MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 154

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017778	ATTTC	2	10	1341	1350	20 %	60 %	0 %	20 %	386859045
2	NC_017778	TTTTG	2	10	1370	1379	0 %	80 %	20 %	0 %	386859045
3	NC_017778	ATTGC	2	10	1826	1835	20 %	40 %	20 %	20 %	386859045
4	NC_017778	ATTTA	2	10	8936	8945	40 %	60 %	0 %	0 %	386859051
5	NC_017778	AAAAG	2	10	9789	9798	80 %	0 %	20 %	0 %	386859051
6	NC_017778	AATTA	2	10	10669	10678	60 %	40 %	0 %	0 %	386859052
7	NC_017778	CATTC	2	10	10833	10842	20 %	40 %	0 %	40 %	386859052
8	NC_017778	AAAAT	2	10	11247	11256	80 %	20 %	0 %	0 %	386859052
9	NC_017778	TTCCC	2	10	14699	14708	0 %	40 %	0 %	60 %	386859054
10	NC_017778	ATTTT	2	10	14835	14844	20 %	80 %	0 %	0 %	386859054
11	NC_017778	GCTAT	2	10	15030	15039	20 %	40 %	20 %	20 %	386859054
12	NC_017778	ATTTT	2	10	16261	16270	20 %	80 %	0 %	0 %	386859056
13	NC_017778	CAAAT	2	10	16816	16825	60 %	20 %	0 %	20 %	386859056
14	NC_017778	TGCTT	2	10	16991	17000	0 %	60 %	20 %	20 %	386859056
15	NC_017778	TTTAC	2	10	17264	17273	20 %	60 %	0 %	20 %	386859056
16	NC_017778	ATGCT	2	10	18604	18613	20 %	40 %	20 %	20 %	386859058
17	NC_017778	TAATA	2	10	18843	18852	60 %	40 %	0 %	0 %	386859058
18	NC_017778	CAATT	2	10	19298	19307	40 %	40 %	0 %	20 %	386859059
19	NC_017778	CTATA	2	10	21782	21791	40 %	40 %	0 %	20 %	386859061
20	NC_017778	CAATT	2	10	23116	23125	40 %	40 %	0 %	20 %	386859062
21	NC_017778	AACCA	2	10	30855	30864	60 %	0 %	0 %	40 %	386859065
22	NC_017778	AATTT	2	10	30997	31006	40 %	60 %	0 %	0 %	386859065
23	NC_017778	AATCA	2	10	31976	31985	60 %	20 %	0 %	20 %	386859066
24	NC_017778	TTTCT	2	10	32788	32797	0 %	80 %	0 %	20 %	386859067
25	NC_017778	CTTCT	2	10	32970	32979	0 %	60 %	0 %	40 %	386859067
26	NC_017778	TGCTT	2	10	32983	32992	0 %	60 %	20 %	20 %	386859067
27	NC_017778	TTTCT	2	10	34224	34233	0 %	80 %	0 %	20 %	386859068
28	NC_017778	CTTCT	2	10	34406	34415	0 %	60 %	0 %	40 %	386859068
29	NC_017778	TGCTT	2	10	34419	34428	0 %	60 %	20 %	20 %	386859068
30	NC_017778	CTTCT	2	10	36262	36271	0 %	60 %	0 %	40 %	386859069
31	NC_017778	CCTCT	2	10	36506	36515	0 %	40 %	0 %	60 %	386859069
32	NC_017778	CTTCT	2	10	38140	38149	0 %	60 %	0 %	40 %	386859070
33	NC_017778	TTTCT	2	10	42113	42122	0 %	80 %	0 %	20 %	386859071
34	NC_017778	CTTCT	2	10	42283	42292	0 %	60 %	0 %	40 %	386859071
35	NC_017778	AAATA	2	10	43194	43203	80 %	20 %	0 %	0 %	386859072
36	NC_017778	ATTTA	2	10	43247	43256	40 %	60 %	0 %	0 %	386859072
37	NC_017778	TAATA	2	10	43354	43363	60 %	40 %	0 %	0 %	386859072
38	NC_017778	TTAAT	2	10	43735	43744	40 %	60 %	0 %	0 %	386859073
39	NC_017778	ATTTT	2	10	43793	43802	20 %	80 %	0 %	0 %	386859073
40	NC_017778	AAATC	2	10	43985	43994	60 %	20 %	0 %	20 %	386859073
41	NC_017778	TTTCA	2	10	49507	49516	20 %	60 %	0 %	20 %	386859077
42	NC_017778	ATAAA	2	10	49701	49710	80 %	20 %	0 %	0 %	386859078
43	NC_017778	AAATA	2	10	50236	50245	80 %	20 %	0 %	0 %	386859078
44	NC_017778	TAAAA	2	10	50419	50428	80 %	20 %	0 %	0 %	386859078
45	NC_017778	AAATA	2	10	52230	52239	80 %	20 %	0 %	0 %	386859079
46	NC_017778	AAACA	2	10	52990	52999	80 %	0 %	0 %	20 %	386859079
47	NC_017778	AAATA	2	10	55062	55071	80 %	20 %	0 %	0 %	386859080
48	NC_017778	ATTTA	2	10	57502	57511	40 %	60 %	0 %	0 %	386859082
49	NC_017778	ATTTT	2	10	57543	57552	20 %	80 %	0 %	0 %	386859082
50	NC_017778	AATTA	2	10	58137	58146	60 %	40 %	0 %	0 %	386859083
51	NC_017778	AAATT	2	10	59478	59487	60 %	40 %	0 %	0 %	386859084
52	NC_017778	CTATT	2	10	59767	59776	20 %	60 %	0 %	20 %	386859084
53	NC_017778	AACAA	2	10	59871	59880	80 %	0 %	0 %	20 %	386859084
54	NC_017778	AATTT	2	10	62907	62916	40 %	60 %	0 %	0 %	386859087
55	NC_017778	ATTTC	2	10	64335	64344	20 %	60 %	0 %	20 %	386859088
56	NC_017778	TCTCT	2	10	65298	65307	0 %	60 %	0 %	40 %	386859090
57	NC_017778	AAATC	2	10	65664	65673	60 %	20 %	0 %	20 %	386859090
58	NC_017778	AATTT	2	10	67913	67922	40 %	60 %	0 %	0 %	386859092
59	NC_017778	AACAT	2	10	68448	68457	60 %	20 %	0 %	20 %	386859092
60	NC_017778	AAATG	2	10	71054	71063	60 %	20 %	20 %	0 %	386859094
61	NC_017778	AAAAT	2	10	72335	72344	80 %	20 %	0 %	0 %	386859095
62	NC_017778	TAAAG	2	10	72371	72380	60 %	20 %	20 %	0 %	386859095
63	NC_017778	TAATA	2	10	74261	74270	60 %	40 %	0 %	0 %	386859097
64	NC_017778	CTTTT	2	10	77383	77392	0 %	80 %	0 %	20 %	386859099
65	NC_017778	AAGTA	2	10	78176	78185	60 %	20 %	20 %	0 %	386859100
66	NC_017778	CATAT	2	10	79341	79350	40 %	40 %	0 %	20 %	386859101
67	NC_017778	TAAAA	2	10	80539	80548	80 %	20 %	0 %	0 %	386859102
68	NC_017778	AAACT	2	10	81391	81400	60 %	20 %	0 %	20 %	386859104
69	NC_017778	TAAAC	2	10	81442	81451	60 %	20 %	0 %	20 %	386859104
70	NC_017778	ATATT	2	10	81839	81848	40 %	60 %	0 %	0 %	386859104
71	NC_017778	AATGA	2	10	86606	86615	60 %	20 %	20 %	0 %	386859108
72	NC_017778	TAGCA	2	10	87266	87275	40 %	20 %	20 %	20 %	386859109
73	NC_017778	AAATA	2	10	88275	88284	80 %	20 %	0 %	0 %	386859109
74	NC_017778	AAAAT	2	10	89129	89138	80 %	20 %	0 %	0 %	386859110
75	NC_017778	AAGAT	2	10	89391	89400	60 %	20 %	20 %	0 %	386859110
76	NC_017778	ACATA	2	10	89410	89419	60 %	20 %	0 %	20 %	386859110
77	NC_017778	ATATG	2	10	89869	89878	40 %	40 %	20 %	0 %	386859111
78	NC_017778	TAAAT	2	10	89889	89898	60 %	40 %	0 %	0 %	386859111
79	NC_017778	AAATA	2	10	90570	90579	80 %	20 %	0 %	0 %	386859112
80	NC_017778	TGAAT	2	10	90832	90841	40 %	40 %	20 %	0 %	386859112
81	NC_017778	ATATC	2	10	90955	90964	40 %	40 %	0 %	20 %	386859112
82	NC_017778	TTTCA	2	10	91131	91140	20 %	60 %	0 %	20 %	386859112
83	NC_017778	TGAAT	2	10	91607	91616	40 %	40 %	20 %	0 %	386859113
84	NC_017778	ATTTA	2	10	96879	96888	40 %	60 %	0 %	0 %	386859116
85	NC_017778	ATTAA	2	10	100723	100732	60 %	40 %	0 %	0 %	386859120
86	NC_017778	AATAA	2	10	100796	100805	80 %	20 %	0 %	0 %	386859120
87	NC_017778	ACTTC	2	10	101817	101826	20 %	40 %	0 %	40 %	386859121
88	NC_017778	ATTTT	2	10	102012	102021	20 %	80 %	0 %	0 %	386859121
89	NC_017778	ATCTG	2	10	102720	102729	20 %	40 %	20 %	20 %	386859121
90	NC_017778	ATTAA	2	10	103498	103507	60 %	40 %	0 %	0 %	386859122
91	NC_017778	GAAAC	2	10	104064	104073	60 %	0 %	20 %	20 %	386859123
92	NC_017778	ATCAT	2	10	104164	104173	40 %	40 %	0 %	20 %	386859123
93	NC_017778	ATTTA	2	10	105553	105562	40 %	60 %	0 %	0 %	386859124
94	NC_017778	AGACA	2	10	105787	105796	60 %	0 %	20 %	20 %	386859124
95	NC_017778	ATCGT	2	10	106262	106271	20 %	40 %	20 %	20 %	386859125
96	NC_017778	TTAAA	2	10	106683	106692	60 %	40 %	0 %	0 %	386859125
97	NC_017778	TCTTG	2	10	109877	109886	0 %	60 %	20 %	20 %	386859129
98	NC_017778	AAAAT	2	10	110676	110685	80 %	20 %	0 %	0 %	386859129
99	NC_017778	TCTTT	2	10	111869	111878	0 %	80 %	0 %	20 %	386859131
100	NC_017778	AATTA	2	10	112443	112452	60 %	40 %	0 %	0 %	386859131
101	NC_017778	CTTGA	2	10	113400	113409	20 %	40 %	20 %	20 %	386859133
102	NC_017778	TAAAT	2	10	113752	113761	60 %	40 %	0 %	0 %	386859134
103	NC_017778	AACAC	2	10	113983	113992	60 %	0 %	0 %	40 %	386859135
104	NC_017778	GTAAT	2	10	114410	114419	40 %	40 %	20 %	0 %	386859135
105	NC_017778	TATTT	2	10	115059	115068	20 %	80 %	0 %	0 %	386859136
106	NC_017778	AAAAG	2	10	115340	115349	80 %	0 %	20 %	0 %	386859136
107	NC_017778	AAGAT	2	10	115449	115458	60 %	20 %	20 %	0 %	386859136
108	NC_017778	AATAA	2	10	116206	116215	80 %	20 %	0 %	0 %	386859138
109	NC_017778	AAATT	2	10	116303	116312	60 %	40 %	0 %	0 %	386859138
110	NC_017778	TAAAA	2	10	119263	119272	80 %	20 %	0 %	0 %	386859142
111	NC_017778	TAATT	2	10	119688	119697	40 %	60 %	0 %	0 %	386859142
112	NC_017778	CAACA	2	10	121780	121789	60 %	0 %	0 %	40 %	386859144
113	NC_017778	TCATA	2	10	122321	122330	40 %	40 %	0 %	20 %	386859145
114	NC_017778	TATAT	2	10	123908	123917	40 %	60 %	0 %	0 %	386859146
115	NC_017778	AACAA	2	10	124542	124551	80 %	0 %	0 %	20 %	386859147
116	NC_017778	ATAAA	2	10	126341	126350	80 %	20 %	0 %	0 %	386859148
117	NC_017778	AAACA	2	10	126490	126499	80 %	0 %	0 %	20 %	386859148
118	NC_017778	AACAA	2	10	127058	127067	80 %	0 %	0 %	20 %	386859148
119	NC_017778	TAAAT	2	10	128838	128847	60 %	40 %	0 %	0 %	386859149
120	NC_017778	TTCAA	2	10	129250	129259	40 %	40 %	0 %	20 %	386859150
121	NC_017778	TAAAT	2	10	130397	130406	60 %	40 %	0 %	0 %	386859151
122	NC_017778	TGTAC	2	10	134723	134732	20 %	40 %	20 %	20 %	386859154
123	NC_017778	AATTA	2	10	135295	135304	60 %	40 %	0 %	0 %	386859154
124	NC_017778	TAATA	2	10	136135	136144	60 %	40 %	0 %	0 %	386859155
125	NC_017778	ATAAA	2	10	137305	137314	80 %	20 %	0 %	0 %	386859158
126	NC_017778	TCTCT	2	10	137475	137484	0 %	60 %	0 %	40 %	386859158
127	NC_017778	AATAA	2	10	137574	137583	80 %	20 %	0 %	0 %	386859158
128	NC_017778	CTTCT	2	10	137758	137767	0 %	60 %	0 %	40 %	386859158
129	NC_017778	TAAAA	2	10	137891	137900	80 %	20 %	0 %	0 %	386859158
130	NC_017778	AAAAT	2	10	138639	138648	80 %	20 %	0 %	0 %	386859159
131	NC_017778	TAAAA	2	10	138955	138964	80 %	20 %	0 %	0 %	386859159
132	NC_017778	CAAAA	2	10	140005	140014	80 %	0 %	0 %	20 %	386859160
133	NC_017778	AAAAT	2	10	140150	140159	80 %	20 %	0 %	0 %	386859160
134	NC_017778	TTTAA	2	10	141925	141934	40 %	60 %	0 %	0 %	386859162
135	NC_017778	TTCAT	2	10	141955	141964	20 %	60 %	0 %	20 %	386859162
136	NC_017778	ATCCC	2	10	145591	145600	20 %	20 %	0 %	60 %	386859166
137	NC_017778	TCTTT	2	10	145918	145927	0 %	80 %	0 %	20 %	386859166
138	NC_017778	ATTGT	2	10	147957	147966	20 %	60 %	20 %	0 %	386859170
139	NC_017778	ATATT	2	10	150326	150335	40 %	60 %	0 %	0 %	386859172
140	NC_017778	GCAAA	2	10	152488	152497	60 %	0 %	20 %	20 %	386859175
141	NC_017778	TGTTT	2	10	154344	154353	0 %	80 %	20 %	0 %	386859176
142	NC_017778	TAATT	2	10	156787	156796	40 %	60 %	0 %	0 %	386859179
143	NC_017778	TTCAT	2	10	157177	157186	20 %	60 %	0 %	20 %	386859179
144	NC_017778	ATTTA	2	10	159616	159625	40 %	60 %	0 %	0 %	386859181
145	NC_017778	CAGAA	2	10	160932	160941	60 %	0 %	20 %	20 %	386859181
146	NC_017778	GAAGA	2	10	161979	161988	60 %	0 %	40 %	0 %	386859182
147	NC_017778	TTATC	2	10	165614	165623	20 %	60 %	0 %	20 %	386859184
148	NC_017778	ATTTT	2	10	165718	165727	20 %	80 %	0 %	0 %	386859184
149	NC_017778	TTATG	2	10	166376	166385	20 %	60 %	20 %	0 %	386859185
150	NC_017778	TGTAG	2	10	169613	169622	20 %	40 %	40 %	0 %	386859188
151	NC_017778	GTTTT	2	10	170425	170434	0 %	80 %	20 %	0 %	386859188
152	NC_017778	AAATT	2	10	170611	170620	60 %	40 %	0 %	0 %	386859189
153	NC_017778	ATTTA	2	10	172619	172628	40 %	60 %	0 %	0 %	386859191
154	NC_017778	GAAGA	2	10	173025	173034	60 %	0 %	40 %	0 %	386859191

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.