MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017786	ATCA	2	8	911	918	50 %	25 %	0 %	25 %	386858708
2	NC_017786	ATTC	2	8	1456	1463	25 %	50 %	0 %	25 %	386858708
3	NC_017786	TCCT	2	8	1514	1521	0 %	50 %	0 %	50 %	386858708
4	NC_017786	ATGA	2	8	1636	1643	50 %	25 %	25 %	0 %	386858709
5	NC_017786	ATTA	2	8	1888	1895	50 %	50 %	0 %	0 %	386858710
6	NC_017786	TACT	2	8	2000	2007	25 %	50 %	0 %	25 %	386858710
7	NC_017786	ATCA	2	8	2271	2278	50 %	25 %	0 %	25 %	386858710
8	NC_017786	AATT	2	8	2571	2578	50 %	50 %	0 %	0 %	386858710
9	NC_017786	TTTC	2	8	3026	3033	0 %	75 %	0 %	25 %	386858710
10	NC_017786	ATTA	2	8	3228	3235	50 %	50 %	0 %	0 %	386858711
11	NC_017786	CTTA	2	8	3911	3918	25 %	50 %	0 %	25 %	386858712
12	NC_017786	ATTA	2	8	4478	4485	50 %	50 %	0 %	0 %	386858714
13	NC_017786	TTAT	2	8	4531	4538	25 %	75 %	0 %	0 %	386858714
14	NC_017786	TCTT	2	8	4718	4725	0 %	75 %	0 %	25 %	386858715
15	NC_017786	TGAA	2	8	4980	4987	50 %	25 %	25 %	0 %	386858716
16	NC_017786	TTTC	2	8	5351	5358	0 %	75 %	0 %	25 %	386858716
17	NC_017786	TATT	3	12	5371	5382	25 %	75 %	0 %	0 %	386858716
18	NC_017786	TAAA	2	8	6671	6678	75 %	25 %	0 %	0 %	386858718
19	NC_017786	CTTA	2	8	7013	7020	25 %	50 %	0 %	25 %	386858719
20	NC_017786	ATAA	2	8	10986	10993	75 %	25 %	0 %	0 %	386858721
21	NC_017786	TAAT	2	8	11039	11046	50 %	50 %	0 %	0 %	386858721
22	NC_017786	AAAG	2	8	11309	11316	75 %	0 %	25 %	0 %	386858722
23	NC_017786	TGAT	2	8	11465	11472	25 %	50 %	25 %	0 %	386858722
24	NC_017786	CTTT	2	8	11507	11514	0 %	75 %	0 %	25 %	386858722
25	NC_017786	ATAC	2	8	11686	11693	50 %	25 %	0 %	25 %	386858722
26	NC_017786	TAAT	2	8	11697	11704	50 %	50 %	0 %	0 %	386858722
27	NC_017786	ATTT	2	8	12356	12363	25 %	75 %	0 %	0 %	386858724
28	NC_017786	TTTA	2	8	12445	12452	25 %	75 %	0 %	0 %	386858724
29	NC_017786	GTAA	2	8	12635	12642	50 %	25 %	25 %	0 %	386858724
30	NC_017786	GATG	2	8	13806	13813	25 %	25 %	50 %	0 %	386858725
31	NC_017786	AAGT	2	8	13938	13945	50 %	25 %	25 %	0 %	386858726
32	NC_017786	TGTT	2	8	14228	14235	0 %	75 %	25 %	0 %	386858726
33	NC_017786	CTAA	2	8	14360	14367	50 %	25 %	0 %	25 %	386858726
34	NC_017786	GATA	2	8	14831	14838	50 %	25 %	25 %	0 %	386858727
35	NC_017786	AGCT	2	8	14890	14897	25 %	25 %	25 %	25 %	386858727
36	NC_017786	AACA	2	8	15062	15069	75 %	0 %	0 %	25 %	386858727
37	NC_017786	TTGC	2	8	15253	15260	0 %	50 %	25 %	25 %	386858727
38	NC_017786	TAAA	2	8	15266	15273	75 %	25 %	0 %	0 %	386858727
39	NC_017786	ATAA	2	8	15742	15749	75 %	25 %	0 %	0 %	386858727
40	NC_017786	GAAG	2	8	15786	15793	50 %	0 %	50 %	0 %	386858727
41	NC_017786	TTGT	2	8	16130	16137	0 %	75 %	25 %	0 %	386858728
42	NC_017786	ATTA	2	8	16339	16346	50 %	50 %	0 %	0 %	386858728
43	NC_017786	ATTT	2	8	16725	16732	25 %	75 %	0 %	0 %	386858728
44	NC_017786	ATGT	2	8	16758	16765	25 %	50 %	25 %	0 %	386858728
45	NC_017786	TTTG	2	8	17518	17525	0 %	75 %	25 %	0 %	386858729
46	NC_017786	TATT	2	8	18064	18071	25 %	75 %	0 %	0 %	386858730
47	NC_017786	TTTG	2	8	18468	18475	0 %	75 %	25 %	0 %	386858730
48	NC_017786	ATCA	2	8	18592	18599	50 %	25 %	0 %	25 %	386858730
49	NC_017786	ATTT	2	8	20901	20908	25 %	75 %	0 %	0 %	386858731
50	NC_017786	GATA	2	8	20950	20957	50 %	25 %	25 %	0 %	386858731
51	NC_017786	TTTG	2	8	21373	21380	0 %	75 %	25 %	0 %	386858731
52	NC_017786	ATTA	2	8	21505	21512	50 %	50 %	0 %	0 %	386858731
53	NC_017786	TGAT	2	8	21825	21832	25 %	50 %	25 %	0 %	386858731
54	NC_017786	AAAG	2	8	22909	22916	75 %	0 %	25 %	0 %	386858732
55	NC_017786	AAGG	2	8	22994	23001	50 %	0 %	50 %	0 %	386858732
56	NC_017786	AAGA	2	8	23128	23135	75 %	0 %	25 %	0 %	386858732
57	NC_017786	TAGA	2	8	24124	24131	50 %	25 %	25 %	0 %	386858733
58	NC_017786	GAAG	2	8	24409	24416	50 %	0 %	50 %	0 %	386858734
59	NC_017786	ATAA	2	8	25212	25219	75 %	25 %	0 %	0 %	386858735
60	NC_017786	TGGA	2	8	25258	25265	25 %	25 %	50 %	0 %	386858735
61	NC_017786	ATAA	2	8	25278	25285	75 %	25 %	0 %	0 %	386858735
62	NC_017786	TAAT	2	8	25337	25344	50 %	50 %	0 %	0 %	386858735
63	NC_017786	GGAA	2	8	25509	25516	50 %	0 %	50 %	0 %	386858736
64	NC_017786	TTTA	2	8	25818	25825	25 %	75 %	0 %	0 %	386858736
65	NC_017786	AAAG	2	8	25926	25933	75 %	0 %	25 %	0 %	386858736
66	NC_017786	TAAA	2	8	26378	26385	75 %	25 %	0 %	0 %	386858736
67	NC_017786	TAAG	2	8	27329	27336	50 %	25 %	25 %	0 %	386858737
68	NC_017786	AGTA	2	8	27435	27442	50 %	25 %	25 %	0 %	386858737
69	NC_017786	AAGA	2	8	27685	27692	75 %	0 %	25 %	0 %	386858737
70	NC_017786	AAGA	2	8	27784	27791	75 %	0 %	25 %	0 %	386858737
71	NC_017786	ATAA	2	8	27913	27920	75 %	25 %	0 %	0 %	386858737
72	NC_017786	TGGA	2	8	27959	27966	25 %	25 %	50 %	0 %	386858737
73	NC_017786	ATAA	2	8	27979	27986	75 %	25 %	0 %	0 %	386858737
74	NC_017786	AGGA	2	8	28381	28388	50 %	0 %	50 %	0 %	386858738
75	NC_017786	GGAT	2	8	31214	31221	25 %	25 %	50 %	0 %	386858741
76	NC_017786	ATAC	2	8	31289	31296	50 %	25 %	0 %	25 %	386858741
77	NC_017786	GAGT	2	8	32745	32752	25 %	25 %	50 %	0 %	386858742
78	NC_017786	AAAG	2	8	33364	33371	75 %	0 %	25 %	0 %	386858744
79	NC_017786	AAAG	2	8	33625	33632	75 %	0 %	25 %	0 %	386858744
80	NC_017786	AGGA	2	8	33693	33700	50 %	0 %	50 %	0 %	386858744
81	NC_017786	AAAG	2	8	33863	33870	75 %	0 %	25 %	0 %	386858744
82	NC_017786	TGAG	2	8	34420	34427	25 %	25 %	50 %	0 %	386858745
83	NC_017786	AAGG	2	8	35082	35089	50 %	0 %	50 %	0 %	386858745
84	NC_017786	AAAG	2	8	35093	35100	75 %	0 %	25 %	0 %	386858745
85	NC_017786	ATAA	2	8	35280	35287	75 %	25 %	0 %	0 %	386858745
86	NC_017786	AGGA	2	8	35695	35702	50 %	0 %	50 %	0 %	386858746
87	NC_017786	GTAA	2	8	35733	35740	50 %	25 %	25 %	0 %	386858746
88	NC_017786	GAAG	2	8	35900	35907	50 %	0 %	50 %	0 %	386858746
89	NC_017786	GAGT	2	8	35999	36006	25 %	25 %	50 %	0 %	386858746
90	NC_017786	ACTG	2	8	37498	37505	25 %	25 %	25 %	25 %	386858749
91	NC_017786	CGTT	2	8	37802	37809	0 %	50 %	25 %	25 %	386858749
92	NC_017786	TAAA	2	8	37896	37903	75 %	25 %	0 %	0 %	386858749
93	NC_017786	AGAT	2	8	39413	39420	50 %	25 %	25 %	0 %	386858750
94	NC_017786	ATAA	2	8	40003	40010	75 %	25 %	0 %	0 %	386858750
95	NC_017786	TGGA	2	8	40049	40056	25 %	25 %	50 %	0 %	386858750
96	NC_017786	ATAA	2	8	40069	40076	75 %	25 %	0 %	0 %	386858750
97	NC_017786	TAAT	2	8	40122	40129	50 %	50 %	0 %	0 %	386858750
98	NC_017786	AGGG	2	8	40342	40349	25 %	0 %	75 %	0 %	386858751
99	NC_017786	GAAA	2	8	40359	40366	75 %	0 %	25 %	0 %	386858751
100	NC_017786	CTTT	2	8	40634	40641	0 %	75 %	0 %	25 %	386858753
101	NC_017786	CAAC	2	8	40687	40694	50 %	0 %	0 %	50 %	386858753
102	NC_017786	TAAA	2	8	40751	40758	75 %	25 %	0 %	0 %	386858753

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.