MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017782	GAAA	2	8	1109	1116	75 %	0 %	25 %	0 %	386858669
2	NC_017782	CAGG	2	8	1397	1404	25 %	0 %	50 %	25 %	386858670
3	NC_017782	TTTA	2	8	1460	1467	25 %	75 %	0 %	0 %	386858670
4	NC_017782	TAGC	2	8	1798	1805	25 %	25 %	25 %	25 %	386858670
5	NC_017782	GATG	2	8	2101	2108	25 %	25 %	50 %	0 %	386858671
6	NC_017782	TAAT	2	8	2459	2466	50 %	50 %	0 %	0 %	386858671
7	NC_017782	AGAA	2	8	2773	2780	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017782	TAAA	2	8	3072	3079	75 %	25 %	0 %	0 %	386858673
9	NC_017782	CATT	2	8	3263	3270	25 %	50 %	0 %	25 %	386858673
10	NC_017782	CAAT	2	8	3530	3537	50 %	25 %	0 %	25 %	386858673
11	NC_017782	TCTT	2	8	4546	4553	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017782	TCTT	2	8	4557	4564	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017782	ATGA	2	8	4671	4678	50 %	25 %	25 %	0 %	386858674
14	NC_017782	CAAT	2	8	4827	4834	50 %	25 %	0 %	25 %	386858674
15	NC_017782	TTCT	2	8	4931	4938	0 %	75 %	0 %	25 %	386858674
16	NC_017782	AAAT	2	8	4966	4973	75 %	25 %	0 %	0 %	386858674
17	NC_017782	ATAA	2	8	7026	7033	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017782	AAGG	2	8	7307	7314	50 %	0 %	50 %	0 %	386858675
19	NC_017782	AGGT	2	8	7545	7552	25 %	25 %	50 %	0 %	386858676
20	NC_017782	AATT	2	8	7594	7601	50 %	50 %	0 %	0 %	386858676
21	NC_017782	TAAG	2	8	7647	7654	50 %	25 %	25 %	0 %	386858676
22	NC_017782	AAAG	2	8	7729	7736	75 %	0 %	25 %	0 %	386858676
23	NC_017782	GAAA	2	8	7750	7757	75 %	0 %	25 %	0 %	386858676
24	NC_017782	AAAT	2	8	8187	8194	75 %	25 %	0 %	0 %	386858676
25	NC_017782	TGAG	2	8	8601	8608	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017782	ATAA	2	8	9712	9719	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017782	AAGG	2	8	9736	9743	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017782	TAAT	2	8	9771	9778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017782	ATAA	2	8	9950	9957	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017782	GAAG	2	8	9996	10003	50 %	0 %	50 %	0 %	386858677
31	NC_017782	ACTA	2	8	10434	10441	50 %	25 %	0 %	25 %	386858677
32	NC_017782	TAAC	2	8	10454	10461	50 %	25 %	0 %	25 %	386858677
33	NC_017782	GAAA	2	8	10548	10555	75 %	0 %	25 %	0 %	386858677
34	NC_017782	TGAT	2	8	10727	10734	25 %	50 %	25 %	0 %	386858677
35	NC_017782	TAAA	2	8	10967	10974	75 %	25 %	0 %	0 %	386858677
36	NC_017782	TAAA	2	8	11118	11125	75 %	25 %	0 %	0 %	386858677
37	NC_017782	TTTA	2	8	11175	11182	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017782	AAAG	2	8	11273	11280	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017782	TTAC	2	8	11311	11318	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017782	ATTT	2	8	11415	11422	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017782	AACA	2	8	11474	11481	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017782	ATTC	2	8	11499	11506	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.