MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 137

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017781	ATG	2	6	120	125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858627
2	NC_017781	TCA	2	6	175	180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858627
3	NC_017781	AAG	2	6	234	239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858627
4	NC_017781	AGT	2	6	371	376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858627
5	NC_017781	GAA	2	6	461	466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858628
6	NC_017781	TTG	2	6	482	487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858628
7	NC_017781	AAG	2	6	489	494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858628
8	NC_017781	CTT	2	6	531	536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858628
9	NC_017781	CAA	2	6	603	608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858628
10	NC_017781	TTA	2	6	765	770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858628
11	NC_017781	AAT	2	6	773	778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858628
12	NC_017781	TGG	2	6	943	948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858629
13	NC_017781	AGA	2	6	969	974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858629
14	NC_017781	CGT	2	6	1037	1042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858629
15	NC_017781	GGT	2	6	1118	1123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858629
16	NC_017781	ACA	2	6	1130	1135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858629
17	NC_017781	AGA	2	6	1174	1179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858629
18	NC_017781	CAA	2	6	1221	1226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858629
19	NC_017781	GGT	2	6	1238	1243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858629
20	NC_017781	CTT	2	6	1586	1591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858629
21	NC_017781	TAG	2	6	1636	1641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858629
22	NC_017781	AGA	2	6	1660	1665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858629
23	NC_017781	AAT	2	6	1814	1819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858629
24	NC_017781	TGT	2	6	1825	1830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858629
25	NC_017781	ATT	2	6	1881	1886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858629
26	NC_017781	ATG	2	6	1887	1892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858629
27	NC_017781	GAT	2	6	3096	3101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858630
28	NC_017781	AAT	2	6	3120	3125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858630
29	NC_017781	TAA	2	6	3143	3148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858630
30	NC_017781	AAG	2	6	3276	3281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858630
31	NC_017781	TGC	2	6	3332	3337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858630
32	NC_017781	ACA	2	6	3497	3502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858630
33	NC_017781	GTA	2	6	3535	3540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858630
34	NC_017781	ATA	2	6	3562	3567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858630
35	NC_017781	GGT	2	6	3591	3596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858630
36	NC_017781	GTC	2	6	3771	3776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858631
37	NC_017781	TAC	2	6	3816	3821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858631
38	NC_017781	TGT	2	6	3831	3836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858631
39	NC_017781	GTT	2	6	3904	3909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858631
40	NC_017781	AGA	2	6	3916	3921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858631
41	NC_017781	AGT	3	9	3930	3938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858631
42	NC_017781	CAT	2	6	3950	3955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858631
43	NC_017781	TTC	2	6	4140	4145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858631
44	NC_017781	TTA	2	6	4203	4208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858632
45	NC_017781	ATA	2	6	4264	4269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858632
46	NC_017781	TAT	2	6	4294	4299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858632
47	NC_017781	TCG	2	6	4315	4320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858632
48	NC_017781	TAC	2	6	4332	4337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858632
49	NC_017781	AAG	2	6	4388	4393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858632
50	NC_017781	ACT	2	6	4615	4620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858632
51	NC_017781	GTT	2	6	4642	4647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858632
52	NC_017781	TGG	2	6	4686	4691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858632
53	NC_017781	TTA	2	6	4732	4737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858632
54	NC_017781	TTA	2	6	4781	4786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858632
55	NC_017781	ATA	2	6	4798	4803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858632
56	NC_017781	TAT	2	6	4923	4928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858632
57	NC_017781	CAG	2	6	4943	4948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858632
58	NC_017781	AGA	2	6	4968	4973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858632
59	NC_017781	GTT	2	6	4975	4980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858632
60	NC_017781	TAT	2	6	5515	5520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858633
61	NC_017781	TAG	2	6	5545	5550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858633
62	NC_017781	AAT	2	6	5669	5674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858633
63	NC_017781	TAT	2	6	5684	5689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858633
64	NC_017781	CAG	2	6	5755	5760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858633
65	NC_017781	GTT	2	6	5763	5768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858633
66	NC_017781	AGA	2	6	5780	5785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858633
67	NC_017781	GTT	2	6	5787	5792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858633
68	NC_017781	TAA	2	6	5875	5880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858634
69	NC_017781	ATG	2	6	5915	5920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858634
70	NC_017781	GAT	2	6	5930	5935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858634
71	NC_017781	TTG	2	6	7344	7349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858636
72	NC_017781	CTA	2	6	7380	7385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858636
73	NC_017781	ATG	2	6	7530	7535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858636
74	NC_017781	TGA	2	6	7714	7719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858636
75	NC_017781	TAG	2	6	7768	7773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858636
76	NC_017781	ATG	2	6	7779	7784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858636
77	NC_017781	CTG	2	6	8156	8161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858637
78	NC_017781	TTG	2	6	8186	8191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858637
79	NC_017781	CTA	2	6	8222	8227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858637
80	NC_017781	GTA	2	6	8312	8317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858637
81	NC_017781	CTA	2	6	8322	8327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858637
82	NC_017781	ATA	2	6	8366	8371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858637
83	NC_017781	ATG	2	6	8372	8377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858637
84	NC_017781	AAG	2	6	8611	8616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858637
85	NC_017781	CTG	3	9	8994	9002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858638
86	NC_017781	GAG	2	6	9068	9073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858638
87	NC_017781	ATT	2	6	9094	9099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858638
88	NC_017781	AGC	2	6	9142	9147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858638
89	NC_017781	TGT	2	6	9202	9207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858638
90	NC_017781	ATT	2	6	9220	9225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858638
91	NC_017781	AAT	2	6	9233	9238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858638
92	NC_017781	TGG	2	6	10838	10843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858639
93	NC_017781	TTG	2	6	10969	10974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858639
94	NC_017781	CTA	2	6	11080	11085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858639
95	NC_017781	TTG	2	6	11089	11094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858639
96	NC_017781	TTG	2	6	11209	11214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858639
97	NC_017781	AAG	2	6	11331	11336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858639
98	NC_017781	CAT	2	6	11353	11358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858639
99	NC_017781	ATA	2	6	11386	11391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858639
100	NC_017781	GAA	2	6	11428	11433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858639
101	NC_017781	CAA	2	6	11444	11449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858639
102	NC_017781	CAA	3	9	11478	11486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858639
103	NC_017781	CAA	2	6	11625	11630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858639
104	NC_017781	CAA	2	6	11634	11639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858639
105	NC_017781	ATC	2	6	11686	11691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858639
106	NC_017781	AAG	2	6	11743	11748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858639
107	NC_017781	TTC	2	6	11755	11760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858639
108	NC_017781	GAA	2	6	11766	11771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858639
109	NC_017781	TTA	2	6	11803	11808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858639
110	NC_017781	AGC	2	6	11815	11820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858639
111	NC_017781	TAA	2	6	11831	11836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858639
112	NC_017781	TAA	2	6	11870	11875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858639
113	NC_017781	GTT	2	6	11879	11884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858639
114	NC_017781	GAT	2	6	11928	11933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858639
115	NC_017781	GCT	2	6	12030	12035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858639
116	NC_017781	ATG	2	6	12109	12114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858639
117	NC_017781	TGT	2	6	12245	12250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858639
118	NC_017781	GTT	2	6	12258	12263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858639
119	NC_017781	GCA	2	6	12288	12293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858639
120	NC_017781	CTG	2	6	12301	12306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858639
121	NC_017781	GTT	2	6	12323	12328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858639
122	NC_017781	GCT	2	6	12384	12389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858639
123	NC_017781	CAA	2	6	12426	12431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858639
124	NC_017781	GAA	2	6	12513	12518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858639
125	NC_017781	TGA	2	6	12566	12571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858639
126	NC_017781	ATA	2	6	12577	12582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858639
127	NC_017781	GAG	2	6	12633	12638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858639
128	NC_017781	CAA	2	6	12687	12692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858639
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130	NC_017781	AGA	2	6	12869	12874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858639
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.