MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017780	TTTC	2	8	55	62	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017780	CAAA	3	12	116	127	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017780	AAAT	2	8	128	135	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017780	GAAT	3	12	148	159	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017780	TAGC	2	8	647	654	25 %	25 %	25 %	25 %	386859194
6	NC_017780	TATC	2	8	1415	1422	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017780	GAAA	2	8	1729	1736	75 %	0 %	25 %	0 %	386859195
8	NC_017780	TTCC	2	8	1813	1820	0 %	50 %	0 %	50 %	386859195
9	NC_017780	TTTC	2	8	1971	1978	0 %	75 %	0 %	25 %	386859195
10	NC_017780	ATCA	2	8	4032	4039	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017780	TAAG	2	8	4217	4224	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017780	CAAT	2	8	4314	4321	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017780	TCAT	2	8	4367	4374	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017780	TTAC	2	8	4454	4461	25 %	50 %	0 %	25 %	386859196
15	NC_017780	TAAG	2	8	4713	4720	50 %	25 %	25 %	0 %	386859196
16	NC_017780	ATTT	2	8	4914	4921	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017780	AAAT	2	8	5106	5113	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017780	AATA	2	8	5251	5258	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017780	CAAT	2	8	5279	5286	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017780	TTAT	2	8	6807	6814	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017780	TCTT	2	8	6906	6913	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017780	TGTT	2	8	6962	6969	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017780	ATTT	2	8	7146	7153	25 %	75 %	0 %	0 %	386859197
24	NC_017780	TAAA	2	8	7261	7268	75 %	25 %	0 %	0 %	386859197
25	NC_017780	CTAT	2	8	7379	7386	25 %	50 %	0 %	25 %	386859197
26	NC_017780	TCTT	2	8	8139	8146	0 %	75 %	0 %	25 %	386859198
27	NC_017780	TTAC	2	8	8167	8174	25 %	50 %	0 %	25 %	386859198
28	NC_017780	TATC	2	8	8240	8247	25 %	50 %	0 %	25 %	386859198
29	NC_017780	GTTT	2	8	8387	8394	0 %	75 %	25 %	0 %	386859199
30	NC_017780	TTTA	2	8	8807	8814	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017780	ATTT	2	8	8838	8845	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017780	TAAA	2	8	8872	8879	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017780	AAAC	2	8	10427	10434	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017780	CTTT	2	8	10802	10809	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017780	AGTA	2	8	12232	12239	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017780	AGGA	2	8	12266	12273	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017780	TCGG	2	8	12852	12859	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017780	TACG	2	8	13311	13318	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017780	TATG	2	8	13349	13356	25 %	50 %	25 %	0 %	386859200

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.