MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017779	AGA	2	6	36	41	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858653
2	NC_017779	TTG	2	6	84	89	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858653
3	NC_017779	ATT	2	6	153	158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858653
4	NC_017779	ATC	2	6	204	209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858653
5	NC_017779	ATT	2	6	243	248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858653
6	NC_017779	GAG	2	6	272	277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858653
7	NC_017779	GTT	2	6	307	312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858653
8	NC_017779	GAA	2	6	315	320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858653
9	NC_017779	TCT	2	6	382	387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858653
10	NC_017779	ATC	2	6	426	431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858653
11	NC_017779	ACA	2	6	439	444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858653
12	NC_017779	TCT	2	6	448	453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858653
13	NC_017779	ATA	2	6	700	705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858654
14	NC_017779	ATT	2	6	1000	1005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858654
15	NC_017779	ATT	2	6	1033	1038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858654
16	NC_017779	GAA	2	6	1058	1063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858654
17	NC_017779	AAG	2	6	1064	1069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858654
18	NC_017779	ATG	2	6	1097	1102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858655
19	NC_017779	AAT	2	6	1110	1115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858655
20	NC_017779	CAG	2	6	1124	1129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858655
21	NC_017779	ACT	2	6	1191	1196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858655
22	NC_017779	GTT	2	6	1473	1478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858655
23	NC_017779	GTT	2	6	1596	1601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858655
24	NC_017779	CAT	2	6	1602	1607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858655
25	NC_017779	TCT	2	6	1612	1617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858655
26	NC_017779	ATA	2	6	1685	1690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858655
27	NC_017779	AAT	2	6	1839	1844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858655
28	NC_017779	ATC	2	6	1863	1868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858655
29	NC_017779	TAT	2	6	2042	2047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858656
30	NC_017779	AAT	2	6	2152	2157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858656
31	NC_017779	AAT	2	6	2214	2219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858656
32	NC_017779	ATT	2	6	3254	3259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858657
33	NC_017779	CTC	2	6	3268	3273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858657
34	NC_017779	ATC	2	6	3295	3300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858657
35	NC_017779	TAC	2	6	3327	3332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858657
36	NC_017779	ATT	2	6	3334	3339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858657
37	NC_017779	GTT	2	6	3365	3370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858657
38	NC_017779	GTA	2	6	3463	3468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858657
39	NC_017779	AGT	2	6	3475	3480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858657
40	NC_017779	TTC	2	6	3598	3603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858657
41	NC_017779	ATT	2	6	3698	3703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858657
42	NC_017779	TCT	2	6	3713	3718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858657
43	NC_017779	TCT	2	6	3884	3889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858657
44	NC_017779	ATA	2	6	3919	3924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858657
45	NC_017779	GTA	2	6	3949	3954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858657
46	NC_017779	ATA	2	6	4037	4042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858657
47	NC_017779	TCT	2	6	4127	4132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858657
48	NC_017779	TAT	2	6	4204	4209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858657
49	NC_017779	AAG	4	12	4254	4265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858658
50	NC_017779	TAA	2	6	4338	4343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858658
51	NC_017779	TGA	2	6	4350	4355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858658
52	NC_017779	TAT	2	6	4768	4773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858658
53	NC_017779	TTA	2	6	4800	4805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858658
54	NC_017779	TTC	2	6	4846	4851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858658
55	NC_017779	ATT	2	6	4862	4867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858658
56	NC_017779	ATT	2	6	4893	4898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858658
57	NC_017779	TAG	2	6	4944	4949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858659
58	NC_017779	TGT	2	6	5026	5031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858659
59	NC_017779	CTA	2	6	5091	5096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858659
60	NC_017779	TCT	2	6	5123	5128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858659
61	NC_017779	ATG	2	6	5138	5143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858659
62	NC_017779	TCT	2	6	5153	5158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858659
63	NC_017779	CAG	2	6	5187	5192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858659
64	NC_017779	AAG	2	6	5227	5232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858659
65	NC_017779	TTA	2	6	5256	5261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858659
66	NC_017779	TAA	2	6	5272	5277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858659
67	NC_017779	CAT	2	6	5469	5474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858659
68	NC_017779	TGA	2	6	5490	5495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858659
69	NC_017779	TCA	2	6	5639	5644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858659
70	NC_017779	ACC	2	6	5683	5688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858659
71	NC_017779	AGA	2	6	5707	5712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858659
72	NC_017779	TGT	2	6	5762	5767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858659
73	NC_017779	TAT	2	6	6271	6276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858660
74	NC_017779	TTC	2	6	6392	6397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858661
75	NC_017779	ATC	2	6	6443	6448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858661
76	NC_017779	CAG	2	6	6562	6567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858662
77	NC_017779	ATC	3	9	6590	6598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858662
78	NC_017779	ATA	2	6	6712	6717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858662
79	NC_017779	GTT	2	6	6813	6818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858662
80	NC_017779	ATT	2	6	6839	6844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858662
81	NC_017779	CAA	2	6	6877	6882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858662
82	NC_017779	TAT	2	6	6934	6939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858662
83	NC_017779	ATT	2	6	7086	7091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858663
84	NC_017779	ACC	2	6	7341	7346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858663
85	NC_017779	TCT	2	6	7437	7442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858664
86	NC_017779	AGT	2	6	7451	7456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858664
87	NC_017779	AGT	2	6	7558	7563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858664
88	NC_017779	TAA	2	6	7582	7587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858664
89	NC_017779	TAT	2	6	7675	7680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858664
90	NC_017779	ATC	2	6	7710	7715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858664
91	NC_017779	TTA	2	6	7876	7881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858664
92	NC_017779	TCT	2	6	7977	7982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858664
93	NC_017779	AAT	2	6	8000	8005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858664
94	NC_017779	TCT	2	6	8049	8054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858664
95	NC_017779	ATC	2	6	8105	8110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858664
96	NC_017779	CAC	2	6	8131	8136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858664
97	NC_017779	ATT	2	6	8241	8246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858664
98	NC_017779	TAA	2	6	8456	8461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858664
99	NC_017779	TAA	2	6	8469	8474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858664
100	NC_017779	TGG	2	6	8495	8500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858664
101	NC_017779	GTA	2	6	8502	8507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858664
102	NC_017779	TAT	2	6	8558	8563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858665
103	NC_017779	TTA	2	6	8607	8612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858665
104	NC_017779	AGC	2	6	8615	8620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858665
105	NC_017779	TCA	2	6	8694	8699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858665
106	NC_017779	GAA	2	6	8700	8705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858665
107	NC_017779	ATT	2	6	8801	8806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858665
108	NC_017779	TAA	2	6	8917	8922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858665
109	NC_017779	ATA	2	6	9030	9035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858665
110	NC_017779	CAA	2	6	9207	9212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858666
111	NC_017779	TAC	2	6	9366	9371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858666

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.