MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 229

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017778	ATTTT	2	10	432	441	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017778	ACAAT	2	10	694	703	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017778	TCAAT	2	10	774	783	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017778	TAATA	2	10	1119	1128	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017778	ATTTC	2	10	1341	1350	20 %	60 %	0 %	20 %	386859045
6	NC_017778	TTTTG	2	10	1370	1379	0 %	80 %	20 %	0 %	386859045
7	NC_017778	ATTGC	2	10	1826	1835	20 %	40 %	20 %	20 %	386859045
8	NC_017778	ACCAT	2	10	3407	3416	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_017778	AATAA	2	10	4554	4563	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017778	ATTAT	2	10	4697	4706	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017778	ATGTT	2	10	4719	4728	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017778	AAATT	2	10	5708	5717	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017778	ATTTT	2	10	8537	8546	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017778	TAATT	2	10	8623	8632	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017778	TTATA	2	10	8682	8691	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017778	ATTTA	2	10	8936	8945	40 %	60 %	0 %	0 %	386859051
17	NC_017778	AAAAG	2	10	9789	9798	80 %	0 %	20 %	0 %	386859051
18	NC_017778	TTTTA	2	10	10424	10433	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017778	AATTA	2	10	10669	10678	60 %	40 %	0 %	0 %	386859052
20	NC_017778	CATTC	2	10	10833	10842	20 %	40 %	0 %	40 %	386859052
21	NC_017778	AAAAT	2	10	11247	11256	80 %	20 %	0 %	0 %	386859052
22	NC_017778	ATTTA	2	10	13056	13065	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017778	TTCCC	2	10	14699	14708	0 %	40 %	0 %	60 %	386859054
24	NC_017778	ATTTT	2	10	14835	14844	20 %	80 %	0 %	0 %	386859054
25	NC_017778	GCTAT	2	10	15030	15039	20 %	40 %	20 %	20 %	386859054
26	NC_017778	ATTTT	2	10	16261	16270	20 %	80 %	0 %	0 %	386859056
27	NC_017778	CAAAT	2	10	16816	16825	60 %	20 %	0 %	20 %	386859056
28	NC_017778	TGCTT	2	10	16991	17000	0 %	60 %	20 %	20 %	386859056
29	NC_017778	TTTAC	2	10	17264	17273	20 %	60 %	0 %	20 %	386859056
30	NC_017778	ATGCT	2	10	18604	18613	20 %	40 %	20 %	20 %	386859058
31	NC_017778	TAATA	2	10	18843	18852	60 %	40 %	0 %	0 %	386859058
32	NC_017778	CAATT	2	10	19298	19307	40 %	40 %	0 %	20 %	386859059
33	NC_017778	CTATA	2	10	21782	21791	40 %	40 %	0 %	20 %	386859061
34	NC_017778	CAATT	2	10	23116	23125	40 %	40 %	0 %	20 %	386859062
35	NC_017778	AACCA	2	10	30855	30864	60 %	0 %	0 %	40 %	386859065
36	NC_017778	AATTT	2	10	30997	31006	40 %	60 %	0 %	0 %	386859065
37	NC_017778	AATCA	2	10	31976	31985	60 %	20 %	0 %	20 %	386859066
38	NC_017778	ATTTA	2	10	32423	32432	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017778	TTTCT	2	10	32788	32797	0 %	80 %	0 %	20 %	386859067
40	NC_017778	CTTCT	2	10	32970	32979	0 %	60 %	0 %	40 %	386859067
41	NC_017778	TGCTT	2	10	32983	32992	0 %	60 %	20 %	20 %	386859067
42	NC_017778	TTTCT	2	10	34224	34233	0 %	80 %	0 %	20 %	386859068
43	NC_017778	CTTCT	2	10	34406	34415	0 %	60 %	0 %	40 %	386859068
44	NC_017778	TGCTT	2	10	34419	34428	0 %	60 %	20 %	20 %	386859068
45	NC_017778	CTTCT	2	10	36262	36271	0 %	60 %	0 %	40 %	386859069
46	NC_017778	CCTCT	2	10	36506	36515	0 %	40 %	0 %	60 %	386859069
47	NC_017778	CTTCT	2	10	38140	38149	0 %	60 %	0 %	40 %	386859070
48	NC_017778	CTTCT	2	10	40679	40688	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_017778	AATAA	2	10	40797	40806	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017778	ATTTA	2	10	41765	41774	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017778	TTTCT	2	10	42113	42122	0 %	80 %	0 %	20 %	386859071
52	NC_017778	CTTCT	2	10	42283	42292	0 %	60 %	0 %	40 %	386859071
53	NC_017778	AAATA	2	10	43194	43203	80 %	20 %	0 %	0 %	386859072
54	NC_017778	ATTTA	2	10	43247	43256	40 %	60 %	0 %	0 %	386859072
55	NC_017778	TAATA	2	10	43354	43363	60 %	40 %	0 %	0 %	386859072
56	NC_017778	TTAAT	2	10	43735	43744	40 %	60 %	0 %	0 %	386859073
57	NC_017778	ATTTT	2	10	43793	43802	20 %	80 %	0 %	0 %	386859073
58	NC_017778	AAATC	2	10	43985	43994	60 %	20 %	0 %	20 %	386859073
59	NC_017778	TTTAA	2	10	45672	45681	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017778	ATATA	2	10	45937	45946	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017778	TTAAA	2	10	46476	46485	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017778	TTTCA	2	10	49507	49516	20 %	60 %	0 %	20 %	386859077
63	NC_017778	TAAAA	2	10	49527	49536	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017778	TATAT	2	10	49575	49584	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017778	ATAAA	2	10	49701	49710	80 %	20 %	0 %	0 %	386859078
66	NC_017778	AAATA	2	10	50236	50245	80 %	20 %	0 %	0 %	386859078
67	NC_017778	TAAAA	2	10	50419	50428	80 %	20 %	0 %	0 %	386859078
68	NC_017778	AAATA	2	10	51529	51538	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017778	AAATA	2	10	52230	52239	80 %	20 %	0 %	0 %	386859079
70	NC_017778	AAACA	2	10	52990	52999	80 %	0 %	0 %	20 %	386859079
71	NC_017778	AAATA	2	10	55062	55071	80 %	20 %	0 %	0 %	386859080
72	NC_017778	ATTTA	2	10	57502	57511	40 %	60 %	0 %	0 %	386859082
73	NC_017778	ATTTT	2	10	57543	57552	20 %	80 %	0 %	0 %	386859082
74	NC_017778	AATTA	2	10	58137	58146	60 %	40 %	0 %	0 %	386859083
75	NC_017778	ATTAT	2	10	58707	58716	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017778	AAATT	2	10	59478	59487	60 %	40 %	0 %	0 %	386859084
77	NC_017778	CTATT	2	10	59767	59776	20 %	60 %	0 %	20 %	386859084
78	NC_017778	AACAA	2	10	59871	59880	80 %	0 %	0 %	20 %	386859084
79	NC_017778	AATTT	2	10	62907	62916	40 %	60 %	0 %	0 %	386859087
80	NC_017778	ATGTA	2	10	63818	63827	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017778	ATTTC	2	10	64335	64344	20 %	60 %	0 %	20 %	386859088
82	NC_017778	TTTAA	2	10	65026	65035	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017778	TCTCT	2	10	65298	65307	0 %	60 %	0 %	40 %	386859090
84	NC_017778	AAATC	2	10	65664	65673	60 %	20 %	0 %	20 %	386859090
85	NC_017778	TTACA	2	10	65979	65988	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017778	ATATA	2	10	66095	66104	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017778	AATAT	2	10	67151	67160	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017778	AATTT	2	10	67913	67922	40 %	60 %	0 %	0 %	386859092
89	NC_017778	AACAT	2	10	68448	68457	60 %	20 %	0 %	20 %	386859092
90	NC_017778	TTAAA	2	10	68492	68501	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017778	TAAAA	2	10	68596	68605	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017778	GTATG	2	10	70239	70248	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017778	AAATG	2	10	71054	71063	60 %	20 %	20 %	0 %	386859094
94	NC_017778	AAAAT	2	10	72335	72344	80 %	20 %	0 %	0 %	386859095
95	NC_017778	TAAAG	2	10	72371	72380	60 %	20 %	20 %	0 %	386859095
96	NC_017778	TAATA	2	10	74261	74270	60 %	40 %	0 %	0 %	386859097
97	NC_017778	CTTTT	2	10	77383	77392	0 %	80 %	0 %	20 %	386859099
98	NC_017778	AAGTA	2	10	78176	78185	60 %	20 %	20 %	0 %	386859100
99	NC_017778	ATATT	2	10	78698	78707	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017778	ATTAA	2	10	78730	78739	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017778	TAATT	2	10	78756	78765	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017778	CATAT	2	10	79341	79350	40 %	40 %	0 %	20 %	386859101
103	NC_017778	TAAAA	2	10	80539	80548	80 %	20 %	0 %	0 %	386859102
104	NC_017778	AAACT	2	10	81391	81400	60 %	20 %	0 %	20 %	386859104
105	NC_017778	TAAAC	2	10	81442	81451	60 %	20 %	0 %	20 %	386859104
106	NC_017778	ATATT	2	10	81839	81848	40 %	60 %	0 %	0 %	386859104
107	NC_017778	ATACC	2	10	82423	82432	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
108	NC_017778	CAAAA	2	10	85995	86004	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_017778	TTATA	2	10	86053	86062	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017778	TAATA	2	10	86065	86074	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017778	TATAA	2	10	86085	86094	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017778	AATGA	2	10	86606	86615	60 %	20 %	20 %	0 %	386859108
113	NC_017778	TAGCA	2	10	87266	87275	40 %	20 %	20 %	20 %	386859109
114	NC_017778	AAATA	2	10	88275	88284	80 %	20 %	0 %	0 %	386859109
115	NC_017778	TATAA	2	10	88382	88391	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017778	ATCAC	2	10	88419	88428	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_017778	AAAAT	2	10	89129	89138	80 %	20 %	0 %	0 %	386859110
118	NC_017778	AAGAT	2	10	89391	89400	60 %	20 %	20 %	0 %	386859110
119	NC_017778	ACATA	2	10	89410	89419	60 %	20 %	0 %	20 %	386859110
120	NC_017778	ATATG	2	10	89869	89878	40 %	40 %	20 %	0 %	386859111
121	NC_017778	TAAAT	2	10	89889	89898	60 %	40 %	0 %	0 %	386859111
122	NC_017778	AAATA	2	10	90570	90579	80 %	20 %	0 %	0 %	386859112
123	NC_017778	TGAAT	2	10	90832	90841	40 %	40 %	20 %	0 %	386859112
124	NC_017778	ATATC	2	10	90955	90964	40 %	40 %	0 %	20 %	386859112
125	NC_017778	TTTCA	2	10	91131	91140	20 %	60 %	0 %	20 %	386859112
126	NC_017778	TGAAT	2	10	91607	91616	40 %	40 %	20 %	0 %	386859113
127	NC_017778	AATAT	2	10	91998	92007	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017778	TATTT	2	10	95693	95702	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017778	CAAAA	2	10	96030	96039	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017778	ATTTA	2	10	96879	96888	40 %	60 %	0 %	0 %	386859116
131	NC_017778	ATTAA	2	10	97275	97284	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017778	AATTT	2	10	100106	100115	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017778	ATTAA	2	10	100723	100732	60 %	40 %	0 %	0 %	386859120
134	NC_017778	AATAA	2	10	100796	100805	80 %	20 %	0 %	0 %	386859120
135	NC_017778	ACTTC	2	10	101817	101826	20 %	40 %	0 %	40 %	386859121
136	NC_017778	ATTTT	2	10	102012	102021	20 %	80 %	0 %	0 %	386859121
137	NC_017778	ATCTG	2	10	102720	102729	20 %	40 %	20 %	20 %	386859121
138	NC_017778	ATTAA	2	10	103498	103507	60 %	40 %	0 %	0 %	386859122
139	NC_017778	GAAAC	2	10	104064	104073	60 %	0 %	20 %	20 %	386859123
140	NC_017778	ATCAT	2	10	104164	104173	40 %	40 %	0 %	20 %	386859123
141	NC_017778	ATTTA	2	10	104946	104955	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.