MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 664

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017786	CTT	2	6	47	52	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858707
2	NC_017786	TCT	2	6	56	61	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858707
3	NC_017786	CCT	2	6	65	70	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858707
4	NC_017786	AAT	2	6	118	123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858707
5	NC_017786	AAC	2	6	329	334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017786	ATT	2	6	367	372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017786	AAC	2	6	473	478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017786	TTA	2	6	522	527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017786	AGT	2	6	563	568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858708
10	NC_017786	TAG	2	6	577	582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858708
11	NC_017786	ACT	2	6	593	598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858708
12	NC_017786	ATT	2	6	666	671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858708
13	NC_017786	CTG	2	6	709	714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858708
14	NC_017786	AGC	3	9	740	748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858708
15	NC_017786	CTG	3	9	787	795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858708
16	NC_017786	TTA	2	6	825	830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858708
17	NC_017786	TAG	2	6	841	846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858708
18	NC_017786	ATT	3	9	863	871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858708
19	NC_017786	CAA	2	6	886	891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858708
20	NC_017786	AGC	2	6	962	967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858708
21	NC_017786	GCA	2	6	981	986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858708
22	NC_017786	CAG	2	6	1000	1005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858708
23	NC_017786	CAG	2	6	1024	1029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858708
24	NC_017786	CAC	2	6	1036	1041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858708
25	NC_017786	CCT	2	6	1129	1134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858708
26	NC_017786	CAG	2	6	1135	1140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858708
27	NC_017786	GCA	3	9	1146	1154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858708
28	NC_017786	CAA	2	6	1183	1188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858708
29	NC_017786	TTA	2	6	1213	1218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858708
30	NC_017786	AAT	2	6	1226	1231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858708
31	NC_017786	TAA	2	6	1246	1251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858708
32	NC_017786	AGA	2	6	1286	1291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858708
33	NC_017786	ATC	2	6	1382	1387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858708
34	NC_017786	TCC	2	6	1415	1420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858708
35	NC_017786	AAG	2	6	1435	1440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858708
36	NC_017786	AAT	2	6	1472	1477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858708
37	NC_017786	CCA	2	6	1527	1532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858708
38	NC_017786	TCA	2	6	1543	1548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858708
39	NC_017786	CCA	2	6	1561	1566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858708
40	NC_017786	TCA	4	12	1567	1578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858708
41	NC_017786	TAA	2	6	1595	1600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858709
42	NC_017786	ATA	2	6	1648	1653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858709
43	NC_017786	TCT	2	6	1683	1688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017786	CAA	2	6	1833	1838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017786	ACT	2	6	1944	1949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858710
46	NC_017786	CTT	2	6	1976	1981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858710
47	NC_017786	ATT	2	6	2017	2022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858710
48	NC_017786	GCT	3	9	2062	2070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858710
49	NC_017786	CTG	2	6	2141	2146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858710
50	NC_017786	ACC	2	6	2196	2201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858710
51	NC_017786	TAG	2	6	2234	2239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858710
52	NC_017786	AGT	2	6	2250	2255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858710
53	NC_017786	CTT	2	6	2303	2308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858710
54	NC_017786	AGC	2	6	2322	2327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858710
55	NC_017786	TAA	2	6	2355	2360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858710
56	NC_017786	CAC	2	6	2387	2392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858710
57	NC_017786	AAT	2	6	2439	2444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858710
58	NC_017786	CAC	2	6	2498	2503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858710
59	NC_017786	CAT	2	6	2588	2593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858710
60	NC_017786	TTC	2	6	2686	2691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858710
61	NC_017786	CCA	2	6	2896	2901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858710
62	NC_017786	CAT	2	6	2919	2924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858710
63	NC_017786	CAC	3	9	2925	2933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858710
64	NC_017786	TAT	2	6	2949	2954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858710
65	NC_017786	TCT	2	6	2955	2960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858710
66	NC_017786	CCT	2	6	3038	3043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_017786	ATT	2	6	3213	3218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017786	TTA	2	6	3281	3286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858711
69	NC_017786	CCT	2	6	3419	3424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858711
70	NC_017786	CCT	2	6	3449	3454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_017786	CTT	2	6	3496	3501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017786	ATC	2	6	3502	3507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017786	CTG	2	6	3531	3536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017786	CTT	2	6	3658	3663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858712
75	NC_017786	AAC	2	6	3690	3695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858712
76	NC_017786	CTG	2	6	3721	3726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858712
77	NC_017786	TAG	2	6	3730	3735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858712
78	NC_017786	CAA	2	6	3772	3777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858712
79	NC_017786	AGC	2	6	3821	3826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858712
80	NC_017786	CAT	2	6	3868	3873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858712
81	NC_017786	TGC	2	6	3884	3889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858712
82	NC_017786	TTC	2	6	4053	4058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858712
83	NC_017786	ATC	3	9	4201	4209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858713
84	NC_017786	ATT	2	6	4213	4218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858713
85	NC_017786	CTT	2	6	4276	4281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017786	CCT	2	6	4306	4311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_017786	AAT	2	6	4436	4441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017786	TTC	2	6	4645	4650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858715
89	NC_017786	CCT	2	6	4670	4675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858715
90	NC_017786	GCT	2	6	4703	4708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858715
91	NC_017786	AGC	2	6	4816	4821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858715
92	NC_017786	AAT	2	6	4940	4945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017786	TTG	2	6	4960	4965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017786	CCA	2	6	4971	4976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_017786	CAA	2	6	5023	5028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858716
96	NC_017786	GCA	2	6	5073	5078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858716
97	NC_017786	AAC	2	6	5096	5101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858716
98	NC_017786	CCT	2	6	5140	5145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858716
99	NC_017786	CTT	2	6	5152	5157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858716
100	NC_017786	CTC	2	6	5218	5223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858716
101	NC_017786	CAC	3	9	5239	5247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858716
102	NC_017786	TCT	2	6	5283	5288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858716
103	NC_017786	CTT	2	6	5297	5302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858716
104	NC_017786	TCT	2	6	5313	5318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858716
105	NC_017786	TAA	2	6	5393	5398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858716
106	NC_017786	ACA	2	6	5414	5419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858716
107	NC_017786	ATA	2	6	5429	5434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858716
108	NC_017786	TAC	2	6	5471	5476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017786	TAT	2	6	5534	5539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017786	ACC	2	6	5582	5587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858717
111	NC_017786	CTT	2	6	5641	5646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858717
112	NC_017786	TCA	2	6	5664	5669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858717
113	NC_017786	CTT	2	6	5676	5681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858717
114	NC_017786	CAG	2	6	5755	5760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858717
115	NC_017786	AGC	2	6	5762	5767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858717
116	NC_017786	AGC	2	6	5861	5866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858717
117	NC_017786	TGC	2	6	5948	5953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858717
118	NC_017786	GCT	2	6	5958	5963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858717
119	NC_017786	AGC	2	6	5987	5992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858717
120	NC_017786	AAT	2	6	6000	6005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858717
121	NC_017786	ATC	2	6	6053	6058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858717
122	NC_017786	CTT	2	6	6091	6096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858717
123	NC_017786	ACT	2	6	6105	6110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858717
124	NC_017786	TAT	2	6	6113	6118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858717
125	NC_017786	CAG	2	6	6154	6159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858717
126	NC_017786	GCT	2	6	6177	6182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858717
127	NC_017786	CCA	2	6	6237	6242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858717
128	NC_017786	CAA	2	6	6331	6336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858717
129	NC_017786	TTA	2	6	6339	6344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858717
130	NC_017786	CCA	2	6	6442	6447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858717
131	NC_017786	TTC	2	6	6516	6521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858717
132	NC_017786	CAT	2	6	6566	6571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017786	ATT	2	6	6576	6581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017786	AAC	2	6	6770	6775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858719
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