MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 162

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017786	TCTT	2	8	385	392	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017786	TAAA	2	8	461	468	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017786	TAAA	2	8	484	491	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017786	ATCA	2	8	911	918	50 %	25 %	0 %	25 %	386858708
5	NC_017786	ATTC	2	8	1456	1463	25 %	50 %	0 %	25 %	386858708
6	NC_017786	TCCT	2	8	1514	1521	0 %	50 %	0 %	50 %	386858708
7	NC_017786	ATGA	2	8	1636	1643	50 %	25 %	25 %	0 %	386858709
8	NC_017786	ATTA	2	8	1888	1895	50 %	50 %	0 %	0 %	386858710
9	NC_017786	TACT	2	8	2000	2007	25 %	50 %	0 %	25 %	386858710
10	NC_017786	ATCA	2	8	2271	2278	50 %	25 %	0 %	25 %	386858710
11	NC_017786	AATT	2	8	2571	2578	50 %	50 %	0 %	0 %	386858710
12	NC_017786	TTTC	2	8	3026	3033	0 %	75 %	0 %	25 %	386858710
13	NC_017786	ATTA	2	8	3228	3235	50 %	50 %	0 %	0 %	386858711
14	NC_017786	TCTT	2	8	3467	3474	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017786	CTTA	2	8	3911	3918	25 %	50 %	0 %	25 %	386858712
16	NC_017786	TTAT	2	8	4344	4351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017786	ATTA	2	8	4478	4485	50 %	50 %	0 %	0 %	386858714
18	NC_017786	TTAT	2	8	4531	4538	25 %	75 %	0 %	0 %	386858714
19	NC_017786	TCTT	2	8	4718	4725	0 %	75 %	0 %	25 %	386858715
20	NC_017786	TGAA	2	8	4980	4987	50 %	25 %	25 %	0 %	386858716
21	NC_017786	TTTC	2	8	5351	5358	0 %	75 %	0 %	25 %	386858716
22	NC_017786	TATT	3	12	5371	5382	25 %	75 %	0 %	0 %	386858716
23	NC_017786	TTTA	2	8	5526	5533	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017786	TTTA	2	8	5540	5547	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017786	TAAA	2	8	6671	6678	75 %	25 %	0 %	0 %	386858718
26	NC_017786	CTTA	2	8	7013	7020	25 %	50 %	0 %	25 %	386858719
27	NC_017786	AATT	2	8	7261	7268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017786	ATCT	2	8	7346	7353	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017786	TATC	2	8	7387	7394	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017786	ATCT	2	8	7421	7428	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017786	ATCT	2	8	7487	7494	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017786	CTAA	2	8	7947	7954	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017786	TTTA	2	8	8216	8223	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017786	AATA	2	8	8372	8379	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017786	ATAA	2	8	10986	10993	75 %	25 %	0 %	0 %	386858721
36	NC_017786	TAAT	2	8	11039	11046	50 %	50 %	0 %	0 %	386858721
37	NC_017786	AAAG	2	8	11309	11316	75 %	0 %	25 %	0 %	386858722
38	NC_017786	TGAT	2	8	11465	11472	25 %	50 %	25 %	0 %	386858722
39	NC_017786	CTTT	2	8	11507	11514	0 %	75 %	0 %	25 %	386858722
40	NC_017786	ATAC	2	8	11686	11693	50 %	25 %	0 %	25 %	386858722
41	NC_017786	TAAT	2	8	11697	11704	50 %	50 %	0 %	0 %	386858722
42	NC_017786	ATCT	2	8	11791	11798	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017786	TTCC	2	8	12214	12221	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017786	ATTT	2	8	12356	12363	25 %	75 %	0 %	0 %	386858724
45	NC_017786	TTTA	2	8	12445	12452	25 %	75 %	0 %	0 %	386858724
46	NC_017786	GTAA	2	8	12635	12642	50 %	25 %	25 %	0 %	386858724
47	NC_017786	GATG	2	8	13806	13813	25 %	25 %	50 %	0 %	386858725
48	NC_017786	AAGT	2	8	13938	13945	50 %	25 %	25 %	0 %	386858726
49	NC_017786	TGTT	2	8	14228	14235	0 %	75 %	25 %	0 %	386858726
50	NC_017786	CTAA	2	8	14360	14367	50 %	25 %	0 %	25 %	386858726
51	NC_017786	AAGA	2	8	14655	14662	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017786	GATA	2	8	14831	14838	50 %	25 %	25 %	0 %	386858727
53	NC_017786	AGCT	2	8	14890	14897	25 %	25 %	25 %	25 %	386858727
54	NC_017786	AACA	2	8	15062	15069	75 %	0 %	0 %	25 %	386858727
55	NC_017786	TTGC	2	8	15253	15260	0 %	50 %	25 %	25 %	386858727
56	NC_017786	TAAA	2	8	15266	15273	75 %	25 %	0 %	0 %	386858727
57	NC_017786	ATAA	2	8	15742	15749	75 %	25 %	0 %	0 %	386858727
58	NC_017786	GAAG	2	8	15786	15793	50 %	0 %	50 %	0 %	386858727
59	NC_017786	TTGT	2	8	16130	16137	0 %	75 %	25 %	0 %	386858728
60	NC_017786	ATTA	2	8	16339	16346	50 %	50 %	0 %	0 %	386858728
61	NC_017786	ATTT	2	8	16725	16732	25 %	75 %	0 %	0 %	386858728
62	NC_017786	ATGT	2	8	16758	16765	25 %	50 %	25 %	0 %	386858728
63	NC_017786	TTGT	2	8	17362	17369	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017786	AATT	2	8	17472	17479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017786	TTTG	2	8	17518	17525	0 %	75 %	25 %	0 %	386858729
66	NC_017786	TATT	2	8	18064	18071	25 %	75 %	0 %	0 %	386858730
67	NC_017786	TTTG	2	8	18468	18475	0 %	75 %	25 %	0 %	386858730
68	NC_017786	ATCA	2	8	18592	18599	50 %	25 %	0 %	25 %	386858730
69	NC_017786	TAAT	2	8	18821	18828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017786	ATTT	2	8	18996	19003	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017786	TTGT	2	8	20694	20701	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017786	ATTT	2	8	20901	20908	25 %	75 %	0 %	0 %	386858731
73	NC_017786	GATA	2	8	20950	20957	50 %	25 %	25 %	0 %	386858731
74	NC_017786	TTTG	2	8	21373	21380	0 %	75 %	25 %	0 %	386858731
75	NC_017786	ATTA	2	8	21505	21512	50 %	50 %	0 %	0 %	386858731
76	NC_017786	TGAT	2	8	21825	21832	25 %	50 %	25 %	0 %	386858731
77	NC_017786	TTTG	2	8	22171	22178	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017786	GTAA	2	8	22277	22284	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017786	AATT	2	8	22341	22348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017786	ATAA	2	8	22401	22408	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017786	TTAT	2	8	22493	22500	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017786	TAGA	2	8	22610	22617	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017786	AAAG	2	8	22909	22916	75 %	0 %	25 %	0 %	386858732
84	NC_017786	AAGG	2	8	22994	23001	50 %	0 %	50 %	0 %	386858732
85	NC_017786	AAGA	2	8	23128	23135	75 %	0 %	25 %	0 %	386858732
86	NC_017786	AGGA	2	8	23707	23714	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017786	AAGG	2	8	23729	23736	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017786	TAGA	2	8	24124	24131	50 %	25 %	25 %	0 %	386858733
89	NC_017786	GAAG	2	8	24409	24416	50 %	0 %	50 %	0 %	386858734
90	NC_017786	ATAA	2	8	25212	25219	75 %	25 %	0 %	0 %	386858735
91	NC_017786	TGGA	2	8	25258	25265	25 %	25 %	50 %	0 %	386858735
92	NC_017786	ATAA	2	8	25278	25285	75 %	25 %	0 %	0 %	386858735
93	NC_017786	TAAT	2	8	25337	25344	50 %	50 %	0 %	0 %	386858735
94	NC_017786	GGAA	2	8	25509	25516	50 %	0 %	50 %	0 %	386858736
95	NC_017786	TTTA	2	8	25818	25825	25 %	75 %	0 %	0 %	386858736
96	NC_017786	AAAG	2	8	25926	25933	75 %	0 %	25 %	0 %	386858736
97	NC_017786	TAAA	2	8	26378	26385	75 %	25 %	0 %	0 %	386858736
98	NC_017786	ATTT	2	8	26600	26607	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017786	TGAG	2	8	27095	27102	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017786	TAAG	2	8	27329	27336	50 %	25 %	25 %	0 %	386858737
101	NC_017786	AGTA	2	8	27435	27442	50 %	25 %	25 %	0 %	386858737
102	NC_017786	AAGA	2	8	27685	27692	75 %	0 %	25 %	0 %	386858737
103	NC_017786	AAGA	2	8	27784	27791	75 %	0 %	25 %	0 %	386858737
104	NC_017786	ATAA	2	8	27913	27920	75 %	25 %	0 %	0 %	386858737
105	NC_017786	TGGA	2	8	27959	27966	25 %	25 %	50 %	0 %	386858737
106	NC_017786	ATAA	2	8	27979	27986	75 %	25 %	0 %	0 %	386858737
107	NC_017786	TGTT	2	8	28158	28165	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017786	AGGA	2	8	28381	28388	50 %	0 %	50 %	0 %	386858738
109	NC_017786	AGCA	2	8	28559	28566	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017786	TGGA	2	8	28724	28731	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017786	TCAT	2	8	28759	28766	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017786	ATTT	2	8	29815	29822	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017786	TAAA	2	8	30277	30284	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017786	ACTT	2	8	30285	30292	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017786	ATCT	2	8	30312	30319	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017786	AAAT	2	8	30419	30426	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017786	AGAT	2	8	30607	30614	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017786	ATTA	2	8	31001	31008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017786	TAAA	2	8	31108	31115	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017786	GGAT	2	8	31214	31221	25 %	25 %	50 %	0 %	386858741
121	NC_017786	ATAC	2	8	31289	31296	50 %	25 %	0 %	25 %	386858741
122	NC_017786	TAAA	2	8	31375	31382	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017786	GAAT	2	8	31544	31551	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017786	ATTT	2	8	31574	31581	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017786	GAGT	2	8	32745	32752	25 %	25 %	50 %	0 %	386858742
126	NC_017786	AGAA	2	8	33063	33070	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017786	AAAG	2	8	33364	33371	75 %	0 %	25 %	0 %	386858744
128	NC_017786	AAAG	2	8	33625	33632	75 %	0 %	25 %	0 %	386858744
129	NC_017786	AGGA	2	8	33693	33700	50 %	0 %	50 %	0 %	386858744
130	NC_017786	AAAG	2	8	33863	33870	75 %	0 %	25 %	0 %	386858744
131	NC_017786	TGAG	2	8	34420	34427	25 %	25 %	50 %	0 %	386858745
132	NC_017786	AAGG	2	8	35082	35089	50 %	0 %	50 %	0 %	386858745
133	NC_017786	AAAG	2	8	35093	35100	75 %	0 %	25 %	0 %	386858745
134	NC_017786	ATAA	2	8	35280	35287	75 %	25 %	0 %	0 %	386858745
135	NC_017786	TAAT	2	8	35353	35360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017786	AGGA	2	8	35695	35702	50 %	0 %	50 %	0 %	386858746
137	NC_017786	GTAA	2	8	35733	35740	50 %	25 %	25 %	0 %	386858746
138	NC_017786	GAAG	2	8	35900	35907	50 %	0 %	50 %	0 %	386858746
139	NC_017786	GAGT	2	8	35999	36006	25 %	25 %	50 %	0 %	386858746
140	NC_017786	TAAA	2	8	36690	36697	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017786	CATT	2	8	36785	36792	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017786	AGAA	2	8	36893	36900	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017786	TTAA	2	8	37290	37297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017786	ACTG	2	8	37498	37505	25 %	25 %	25 %	25 %	386858749
145	NC_017786	CGTT	2	8	37802	37809	0 %	50 %	25 %	25 %	386858749
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147	NC_017786	TAAA	2	8	38209	38216	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.