MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 219

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017778	ATAA	2	8	62	69	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017778	AAAT	2	8	492	499	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017778	CTTC	2	8	664	671	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017778	ATTT	2	8	789	796	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017778	AATT	2	8	821	828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017778	CTAT	2	8	948	955	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017778	AATT	2	8	3139	3146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017778	AAAT	2	8	4601	4608	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017778	TAAT	2	8	5657	5664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017778	ATAA	2	8	5672	5679	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017778	TATT	2	8	7881	7888	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017778	GGCT	2	8	8024	8031	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017778	ATTT	2	8	8081	8088	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017778	AAAT	2	8	8343	8350	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017778	TAAA	2	8	8482	8489	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017778	TATT	2	8	8721	8728	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017778	ATTA	2	8	10257	10264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017778	TCCT	2	8	11295	11302	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017778	ATTT	2	8	11432	11439	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017778	TTAT	2	8	11538	11545	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017778	TATC	2	8	17357	17364	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017778	ATTA	2	8	18917	18924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017778	AATT	2	8	19092	19099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017778	AATA	2	8	20351	20358	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017778	TAAT	2	8	20415	20422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017778	AATT	2	8	20427	20434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017778	AATA	2	8	21575	21582	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017778	TAAT	2	8	21639	21646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017778	ATTA	2	8	22764	22771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017778	ATCA	2	8	23831	23838	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017778	ATTT	2	8	23846	23853	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017778	TTAA	2	8	23868	23875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017778	TTAA	2	8	23888	23895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017778	ATTG	2	8	29593	29600	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017778	ATTT	2	8	30464	30471	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017778	TAAT	2	8	30494	30501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017778	TTCT	2	8	33623	33630	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017778	TCTT	2	8	36569	36576	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017778	TTAA	2	8	42668	42675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017778	TAAT	2	8	43584	43591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017778	TCCT	2	8	44543	44550	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017778	TTAA	2	8	44608	44615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017778	GACA	2	8	45717	45724	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017778	TAAT	2	8	45858	45865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017778	CAGA	2	8	46437	46444	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017778	ATCT	2	8	46457	46464	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017778	TTAA	2	8	55406	55413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017778	ATTA	2	8	55462	55469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017778	ATTA	2	8	55493	55500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017778	TTAA	2	8	55578	55585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017778	AATT	2	8	55694	55701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017778	ATCT	2	8	58800	58807	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017778	TTAT	3	12	58879	58890	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017778	TTAA	2	8	60035	60042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017778	ATTA	2	8	60048	60055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017778	TAAT	2	8	60105	60112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017778	TAAA	2	8	61159	61166	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017778	ATTT	2	8	61307	61314	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017778	TCTA	2	8	61358	61365	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017778	TTAT	2	8	61472	61479	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017778	ACAA	2	8	61489	61496	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017778	ATTT	2	8	62687	62694	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017778	ATTA	2	8	62749	62756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017778	ATAA	2	8	62794	62801	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017778	ACAT	2	8	63884	63891	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017778	ATTA	2	8	63926	63933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017778	TAAT	2	8	63946	63953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017778	TATT	2	8	64893	64900	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017778	ATAA	2	8	64946	64953	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017778	CTTT	2	8	65953	65960	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017778	TAAT	2	8	66108	66115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017778	TAAT	2	8	66121	66128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017778	ATTA	3	12	66214	66225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017778	TGAA	2	8	67527	67534	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017778	TAAA	2	8	67564	67571	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017778	GCAT	2	8	68549	68556	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017778	ATTA	2	8	68621	68628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017778	ATTA	2	8	68668	68675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017778	ATTA	2	8	69799	69806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017778	TTTA	2	8	69883	69890	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017778	ATTT	2	8	70121	70128	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017778	CAAT	2	8	71184	71191	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017778	TAAT	2	8	71284	71291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017778	AAAT	2	8	71320	71327	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017778	TTTA	2	8	71330	71337	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017778	TTAT	2	8	71338	71345	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017778	ATTA	2	8	71458	71465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017778	CTAA	2	8	72512	72519	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017778	ATAA	2	8	72589	72596	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017778	ATTT	2	8	73605	73612	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017778	TTAA	2	8	73625	73632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017778	CATT	2	8	76341	76348	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017778	TTGT	2	8	76433	76440	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017778	TAAA	2	8	76656	76663	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017778	TAAT	2	8	76684	76691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017778	AATA	2	8	77730	77737	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017778	AAAT	2	8	77763	77770	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017778	CCCT	2	8	79653	79660	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
99	NC_017778	AATT	2	8	82357	82364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017778	ATAA	2	8	82439	82446	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017778	ACCA	2	8	85106	85113	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017778	AATA	2	8	86221	86228	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017778	AACA	2	8	87200	87207	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017778	TCCT	2	8	88311	88318	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017778	TATT	2	8	88395	88402	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017778	TACA	2	8	91201	91208	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017778	AATT	2	8	91217	91224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017778	CTAT	2	8	91947	91954	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017778	AAAT	2	8	95251	95258	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017778	CATG	2	8	95286	95293	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017778	TAAA	2	8	95395	95402	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017778	TCTA	2	8	95430	95437	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017778	AAAT	2	8	95444	95451	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017778	TTAA	2	8	95581	95588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017778	AAAC	2	8	95745	95752	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017778	TCAT	2	8	95847	95854	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017778	ATCA	2	8	95862	95869	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017778	AATT	2	8	95986	95993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017778	ATCT	2	8	96022	96029	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017778	TCTA	2	8	96303	96310	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017778	TTTA	2	8	97145	97152	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017778	AACC	2	8	97181	97188	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017778	CAAA	3	12	98080	98091	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017778	TCAA	2	8	99231	99238	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017778	CAAA	2	8	100230	100237	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017778	CAAT	2	8	100305	100312	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017778	TTAA	2	8	104659	104666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017778	AAAC	2	8	104714	104721	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017778	CAAA	2	8	106017	106024	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017778	AATT	3	12	107806	107817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017778	GAAA	2	8	107902	107909	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017778	CCTA	2	8	108573	108580	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017778	AATC	2	8	109555	109562	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017778	AATC	2	8	109622	109629	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017778	TAAA	2	8	110730	110737	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017778	ATAA	2	8	111342	111349	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017778	AATA	2	8	111350	111357	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017778	ATTT	2	8	115044	115051	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017778	ATTT	2	8	117361	117368	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017778	ATTA	2	8	119840	119847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017778	ATCA	2	8	119888	119895	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017778	TAAA	2	8	119955	119962	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017778	ATAA	2	8	119992	119999	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017778	GTAA	2	8	120028	120035	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017778	TAAA	2	8	121392	121399	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017778	AATT	2	8	121432	121439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017778	AATA	2	8	121461	121468	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017778	TAAT	2	8	121548	121555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017778	TAAA	2	8	121657	121664	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017778	TTAA	2	8	122821	122828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017778	TAAA	2	8	122844	122851	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017778	AACA	2	8	124354	124361	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_017778	TATT	2	8	125412	125419	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017778	AAAT	2	8	125557	125564	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.