MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 189

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017786	T	7	7	78	84	0 %	100 %	0 %	0 %	386858707
2	NC_017786	T	6	6	226	231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017786	T	6	6	371	376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017786	A	6	6	393	398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017786	T	6	6	634	639	0 %	100 %	0 %	0 %	386858708
6	NC_017786	T	6	6	1732	1737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017786	A	6	6	2807	2812	100 %	0 %	0 %	0 %	386858710
8	NC_017786	A	6	6	2851	2856	100 %	0 %	0 %	0 %	386858710
9	NC_017786	T	6	6	3012	3017	0 %	100 %	0 %	0 %	386858710
10	NC_017786	T	7	7	3046	3052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017786	A	7	7	3104	3110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017786	A	7	7	3145	3151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017786	A	6	6	3189	3194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017786	T	6	6	4314	4319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017786	A	6	6	4366	4371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017786	A	7	7	4392	4398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017786	T	6	6	4747	4752	0 %	100 %	0 %	0 %	386858715
18	NC_017786	T	8	8	5384	5391	0 %	100 %	0 %	0 %	386858716
19	NC_017786	A	8	8	5403	5410	100 %	0 %	0 %	0 %	386858716
20	NC_017786	A	6	6	5438	5443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017786	A	6	6	5450	5455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017786	T	6	6	5966	5971	0 %	100 %	0 %	0 %	386858717
23	NC_017786	T	7	7	6272	6278	0 %	100 %	0 %	0 %	386858717
24	NC_017786	T	6	6	6619	6624	0 %	100 %	0 %	0 %	386858718
25	NC_017786	A	6	6	6676	6681	100 %	0 %	0 %	0 %	386858718
26	NC_017786	T	6	6	6717	6722	0 %	100 %	0 %	0 %	386858718
27	NC_017786	A	6	6	7086	7091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017786	N	161	161	7500	7660	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017786	T	6	6	7822	7827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017786	T	6	6	7885	7890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017786	A	6	6	8050	8055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017786	A	6	6	8190	8195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017786	A	6	6	8210	8215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017786	A	7	7	8246	8252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017786	A	6	6	8315	8320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017786	A	6	6	8382	8387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017786	A	8	8	8647	8654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017786	T	6	6	8757	8762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017786	A	7	7	8784	8790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017786	A	8	8	8863	8870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017786	A	6	6	8890	8895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017786	N	1040	1040	8919	9958	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017786	A	7	7	10563	10569	100 %	0 %	0 %	0 %	386858720
44	NC_017786	A	6	6	10772	10777	100 %	0 %	0 %	0 %	386858720
45	NC_017786	T	8	8	11124	11131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017786	A	6	6	11283	11288	100 %	0 %	0 %	0 %	386858722
47	NC_017786	T	7	7	11654	11660	0 %	100 %	0 %	0 %	386858722
48	NC_017786	T	8	8	11748	11755	0 %	100 %	0 %	0 %	386858722
49	NC_017786	T	6	6	12011	12016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017786	T	8	8	12046	12053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017786	T	6	6	12381	12386	0 %	100 %	0 %	0 %	386858724
52	NC_017786	T	6	6	12388	12393	0 %	100 %	0 %	0 %	386858724
53	NC_017786	T	6	6	12581	12586	0 %	100 %	0 %	0 %	386858724
54	NC_017786	T	7	7	12612	12618	0 %	100 %	0 %	0 %	386858724
55	NC_017786	T	7	7	12811	12817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017786	T	6	6	12849	12854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017786	N	351	351	12879	13229	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017786	T	7	7	13254	13260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017786	T	6	6	13349	13354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017786	A	6	6	13689	13694	100 %	0 %	0 %	0 %	386858725
61	NC_017786	T	6	6	14742	14747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017786	T	6	6	14764	14769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017786	T	6	6	14798	14803	0 %	100 %	0 %	0 %	386858727
64	NC_017786	A	6	6	14845	14850	100 %	0 %	0 %	0 %	386858727
65	NC_017786	T	6	6	14991	14996	0 %	100 %	0 %	0 %	386858727
66	NC_017786	A	6	6	15000	15005	100 %	0 %	0 %	0 %	386858727
67	NC_017786	T	7	7	15157	15163	0 %	100 %	0 %	0 %	386858727
68	NC_017786	A	9	9	15281	15289	100 %	0 %	0 %	0 %	386858727
69	NC_017786	T	8	8	15354	15361	0 %	100 %	0 %	0 %	386858727
70	NC_017786	A	8	8	15425	15432	100 %	0 %	0 %	0 %	386858727
71	NC_017786	A	6	6	15469	15474	100 %	0 %	0 %	0 %	386858727
72	NC_017786	A	7	7	15707	15713	100 %	0 %	0 %	0 %	386858727
73	NC_017786	A	7	7	15729	15735	100 %	0 %	0 %	0 %	386858727
74	NC_017786	A	8	8	15797	15804	100 %	0 %	0 %	0 %	386858727
75	NC_017786	T	8	8	15992	15999	0 %	100 %	0 %	0 %	386858728
76	NC_017786	A	7	7	16138	16144	100 %	0 %	0 %	0 %	386858728
77	NC_017786	T	9	9	16488	16496	0 %	100 %	0 %	0 %	386858728
78	NC_017786	T	8	8	16672	16679	0 %	100 %	0 %	0 %	386858728
79	NC_017786	T	6	6	16691	16696	0 %	100 %	0 %	0 %	386858728
80	NC_017786	T	6	6	16730	16735	0 %	100 %	0 %	0 %	386858728
81	NC_017786	T	7	7	16863	16869	0 %	100 %	0 %	0 %	386858728
82	NC_017786	T	6	6	16991	16996	0 %	100 %	0 %	0 %	386858728
83	NC_017786	A	6	6	17146	17151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017786	A	6	6	17173	17178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017786	T	7	7	17200	17206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017786	A	6	6	17289	17294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017786	T	6	6	17500	17505	0 %	100 %	0 %	0 %	386858729
88	NC_017786	T	6	6	17542	17547	0 %	100 %	0 %	0 %	386858729
89	NC_017786	A	8	8	17553	17560	100 %	0 %	0 %	0 %	386858729
90	NC_017786	T	8	8	17593	17600	0 %	100 %	0 %	0 %	386858729
91	NC_017786	A	6	6	18197	18202	100 %	0 %	0 %	0 %	386858730
92	NC_017786	T	8	8	18248	18255	0 %	100 %	0 %	0 %	386858730
93	NC_017786	A	6	6	18307	18312	100 %	0 %	0 %	0 %	386858730
94	NC_017786	A	6	6	18511	18516	100 %	0 %	0 %	0 %	386858730
95	NC_017786	T	7	7	18799	18805	0 %	100 %	0 %	0 %	386858730
96	NC_017786	T	6	6	19018	19023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017786	N	1460	1460	19207	20666	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017786	T	6	6	20790	20795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017786	T	9	9	20797	20805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017786	A	6	6	20870	20875	100 %	0 %	0 %	0 %	386858731
101	NC_017786	T	6	6	21330	21335	0 %	100 %	0 %	0 %	386858731
102	NC_017786	A	8	8	21463	21470	100 %	0 %	0 %	0 %	386858731
103	NC_017786	A	6	6	22139	22144	100 %	0 %	0 %	0 %	386858731
104	NC_017786	T	6	6	22347	22352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017786	T	7	7	22450	22456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017786	A	6	6	22721	22726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017786	A	6	6	22945	22950	100 %	0 %	0 %	0 %	386858732
108	NC_017786	N	425	425	23274	23698	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017786	A	6	6	24087	24092	100 %	0 %	0 %	0 %	386858733
110	NC_017786	A	6	6	24114	24119	100 %	0 %	0 %	0 %	386858733
111	NC_017786	A	6	6	24740	24745	100 %	0 %	0 %	0 %	386858735
112	NC_017786	A	7	7	25082	25088	100 %	0 %	0 %	0 %	386858735
113	NC_017786	T	7	7	25431	25437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017786	T	6	6	26561	26566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017786	T	6	6	26609	26614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017786	A	6	6	26634	26639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017786	N	432	432	26640	27071	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017786	A	6	6	27352	27357	100 %	0 %	0 %	0 %	386858737
119	NC_017786	A	6	6	27831	27836	100 %	0 %	0 %	0 %	386858737
120	NC_017786	T	7	7	28164	28170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017786	A	8	8	28200	28207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017786	T	6	6	28460	28465	0 %	100 %	0 %	0 %	386858738
123	NC_017786	G	6	6	28671	28676	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017786	T	7	7	28745	28751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017786	A	6	6	28822	28827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017786	A	6	6	29004	29009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017786	T	7	7	29061	29067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017786	A	6	6	29075	29080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017786	A	6	6	29176	29181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017786	A	6	6	29244	29249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017786	A	6	6	29330	29335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017786	A	6	6	29397	29402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017786	A	7	7	29631	29637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017786	A	6	6	29693	29698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017786	T	6	6	29793	29798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017786	A	6	6	29834	29839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017786	T	6	6	29992	29997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017786	T	6	6	30078	30083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017786	T	7	7	30253	30259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017786	A	7	7	30342	30348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017786	T	6	6	30473	30478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017786	A	6	6	30588	30593	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017786	A	6	6	30645	30650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017786	A	6	6	30881	30886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017786	A	7	7	30945	30951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017786	T	6	6	30994	30999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017786	A	6	6	31147	31152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017786	A	7	7	31327	31333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017786	A	7	7	31384	31390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017786	A	7	7	31397	31403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017786	T	7	7	31460	31466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017786	N	820	820	31586	32405	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017786	G	7	7	32504	32510	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017786	A	6	6	32724	32729	100 %	0 %	0 %	0 %	386858742
155	NC_017786	T	7	7	32954	32960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017786	T	7	7	33019	33025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_017786	A	6	6	33069	33074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_017786	A	7	7	33445	33451	100 %	0 %	0 %	0 %	386858744
159	NC_017786	A	6	6	34167	34172	100 %	0 %	0 %	0 %	386858744
160	NC_017786	T	8	8	34289	34296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017786	A	6	6	34337	34342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017786	T	7	7	35385	35391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_017786	T	7	7	35428	35434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_017786	T	7	7	35468	35474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_017786	A	6	6	35520	35525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_017786	A	7	7	35555	35561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_017786	A	7	7	35566	35572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_017786	A	8	8	36154	36161	100 %	0 %	0 %	0 %	386858746
169	NC_017786	A	7	7	36246	36252	100 %	0 %	0 %	0 %	386858746
170	NC_017786	A	7	7	36377	36383	100 %	0 %	0 %	0 %	386858746
171	NC_017786	A	6	6	36570	36575	100 %	0 %	0 %	0 %	386858746
172	NC_017786	A	8	8	36682	36689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_017786	A	6	6	36703	36708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_017786	T	7	7	36736	36742	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_017786	T	6	6	36767	36772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_017786	T	7	7	36808	36814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_017786	T	6	6	36871	36876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_017786	A	6	6	37283	37288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_017786	A	7	7	37861	37867	100 %	0 %	0 %	0 %	386858749
180	NC_017786	T	6	6	38108	38113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_017786	A	6	6	38455	38460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_017786	T	6	6	38567	38572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_017786	A	6	6	38602	38607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_017786	N	319	319	38894	39212	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_017786	T	8	8	40210	40217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_017786	T	7	7	40249	40255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_017786	A	7	7	40290	40296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_017786	G	6	6	40451	40456	0 %	0 %	100 %	0 %	386858751
189	NC_017786	T	7	7	40833	40839	0 %	100 %	0 %	0 %	386858753

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.