MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017786	TCTT	2	8	385	392	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017786	TAAA	2	8	461	468	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017786	TAAA	2	8	484	491	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017786	TCTT	2	8	3467	3474	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017786	TTAT	2	8	4344	4351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017786	TTTA	2	8	5526	5533	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017786	TTTA	2	8	5540	5547	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017786	AATT	2	8	7261	7268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017786	ATCT	2	8	7346	7353	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017786	TATC	2	8	7387	7394	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017786	ATCT	2	8	7421	7428	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017786	ATCT	2	8	7487	7494	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017786	CTAA	2	8	7947	7954	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017786	TTTA	2	8	8216	8223	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017786	AATA	2	8	8372	8379	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017786	ATCT	2	8	11791	11798	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017786	TTCC	2	8	12214	12221	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017786	AAGA	2	8	14655	14662	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017786	TTGT	2	8	17362	17369	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017786	AATT	2	8	17472	17479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017786	TAAT	2	8	18821	18828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017786	ATTT	2	8	18996	19003	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017786	TTGT	2	8	20694	20701	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017786	TTTG	2	8	22171	22178	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017786	GTAA	2	8	22277	22284	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017786	AATT	2	8	22341	22348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017786	ATAA	2	8	22401	22408	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017786	TTAT	2	8	22493	22500	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017786	TAGA	2	8	22610	22617	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017786	AGGA	2	8	23707	23714	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017786	AAGG	2	8	23729	23736	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017786	ATTT	2	8	26600	26607	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017786	TGAG	2	8	27095	27102	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017786	TGTT	2	8	28158	28165	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017786	AGCA	2	8	28559	28566	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017786	TGGA	2	8	28724	28731	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017786	TCAT	2	8	28759	28766	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017786	ATTT	2	8	29815	29822	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017786	TAAA	2	8	30277	30284	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017786	ACTT	2	8	30285	30292	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017786	ATCT	2	8	30312	30319	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017786	AAAT	2	8	30419	30426	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017786	AGAT	2	8	30607	30614	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017786	ATTA	2	8	31001	31008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017786	TAAA	2	8	31108	31115	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017786	TAAA	2	8	31375	31382	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017786	GAAT	2	8	31544	31551	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017786	ATTT	2	8	31574	31581	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017786	AGAA	2	8	33063	33070	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017786	TAAT	2	8	35353	35360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017786	TAAA	2	8	36690	36697	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017786	CATT	2	8	36785	36792	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017786	AGAA	2	8	36893	36900	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017786	TTAA	2	8	37290	37297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017786	TAAA	2	8	38209	38216	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017786	ATTC	2	8	38520	38527	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017786	CTTT	2	8	38580	38587	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017786	TGAG	2	8	38796	38803	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017786	TTAG	2	8	40137	40144	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017786	GAAA	2	8	40279	40286	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.