 %	386858738
19	NC_017786	GGAGA	2	10	28282	28291	40 %	0 %	60 %	0 %	386858738
20	NC_017786	GAGAA	2	10	33114	33123	60 %	0 %	40 %	0 %	386858743
21	NC_017786	AAAGT	2	10	34572	34581	60 %	20 %	20 %	0 %	386858745
22	NC_017786	AGATA	2	10	35969	35978	60 %	20 %	20 %	0 %	386858746

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.