MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017783	TAT	2	6	613	618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858679
2	NC_017783	TGT	3	9	851	859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858679
3	NC_017783	AAC	2	6	860	865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858679
4	NC_017783	CTA	2	6	868	873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858679
5	NC_017783	TAA	2	6	937	942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858679
6	NC_017783	TTA	2	6	1078	1083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858679
7	NC_017783	TGT	2	6	1090	1095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858679
8	NC_017783	ATC	2	6	1537	1542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858680
9	NC_017783	TAA	2	6	1750	1755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858680
10	NC_017783	CTT	2	6	1761	1766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858680
11	NC_017783	CAA	2	6	1767	1772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858680
12	NC_017783	AAT	2	6	1803	1808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858680
13	NC_017783	TTC	2	6	2199	2204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858681
14	NC_017783	CAT	2	6	2231	2236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858681
15	NC_017783	TAT	2	6	2330	2335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858681
16	NC_017783	TAA	2	6	2403	2408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858681
17	NC_017783	CTG	2	6	2435	2440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858681
18	NC_017783	TAA	2	6	2465	2470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858681
19	NC_017783	ATA	2	6	2807	2812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858681
20	NC_017783	ACC	2	6	2850	2855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858681
21	NC_017783	TTA	2	6	2873	2878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858681
22	NC_017783	TTA	2	6	2973	2978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858682
23	NC_017783	TTA	2	6	3063	3068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858682
24	NC_017783	CTT	2	6	3196	3201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858682
25	NC_017783	AAT	2	6	3243	3248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858682
26	NC_017783	TTA	2	6	3285	3290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858682
27	NC_017783	CAT	2	6	3311	3316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858682
28	NC_017783	TAA	2	6	3388	3393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858682
29	NC_017783	ATT	2	6	3407	3412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858682
30	NC_017783	CAA	2	6	3478	3483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858683
31	NC_017783	CTC	2	6	3494	3499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858683
32	NC_017783	TAA	2	6	3543	3548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858683
33	NC_017783	ATT	2	6	3554	3559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858683
34	NC_017783	AAT	2	6	3598	3603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858683
35	NC_017783	TTC	2	6	3642	3647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858683
36	NC_017783	TGA	2	6	3690	3695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858683
37	NC_017783	TCT	2	6	3696	3701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858683
38	NC_017783	CCT	2	6	3859	3864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858683
39	NC_017783	TCT	2	6	3963	3968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858683
40	NC_017783	TTC	2	6	3969	3974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858683
41	NC_017783	TGT	2	6	4007	4012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858683
42	NC_017783	ATG	3	9	5713	5721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858684
43	NC_017783	TAA	2	6	5742	5747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858684
44	NC_017783	TAG	2	6	5793	5798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858684
45	NC_017783	TAT	2	6	5894	5899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858684
46	NC_017783	GTT	3	9	5950	5958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858684
47	NC_017783	TAT	2	6	5980	5985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858684
48	NC_017783	TAA	2	6	6006	6011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858684
49	NC_017783	ATT	2	6	6021	6026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858684
50	NC_017783	GTT	2	6	8651	8656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858685
51	NC_017783	GTT	2	6	8680	8685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858685
52	NC_017783	AAT	2	6	8726	8731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858685
53	NC_017783	TAA	2	6	9523	9528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858686
54	NC_017783	ATA	2	6	9622	9627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858686
55	NC_017783	CAA	2	6	9652	9657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858686
56	NC_017783	TTA	2	6	9693	9698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858686
57	NC_017783	TTA	2	6	9726	9731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858686
58	NC_017783	TAG	3	9	9737	9745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858686
59	NC_017783	TAT	2	6	9811	9816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858686
60	NC_017783	TTA	2	6	9868	9873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858686
61	NC_017783	TAC	2	6	10054	10059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858687
62	NC_017783	AAT	2	6	10178	10183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858687
63	NC_017783	ATT	2	6	10424	10429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858687
64	NC_017783	TTA	2	6	10448	10453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858687

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.